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miRNA-144-5p與甲狀腺乳頭狀癌聲學(xué)特征相關(guān)性研究及其計(jì)算生物學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2024-04-20 10:45
  目的:探討miRNA-144-5p與甲狀腺乳頭狀癌(Papillary Thyroid Carcinoma,簡(jiǎn)稱PTC)聲學(xué)特征的相關(guān)性,并通過計(jì)算生物學(xué)分析miRNA-144-5p在甲狀腺癌(Thyroid Cancer,簡(jiǎn)稱TC)的發(fā)生發(fā)展中的潛在分子調(diào)控機(jī)制及其臨床價(jià)值。方法:1、超聲特征與miRNA-144-5p表達(dá)的相關(guān)性回顧性歸納總結(jié)24例PTC病灶的二維超聲圖像特征(數(shù)目、位置、大小、邊緣、縱橫比(A/T)、內(nèi)部回聲、鈣化等)和超聲造影特征(增強(qiáng)方式、增強(qiáng)水平、增強(qiáng)時(shí)間等)。應(yīng)用RT-q PCR檢測(cè)24例PTC及25例非癌組織中miRNA-144-5p的表達(dá)水平,獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)比較兩組樣本中miRNA-144-5p的表達(dá)水平。Fisher確切概率法分析二維超聲及超聲造影特征與miRNA-144-5p表達(dá)規(guī)律的相關(guān)性。2、癌癥基因組圖譜(The Cancer Genome Atlas,簡(jiǎn)稱TCGA)、基因表達(dá)綜合數(shù)據(jù)庫(Gene Expression Omnibus,簡(jiǎn)稱GEO)和Arrayexpress數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)獲取及分析從TCGA數(shù)據(jù)庫中獲取TC組織和正常組織中miRN...

【文章頁數(shù)】:58 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖1miR-144前體microRNA的保守二級(jí)結(jié)構(gòu)

圖1miR-144前體microRNA的保守二級(jí)結(jié)構(gòu)

12,000xg空柱子離心2min干燥柱子;h)轉(zhuǎn)移柱子至加10-20μlDEPCWater到膜上,室溫放置3min,1RNA-144-5p引物序列設(shè)計(jì)及內(nèi)參U6引物序列設(shè)計(jì):參考miR-144的序列(圖1)以及既往文er5.0,對(duì)各對(duì)候選引物....


圖2A.PTC,邊界不清;圖B.PTC,內(nèi)部呈極低回聲;圖C.PTC,內(nèi)部可見微鈣化;圖D.PTC,縱橫比≥1;圖E.PTC,超聲造影呈低增強(qiáng)

圖2A.PTC,邊界不清;圖B.PTC,內(nèi)部呈極低回聲;圖C.PTC,內(nèi)部可見微鈣化;圖D.PTC,縱橫比≥1;圖E.PTC,超聲造影呈低增強(qiáng)

圖2A.PTC,邊界不清;圖B.PTC,內(nèi)部呈極低回聲;圖C.PTC,內(nèi)部可見微鈣化;圖D.PTC,縱橫比≥1;圖E.PTC,超聲造影呈低增強(qiáng)。Figure2A.PTC,unclearborderline;FigureB.PTC,extre....


圖3.miR-144-5p在PTC與甲狀腺良性標(biāo)本組織中的表達(dá)水平Figure3.ExpressionlevelofmiR-144-5pinPTCandthyroidbenignspecimentissue.

圖3.miR-144-5p在PTC與甲狀腺良性標(biāo)本組織中的表達(dá)水平Figure3.ExpressionlevelofmiR-144-5pinPTCandthyroidbenignspecimentissue.

邊界不清;圖B.PTC,內(nèi)部呈極低回聲;圖C.PTC,內(nèi)部可見微鈣化;圖E.PTC,超聲造影呈低增強(qiáng)。.PTC,unclearborderline;FigureB.PTC,extremelyhypoechoicmass;Figurefication....


圖5.miRNA-144-5p在非癌組織和TC組織中表達(dá)值(aE-MTAB-736,cGSE40807,eGSE57780,gGSE73182);非癌組織和TC組織中,miRNA-144-5p表達(dá)ROC曲線(bE-MTAB-736,dGSE40807,fGSE57780,hGSE73182)

圖5.miRNA-144-5p在非癌組織和TC組織中表達(dá)值(aE-MTAB-736,cGSE40807,eGSE57780,gGSE73182);非癌組織和TC組織中,miRNA-144-5p表達(dá)ROC曲線(bE-MTAB-736,dGSE40807,fGSE57780,hGSE73182)



本文編號(hào):3959297

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