基于芯片數(shù)據(jù)的肺動脈高壓特征基因分析
發(fā)布時間:2017-06-10 13:00
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【摘要】:目的分析肺動脈高壓(PAH)肺組織來源的表達譜基因芯片數(shù)據(jù),研究差異表達基因。方法檢索基因表達譜匯編數(shù)據(jù)庫中GSE15197數(shù)據(jù)。用非監(jiān)督性聚類、監(jiān)督性分類、主成分分析的方法得到可以將PAH肺組織樣本與正常對照區(qū)分開的顯著差異的特征基因。用基因功能注釋分析和蛋白間關聯(lián)分析方法描述PAH特征基因的功能及涉及的相關信號通路。結果與正常對照相比,PAH肺組織表達顯著差異特征基因有167個,功能上主要涉及蛋白的乙;、磷酸化等生物學術語,且存在著相互關聯(lián)作用。結論 PAH差異表達特征基因及其功能注釋不僅為深入研究疾病發(fā)生發(fā)展機制提供重要線索,也為有效診斷和治療疾病提供必要理論基礎。
【作者單位】: 首都醫(yī)科大學附屬北京朝陽醫(yī)院檢驗科;北京市呼吸和肺循環(huán)疾病重點實驗室;
【關鍵詞】: 肺動脈高壓 差異表達基因 芯片數(shù)據(jù)
【基金】:國家自然科學基金項目(編號:81300044,81200042,81270117,81570049) 北京市自然科學基金面上項目(編號:7162069,7152062) 北京市醫(yī)管局“青苗”計劃(編號:QML20160301) 北京市呼吸和肺循環(huán)疾病重點實驗室開放課題(編號:2014HXFB03) 北京市科技新星計劃(編號:Z121107002512021)
【分類號】:R544.1;R440
【正文快照】: 肺動脈高壓(pulmonary arteria hypertension,PAH)是以肺血管阻力進行性升高和右心功能進行性衰竭為主要特征的臨床綜合征,肺動脈高壓是一種復雜的、涉及多學科的疾病,雖然對它的研究已有100多年,但其發(fā)病機制尚未完全清楚,可能與缺氧、神經體液、先天性、遺傳等多種因素有關[
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1 沈敏;張p,
本文編號:438520
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