發(fā)布時(shí)間：2024-04-26 05:11

　　目的:綜合評(píng)估基因水平和蛋白水平技術(shù)對(duì)光滑念珠菌復(fù)合體菌種的鑒定能力;分析中國(guó)多中心侵襲性感染光滑念珠菌復(fù)合體的抗真菌藥物敏感性;系統(tǒng)性研究光滑念珠菌的分子流行病學(xué)特征及對(duì)棘白菌素類藥物的耐藥機(jī)制。方法:本研究選取了2009年8月至2014年7月五年參加CHIF-NET的11家監(jiān)測(cè)中心收集的所有非重復(fù)侵襲性感染光滑念珠菌411株及所有參與醫(yī)院收集的12株尼瓦利亞念珠菌(Candidanivariensis)和1株布加拉念珠菌(Candida bracarensis)。比較表型方法、基因測(cè)序和基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(MALDI-TOF MS)對(duì)光滑念珠菌復(fù)合體的鑒定能力,并在菌種準(zhǔn)確鑒定的基礎(chǔ)上,測(cè)定菌株對(duì)9種抗真菌藥物的最低抑菌濃度(MIC)。分子流行病學(xué)方面,利用多位點(diǎn)序列分析(MLST)和微衛(wèi)星檢測(cè)方法,對(duì)411株光滑念珠菌進(jìn)行分子分型,并進(jìn)行聚類及同源性分析;此外,收集CHIF-NET 2015所有血流感染分離的光滑念珠菌158株,剖析PDR1和MSH2兩個(gè)耐藥相關(guān)基因在臨床菌株中的突變率并分析其與氟康唑敏感性、分子型別的關(guān)系。耐藥機(jī)制研究方面,檢測(cè)411株光滑念珠菌F...

【文章頁(yè)數(shù)】：128 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

圖１．１１家參與單位地理分布和收集的菌株數(shù)量（括號(hào)內(nèi)）??Ｆｉｇｕｒｅ?１．?Ｇｅｏｇｒａｐｈｉｃ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｔｈｅ?１１?ｓｔｕｄｙ?ｃｅｎｔｅｒｓ?ｉｎｖｏｌｖｅｄ?ｉｎ?ｔｈｉｓ?ｓｔｕｄｙ?ａｎｄ?ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ??ｉｓｏｌａｔｅｓ?ｃｏｌｌｅｃｔｅｄ?ｉｎ?ｅａｃｈ?ｃｅｎｔｅｒ?（ｓｈｏｗｎ?ｉｎ?ｂｒａｃｋｅｔｓ）??

本研宄納入的２００９年８月１日至２０１４年７月３１日，１１家監(jiān)測(cè)中心五年期間共分離??侵襲性感染光滑念珠菌４１１株，占總體分離的酵母菌的９．５％，每年分離的菌株數(shù)在??７６－９５株之間，各單位收集的菌株數(shù)量見(jiàn)圖１。??＾?＾７ｈ１?（２９）?＂Ｈ４Ｖ１２Ｉ??參??４?＇＂ｆ．?....

圖３．尼瓦利亞念珠菌與布加拉念珠菌ＩＴＳ序列最大似然樹??Ｆｉｇｕｒｅ?３．?Ｔｈｅ?ｍａｘｉｍｕｍ－ｌｉｋｅｌｉｈｏｏｄ?ｔｒｅｅ?ｏｆ?Ｃａｎｄｉｄａ?ｎｉｖａｒｉｅｎｓｉｓ?ａｎ?

得到序列號(hào)（表６）。根據(jù)ＩＴＳ和Ｄ１／Ｄ２測(cè)序結(jié)果，結(jié)合兩種菌在Ｇｅｎｂａｎｋ中的??其它序列，以白念珠菌ＡＴＣＣ?１８８０４的序列作為樹根，分別作兩種菌ＩＴＳ和Ｄ１／Ｄ２序??列最大似然比樹狀圖（圖３和圖４）。ＩＴＳ結(jié)果顯示，１２株尼瓦利亞念珠菌可分為兩??組（Ｇｒｏｕｐ?１和....

圖６．?Ｂｒｕｋｅｒ?ＣｌｉｎｐｒｏＴｏｏｌｓ模型遺傳算法（ＧＡ）生成最大分辨能力的五個(gè)峰，紅色為尼瓦??利亞念珠菌，綠色為布加拉念珠菌??Ｆｉｇｕｒｅ?６．?Ｆｉｖｅ?ｐｅａｋｓ?ｗｅｒｅ?ｄｅｔｅｒｍｉｎｅｄ?ｂｙ?ｔｈｅ?ｇｅｎｅｔｉｃ?ａｌｇｏｒｉｔｈｍ?（ＧＡ）?ｔｏ?ｐｒｏｖｉｄｅ?ｔｈｅ?ｈｉｇｈｅｓｔ??ｓｅｐａｒａｔｉｏｎ?ｐｏｗｅｒ?ｔｏ?ｇｅｎｅｒａｔｅ?ａ?ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉ?

ＧＡ交叉驗(yàn)證值（特異性）均為１００％，ＳＮＮ和ＱＣ的特異性分別為９９．１６％和９９．５８％。??Ｂｒｕｋｅｒ?ＣｌｉｎｐｒｏＴｏｏｌｓ模型遺傳算法（ＧＡ）生成最大分辨能力的五個(gè)峰。ＧＡ設(shè)定：??模型的最大峰值數(shù)，５；最大代數(shù)，１０及鄰居數(shù)為３?（圖６）。比較尼瓦利亞念珠菌??和布....

圖７．?ａ，?Ｂｒｕｋｅｒ?ＣｌｉｎｐｒｏＴｏｏｌｓ模型中尼瓦利亞念珠菌（紅色圓圈）和布加拉念珠菌（綠色圓圈）??的菌株分布圖

Ｂｒｕｋｅｒ?ＣｌｉｎｐｒｏＴｏｏｌｓ模型遺傳算法（ＧＡ）生成最大分辨能力的五個(gè)峰。ＧＡ設(shè)定：??模型的最大峰值數(shù)，５；最大代數(shù)，１０及鄰居數(shù)為３?（圖６）。比較尼瓦利亞念珠菌??和布加拉念珠菌的平均譜圖（圖６）和菌株分布圖（圖７ａ），結(jié)果表明根據(jù)其肽質(zhì)??量指紋能夠明顯區(qū)分兩種....

本文編號(hào)：3964760