本文關(guān)鍵詞：全基因測(cè)序分析耐甲氧西林金黃色葡萄球菌利奈唑胺耐藥相關(guān)變異位點(diǎn)，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：目的通過(guò)全基因組測(cè)序研究利奈唑胺(LZD)敏感株和誘導(dǎo)耐藥耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(MRSA)之間基因變異位點(diǎn)差異,了解LZD耐藥基因變異位點(diǎn)。方法采用不同濃度梯度的LZD對(duì)遺傳背景清晰的MRSA-MS4母株進(jìn)行誘導(dǎo),獲得LZD耐藥菌株MRSA-MS4-LZD100,測(cè)定最低抑菌濃度(MIC),采用普通聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)擴(kuò)增MRSA-MS4-LZD100 23S rRNA V區(qū)及核糖體蛋白L3/L4基因,測(cè)序后與野生株比較,獲得相應(yīng)的突變位點(diǎn);采用Illumina HiSeq 2000測(cè)序技術(shù)對(duì)樣品DNA進(jìn)行paired-end(PE)測(cè)序,構(gòu)建Illumina PE文庫(kù),利用生物信息學(xué)完成該菌株的全基因組測(cè)序。結(jié)果經(jīng)過(guò)32代誘導(dǎo),獲得MRSA-MS4-LZD100菌株,其LZD MIC為96μg/mL。PCR測(cè)序分析提示其V區(qū)多拷貝基因均存在G2447T突變,L3蛋白存在Gly113Val突變;全基因組包含2 744 315 bp堿基對(duì),注釋后共有2 509個(gè)基因,11個(gè)tRNA編碼基因,以及2個(gè)完整的rRNA基因編碼操縱子,獲得PubMed全基因序列號(hào)(JXMJ00000000);共找出101個(gè)SNP和6個(gè)Small indel突變,發(fā)生于外顯子的SNP占16個(gè),SNP后導(dǎo)致氨基酸序列改變的蛋白質(zhì)包括IstB ATP結(jié)合區(qū)域包含蛋白、凝集因子A及轉(zhuǎn)座子IS1272等,而發(fā)生于外顯子的Small indel占3個(gè),Small indel突變后導(dǎo)致氨基酸序列改變的蛋白質(zhì)包括假設(shè)蛋白、30S核糖體蛋白S1、凝集因子A。結(jié)論經(jīng)LZD誘導(dǎo)獲得LZD耐藥MRSA-MS4-LZD100菌株,測(cè)序分析提示該菌株存在除23S rRNA V區(qū)及L3蛋白基因以外的突變位點(diǎn),為進(jìn)一步研究隱性LZD耐藥機(jī)制指明了方向。
【作者單位】： 深圳大學(xué)南山區(qū)人民醫(yī)院內(nèi)源性感染診治研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 耐甲氧西林金黃色葡萄球菌 利奈唑胺 高通量測(cè)序 全基因組序列
【基金】：深圳市重點(diǎn)學(xué)科資助項(xiàng)目(201506093) 深圳市科技創(chuàng)新課題(No.JCYJ20150402152130173、No.JCYJ20150402152130167) 深圳市重點(diǎn)學(xué)科經(jīng)費(fèi)資助 深圳市南山區(qū)課題資助(No.2015019、2015022)
【分類號(hào)】：R440
【正文快照】： [Chin J Infect Control,2017,16(1):1-5]以利奈唑胺(linezoid,LZD)為代表的口惡唑烷酮類(oxazolidinone)藥物是目前多重耐藥革蘭陽(yáng)性細(xì)菌治療的“最后防線”,已成為治療耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcusaureus,MRSA)感染,控制MRSA醫(yī)院感染暴發(fā)

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：401374