2018年5～9月,北京市西城區(qū)五所學(xué)校先后共報(bào)告了 5起呼吸道感染集中發(fā)熱疫情。為了解報(bào)告的5起疫情的流行病學(xué)和病原學(xué)特征,開(kāi)展了現(xiàn)場(chǎng)調(diào)查,采集病例咽拭子標(biāo)本,使用熒光定量PCR檢測(cè)17種常見(jiàn)呼吸道病毒進(jìn)行病原學(xué)篩查,對(duì)鑒定為人腺病毒(Human adenovirus,HAdV)陽(yáng)性的標(biāo)本進(jìn)行病毒分離,并分別擴(kuò)增六鄰體蛋白基因Loop2區(qū)域、三個(gè)衣殼蛋白(五鄰體基座蛋白、六鄰體蛋白和纖維蛋白)基因以及全基因組序列全長(zhǎng),進(jìn)行HAdV型別的初篩和確認(rèn),同時(shí)與Genbank數(shù)據(jù)庫(kù)中國(guó)內(nèi)外人腺病毒3型(Human adenovirus type 3,HAdV-3)流行株序列進(jìn)行比對(duì)分析。結(jié)果顯示,5起集中發(fā)熱疫情的致病原均為HAdV-3。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),2004年至今我國(guó)流行的HAdV-3病毒株均屬于Clade2進(jìn)化分支,也是近年全球優(yōu)勢(shì)流行株。兩個(gè)進(jìn)化分支HAdV-3病毒株在基因序列水平上均高度保守。本研究為我國(guó)呼吸道HAdV防控,以及HAdV-3型疫苗研發(fā)提供了基礎(chǔ)科學(xué)數(shù)據(jù)。人腺病毒可以引起多種疾病,并不時(shí)引發(fā)呼吸道疾病的暴發(fā)流行,為了了解人腺病毒在不同疾病病原譜中的檢出情況,本研究對(duì)符...

【文章頁(yè)數(shù)】：78 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖１基于Ｈｅｘｏｎ基因Ｌｏ〇Ｐ２區(qū)對(duì)２０１８年北京市西城區(qū)呼吸道感染疫情標(biāo)本進(jìn)行初步型別鑒定??注：▲?ＨＡｄＶ－Ａ－Ｇ中各代表型別的原型株序列??Ｆｉｇｕｒｅｌ?

）。結(jié)果顯示，２３?份??標(biāo)本獲得陽(yáng)性擴(kuò)增產(chǎn)物（表６），擴(kuò)增成功率為９２％?（２３／２５），經(jīng)序列測(cè)定和分析顯示，??所有標(biāo)本在Ｌｏｏｐ２區(qū)域的序列高度一致（１００％）。進(jìn)一步ＢＬＡＳＴ序列分析顯示，所有序??列與ＧｅｎＢａｎｋ數(shù)據(jù)庫(kù)中的ＨＡｄＶ－３株高度同源（１００％）。??每....

圖２基于Ｐｅｎｔｏｎ?ｂａｓｅ?（ａ）、Ｈｅｘｏｎ?（ｂ）、Ｆｉｂｅｒ基因（ｃ）和全基因組（ｄ）構(gòu)建人腺病毒３型???

ＷＭＪｆ?ＪＷＷｉｎ??ｒ￣?＾ｖ＇ｓｒ－?Ｓ＇?Ｉ－１－?Ｓｅｔ－?？??５￡？＝＾從＝二卞?”１？一…一?????—鑛撕雞??１?Ｂ－ｆｇ１＊＊０?＊＊＊＊＊＊１?｜？｜．Ｗ？ＩＣ?ｌｆｌ？ＡＶ９ＭＵｔ??■?ｐ＿ｕ＾ｔ？ＳＡ．＾ｖ?ｉ－？．ｕｉｒ？〇ｒ＞ｒ？Ｍｉ／ｉＫＦ？？....

圖３文獻(xiàn)篩選流程圖??Ｆｉｇｕｒｅ３?Ｆｌｏｗ?ｃｈａｒｔ?ｏｆ?ｌｉｔｅｒａｔｕｒｅ?ｓｃｒｅｅｎｉｎｇ??

中國(guó)疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所?碩士學(xué)位論文??三結(jié)果??３．１文獻(xiàn)檢索結(jié)果??中英文檢索共檢索到７９７篇中國(guó)ＨＡｄＶ檢出率相關(guān)文獻(xiàn)，其中中文４９３??篇，英文３０４篇。根據(jù)制定的納入和排除標(biāo)準(zhǔn)，對(duì)檢索到的所有文獻(xiàn)進(jìn)行文獻(xiàn)??去重、初篩和復(fù)篩，最終納入文獻(xiàn)２７４篇（２８４個(gè)....

圖４漏斗圖??Ｆｉｇｕｒｅ４?Ｔｈｅ?Ｈｉｎｎｅｌ?ｐｌｏｔ??

重要結(jié)??構(gòu)基因。Ｐｅｎｔｏｎ?ｂａｓｅ蛋白ＨＶＬ２區(qū)含有典型的Ａｒｇ－Ｇｌｙ－Ａｓｐ?（ＲＧＤ）基序，能與??宿主細(xì)胞整合素相互作用，介導(dǎo)病毒的內(nèi)吞％?Ｈｅｘｏｎ基因的Ｌ〇〇ｐｌ（ＨＶＲｌ？６）??和Ｌｏｏｐ２（ＨＶＲ７）具有型特異性結(jié)構(gòu)域，測(cè)定任一區(qū)域都可對(duì)ＨＡｄＶ進(jìn)行初步的....

本文編號(hào)：3967287