人3型腺病毒LOOP1-6蛋白克隆表達及免疫鑒定
本文關(guān)鍵詞:人3型腺病毒LOOP1-6蛋白克隆表達及免疫鑒定,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:目的用聚合酶鏈式反應(yīng)(polymerase chain reaction, PCR)的實驗技術(shù)篩選人流行性B屬3型腺病毒典型性代表株,探討其與GenBank的同源性。據(jù)檢測結(jié)果挑選代表株,構(gòu)建編碼LOOP 1-6蛋白的質(zhì)粒并在大腸桿菌BL21 (DE3)原核表達獲得純化的LOOP 1-6目的蛋白,以Weston-Blot法免疫鑒定。通過對其蛋白衣殼基因的變異變遷的探究和經(jīng)構(gòu)建重組質(zhì)粒成功克隆表達及免疫鑒定LOOP 1-6目的蛋白,為臨床的相應(yīng)血清學(xué)診斷試劑盒的研發(fā)及腺病毒感染的防治提供實驗指導(dǎo)。方法1.用北京卓誠惠生生物科技有限公司生產(chǎn)的ABT9+7呼吸道病毒多重PCR快速檢測試劑,檢測臨床上呼吸道病毒感染的疑似病例的兒童咽拭子,進行病毒的初步篩查或者用歐蒙醫(yī)學(xué)實驗診斷股份公司的呼吸道病原譜抗體IgM檢測試劑盒(間接免疫熒光法)檢測患者血清抗體水平。2.根據(jù)腺病毒Hexon的LOOP 1-6或LOOP7的基因可定型血清,設(shè)計相應(yīng)的引物,進行PCR及測序。由測序的結(jié)果,在NCBI上進行序列的Blast,判斷腺病毒的型別。3.挑取3型的腺病毒,進行腺病毒的分離與增殖。增殖完成后,提取核酸。根據(jù)GenBank中3型腺病毒的Hexon、Penton base和Fiber的基因序列設(shè)計的相應(yīng)的引物,進行PCR擴增和測序。4.用Sequencher 5.0對測序的結(jié)果進行處理,由軟件MEGA5.0對處理后序列進行基因親緣關(guān)系樹分析、氨基酸和核苷酸同源性分析。5.選取3型腺病毒Hexon基因相對保守的毒株并設(shè)計引物,用于六棱體的LOOP 1-6的克隆PCR模板?寺3型腺病毒Hexon基因的LOOP 1-6至載體pET-48b (+)質(zhì)粒上,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌BL21(DE3)中,經(jīng)IPTG誘導(dǎo)和鎳離子親和層析純化,得到目的蛋白LOOP1-6。用抗6×His-tag抗體經(jīng)Weston-Blot法免疫鑒定表達的蛋白。結(jié)果1.從陜西、湖南、河北、山東、云南、甘肅和吉林共七個省的送檢標本中共檢測出腺病毒陽性的229份,其中7型腺病毒121份;3型腺病毒35份;其他型別73份。2.在親緣關(guān)系樹中,可見七個省十二五期間的HAdV3的六棱體、五棱體和纖突與世界范圍內(nèi)的流行概況大體一致。只在湖南發(fā)現(xiàn)了兩株Hexon基因的重組株,分別采自2012年和2013年。這兩株毒株與日本2011年分離到P7H3+7F3(genbank:JN860679.1)的毒株的Hexon基因的核苷酸同源性達98.3%和98.4%,氨基酸同源性達99.6%和99.6%;Penton base基因的核苷酸同源性為99.2%、99.2%,氨基酸同源性為98.7%、98.7%;Fiber基因的核苷酸同源性為63.6%、63.6%,氨基酸同源性為57.1%、57.1%(如圖8-a,b,c所示)。本實驗室將其命名為P7H3+7F7,說明了HAdV3的六棱體基因有發(fā)生組內(nèi)重組的可能性。除去這兩株,其余毒株Fiber基因的核苷酸同源性在99.7%-100%間,氨基酸同源性為100%;Hexon基因的核苷酸同源性在99.9%-100%,氨基酸同源性為99.7%-100%間;Penton base基因的核苷酸同源性在98.8%-100%,氨基酸同源性為98.3%-100%,說明中國人HAdV3的基因很保守。3.經(jīng)構(gòu)建重組質(zhì)粒成功克隆表達及免疫鑒定,獲得純化的LOOP 1-6目的蛋白。結(jié)論本研究采用多重PCR和血清間接免疫熒光法成功鑒別了腺病毒陽性感染的標本,標本三代擴毒成功后,經(jīng)PCR測序等步驟初步闡明了中國七個省份十二五期間的3型腺病毒的蛋白衣殼基因比較保守的流行規(guī)律。經(jīng)構(gòu)建重組質(zhì)粒成功克隆表達及免疫鑒定,獲得純化的LOOP 1-6目的蛋白,為后期的血清分型試劑盒的進一步的研究提供了前期的實驗基礎(chǔ)。
【關(guān)鍵詞】:HAdV 3 間接免疫熒光 Hexon基因 Penton base基因 Fiber基因 蛋白表達 免疫鑒定 診斷試劑盒
【學(xué)位授予單位】:安徽理工大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:R440
【目錄】:
- 摘要5-7
- Abstract7-15
- 注釋說明清單15-17
- 引言17-19
- 1 人3型腺病毒的基因特征19-44
- 1.1 材料19-23
- 1.1.1 標本來源19-21
- 1.1.2 主要試劑21-22
- 1.1.3 主要儀器22
- 1.1.4 主要耗材22-23
- 1.2 方法23-32
- 1.2.1 復(fù)蘇、培養(yǎng)細胞23-24
- 1.2.2 凍存細胞24
- 1.2.3 病毒種類的初步鑒定24-28
- 1.2.4 人腺病毒熒光定量鑒定28-29
- 1.2.5 HEp-2細胞接種人腺病毒29-32
- 1.3 結(jié)果32-42
- 1.3.1 病毒種類的初步鑒定結(jié)果32-33
- 1.3.2 人腺病毒熒光定量PCR鑒定結(jié)果33-34
- 1.3.3 HEp-2細胞接種人腺病毒后的病變結(jié)果34-35
- 1.3.4 3型腺病毒Hexon、Penton base和Fiber基因的變異變遷規(guī)律的檢測結(jié)果35-42
- 1.4 分析與討論42-43
- 1.5 結(jié)論43-44
- 2 人3型腺病毒LOOP1-6蛋白克隆表達及免疫鑒定44-64
- 2.1 材料44-49
- 2.1.1 主要試劑44-45
- 2.1.2 主要儀器45
- 2.1.3 主要耗材45-46
- 2.1.4 主要試劑配方46-49
- 2.2 方法49-59
- 2.2.1 pGEM-T-HAdV3-Hexon-LOOP1-6質(zhì)粒的構(gòu)建49-53
- 2.2.2 pET-48b-HAdV 3-Hexon-LOOP1-6質(zhì)粒的構(gòu)建53-56
- 2.2.3 HAdV3-Hexon-LOOP 1-6蛋白的誘導(dǎo)表達及純化56-59
- 2.3 結(jié)果59-62
- 2.3.1 pGEM-T-HAdV 3-Hexon-LOOP1-6質(zhì)粒的構(gòu)建59-60
- 2.3.2 pET-48b-HAdV 3-Hexon-LOOP1-6質(zhì)粒的構(gòu)建60-61
- 2.3.3 HAdV 3-Hexon-LOOP1-6蛋白的誘導(dǎo)表達及純化61-62
- 2.4 討論62-64
- 結(jié)論64-65
- 參考文獻65-69
- 附錄A pET-48b(+)質(zhì)粒圖譜69-70
- 附錄B 重組質(zhì)粒pGEM-T-HAdV3-Hexon-LOOP1-6測序圖70-71
- 后記或致謝71-72
- 作者簡介及讀研期間主要科研成果72-73
【相似文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 Faden H.;Wynn R.J.;Campagna L.;Ryan R.M.;平智廣;;新生兒重癥監(jiān)護病房內(nèi)腺病毒30型的暴發(fā)流行[J];世界核心醫(yī)學(xué)期刊文摘(兒科學(xué)分冊);2005年08期
2 ;腺病毒肺炎[J];中華婦幼臨床醫(yī)學(xué)雜志(電子版);2011年05期
3 梁金鑫;曲東;任曉旭;郭琳瑛;曹玲;鄧潔;錢淵;朱汝南;趙林清;王芳;;兒童腺病毒肺炎臨床及相關(guān)危險因素分析[J];中華全科醫(yī)學(xué);2012年08期
4 吳婉芳;;腺病毒肺炎的臨床表現(xiàn)和診治[J];人民軍醫(yī);1966年03期
5 張梓荊;;嬰幼兒腺病毒肺炎[J];中級醫(yī)刊;1964年01期
6 ;預(yù)測小兒3、7型腺病毒肺炎113例臨床報告[J];遼寧中醫(yī);1977年01期
7 ;免疫螢光抗體對腺病毒肺炎的診斷價值及腺病毒肺炎的治療[J];哈醫(yī)大學(xué)報;1977年04期
8 ;復(fù)方貫仲合劑治療小兒腺病毒肺炎44例報告[J];武漢新醫(yī)藥;1978年02期
9 吳守哲;徐碧珍;;抗3.7型腺病毒血清治療腺病毒肺炎[J];遼寧中級醫(yī)刊;1979年01期
10 胡克恒,季純珍;Ⅲ、Ⅶ型腺病毒肺炎應(yīng)用腺病毒血清治療的療效觀察[J];白求恩醫(yī)科大學(xué)學(xué)報;1980年03期
中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前8條
1 鄭祥;何時軍;;26例腺病毒肺炎臨床分析[A];中華醫(yī)學(xué)會急診醫(yī)學(xué)分會第十三次全國急診醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)年會大會論文集[C];2010年
2 邵淑芳;孫艷香;;19例兒童腺病毒肺炎的護理[A];全國兒科護理學(xué)術(shù)交流暨專題講座會議論文匯編[C];2007年
3 鄭祥;;26例腺病毒肺炎臨床分析[A];2011年浙江省醫(yī)學(xué)會兒科學(xué)分會學(xué)術(shù)年會暨兒內(nèi)科疾病診治新進展國家級學(xué)習(xí)班論文匯編[C];2011年
4 劉百祥;鐘禮立;;中西醫(yī)結(jié)合救治重癥腺病毒肺炎9例報告[A];第二十九次全國中醫(yī)兒科學(xué)術(shù)大會暨“小兒感染性疾病的中醫(yī)藥防治”培訓(xùn)班論文匯編[C];2012年
5 謝樂云;鐘禮立;張兵;熊潔;趙辛;彭穎;黃寒;段招軍;謝志萍;高寒春;;7型腺病毒肺炎臨床、影像、內(nèi)鏡及病理特點分析[A];中華醫(yī)學(xué)會第十七次全國兒科學(xué)術(shù)大會論文匯編(上冊)[C];2012年
6 葉澤慧;黃英;舒暢;李渠北;代繼宏;王瑩;袁小平;;纖支鏡肺泡灌洗術(shù)診治嬰幼兒重癥腺病毒肺炎分析[A];中華醫(yī)學(xué)會第十七次全國兒科學(xué)術(shù)大會論文匯編(上冊)[C];2012年
7 蒲開彬;黃英;舒暢;閆莉;;丙種球蛋白輔助治療兒童重癥腺病毒肺炎療效觀察[A];中華醫(yī)學(xué)會呼吸病學(xué)年會——2013第十四次全國呼吸病學(xué)學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2013年
8 劉愛良;黃英;楊洋;舒暢;代繼宏;李渠北;;兒童重癥腺病毒肺炎213例臨床特征分析[A];中華醫(yī)學(xué)會呼吸病學(xué)年會——2013第十四次全國呼吸病學(xué)學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2013年
中國重要報紙全文數(shù)據(jù)庫 前8條
1 鄭靈巧;警示聲聲 腺病毒變異株現(xiàn)身美國[N];健康報;2007年
2 記者 胡珉琦;還原真實的“腺病毒55型”[N];北京科技報;2012年
3 韓贏;冬季:需防腺病毒肺炎[N];衛(wèi)生與生活報;2003年
4 首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京友誼醫(yī)院 崔紅;不可忽視的腺病毒肺炎[N];健康報;2010年
5 高春東;腺病毒肺炎危害大[N];醫(yī)藥經(jīng)濟報;2002年
6 記者 楊建平;漢中確診十八例兒童腺病毒肺炎[N];陜西日報;2009年
7 李祥農(nóng);治小兒腺病毒肺炎驗方[N];農(nóng)村醫(yī)藥報(漢);2006年
8 彭景星 彭慕斌;名醫(yī)醫(yī)案賞析二則[N];中國中醫(yī)藥報;2004年
中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 黃國虹;2010-2012年中國大陸七省市流行的腺病毒及基因特征研究[D];中國疾病預(yù)防控制中心;2013年
中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 李燕;147例兒童腺病毒肺炎的臨床與影像學(xué)表現(xiàn)研究分析[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2012年
2 Kenny Lan Cheong Wah;2013年度蘇州地區(qū)兒童腺病毒肺炎臨床特征及發(fā)展為閉塞性細支氣管炎危險因素分析[D];蘇州大學(xué);2015年
3 趙素慧;呼吸道腺病毒的分離、鑒定及分子流行病學(xué)研究[D];南方醫(yī)科大學(xué);2013年
4 戴京京;人3型腺病毒LOOP1-6蛋白克隆表達及免疫鑒定[D];安徽理工大學(xué);2016年
5 林娟;病炎清Ⅶ號治療腺病毒肺炎的臨床研究[D];廣州中醫(yī)藥大學(xué);2008年
6 謝樂云;湖南地區(qū)急性下呼吸道感染住院患兒腺病毒分子流行病學(xué)調(diào)查以及重癥腺病毒肺炎臨床分析[D];湖南師范大學(xué);2013年
7 徐祝菲;3、7型腺病毒纖毛與六鄰體基因序列分析[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2012年
8 杜芳;1、小兒重癥腺病毒肺炎混合感染及高危因素分析 2、沙美特羅替卡松氣霧劑治療兒童哮喘療效觀察[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2014年
9 蒲開彬;1、重慶地區(qū)兒童重癥社區(qū)獲得性肺炎病原學(xué)分析 2、IVIG輔助治療兒童重癥腺病毒肺炎臨床研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2014年
10 金亞;兒童感染后閉塞性細支氣管炎25例臨床分析[D];山東大學(xué);2012年
本文關(guān)鍵詞:人3型腺病毒LOOP1-6蛋白克隆表達及免疫鑒定,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號:386454
本文鏈接:http://sikaile.net/linchuangyixuelunwen/386454.html