正常產(chǎn)婦羊水蛋白質(zhì)組圖譜建立及其個體差異分析
發(fā)布時間:2022-07-07 13:27
研究背景:羊水是一種復(fù)雜而動態(tài)變化的生物體液,其中含有大量由羊膜上皮細(xì)胞、胎兒組織、胎兒排泄物和胎盤組織產(chǎn)生的蛋白質(zhì)。羊水可以為胎兒提供機(jī)械保護(hù),營養(yǎng)以及胎兒生長和健康所需的其他分子。因此,羊水對于胎兒的發(fā)育至關(guān)重要,羊水是鑒別胎兒病理的潛在的主要生物標(biāo)志物來源。研究方法:本研究共收集了 7名正常產(chǎn)婦羊水樣本。首先從7例樣本中每個取等量得到一個羊水混合樣,通過免疫親和去除柱去除14種高豐度蛋白,得到的流出組分,洗脫組分和原始混合蛋白3種樣品分別進(jìn)行酶切,二維液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用分析,最后得到的數(shù)據(jù)用于建立正常產(chǎn)婦羊水蛋白質(zhì)組圖譜。另外,7例羊水樣本分別單獨(dú)進(jìn)行酶切,通過iTRAQ 8標(biāo)進(jìn)行同位素標(biāo)記定量,將標(biāo)記好的樣品混合得到一個混合樣,進(jìn)行二維液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用分析,最后得到的定量數(shù)據(jù)用于分析個體間的差異。研究結(jié)果:本研究共鑒定到2881個非冗余羊水蛋白,其中基于峰強(qiáng)度半定量(iBAQ)方法定量到1624個蛋白,發(fā)現(xiàn)前20高豐度蛋白占羊水總蛋白的64%;虮倔w分析顯示羊水中胞外蛋白富集,包括一些胞外基質(zhì)蛋白、膠原質(zhì)蛋白等。IPA功能分析發(fā)現(xiàn)羊水蛋白主要與軸突導(dǎo)向信號通路相關(guān)性最高。7...
【文章頁數(shù)】:95 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
縮略詞表
摘要
Abstract
第一章 前言
1. 體液蛋白質(zhì)組學(xué)
2. 羊水蛋白質(zhì)組研究進(jìn)展
3. 正常羊水蛋白質(zhì)組及其個體差異
4. 本研究的主要內(nèi)容和研究意義
第二章 材料與方法
1. 實驗材料
1.1 臨床樣本
1.2 實驗試劑
1.3 實驗耗材
1.4 實驗儀器
1.5 試劑配制
1.6 分析軟件
2. 實驗方法
2.1 羊水的收集
2.2 蛋白質(zhì)提取
2.3 Bradford方法測定蛋白濃度
2.4 去除高豐度蛋白
2.5 膜輔助溶液內(nèi)蛋白酶解
2.6 固相萃取純化肽段
2.7 BCA法測定多肽濃度
2.8 iTRAQ定量標(biāo)記
2.9 二維高pH反相高效液相色譜分離
2.10 LC-MS/MS分析
2.11 數(shù)據(jù)分析
2.12 數(shù)據(jù)處理
2.13 GO功能分析及IPA通路分析
第三章 實驗結(jié)果
1. 羊水蛋白質(zhì)組分析的實驗流程
2. 羊水蛋白質(zhì)組圖譜建立
2.1 羊水蛋白質(zhì)組的定性結(jié)果
2.2 羊水蛋白質(zhì)組的定量結(jié)果
2.3 羊水蛋白質(zhì)組的功能分析
3. 羊水蛋白質(zhì)組個體間差異分析
3.1 羊水蛋白質(zhì)組技術(shù)重復(fù)分析
3.2 羊水蛋白質(zhì)組個體間差異分析
3.3 個體間差異與蛋白功能的關(guān)系
3.4 羊水與其他體液個體間差異的比較
第四章 討論
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
個人簡歷
本文編號:3656502
【文章頁數(shù)】:95 頁
【學(xué)位級別】:碩士
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摘要
Abstract
第一章 前言
1. 體液蛋白質(zhì)組學(xué)
2. 羊水蛋白質(zhì)組研究進(jìn)展
3. 正常羊水蛋白質(zhì)組及其個體差異
4. 本研究的主要內(nèi)容和研究意義
第二章 材料與方法
1. 實驗材料
1.1 臨床樣本
1.2 實驗試劑
1.3 實驗耗材
1.4 實驗儀器
1.5 試劑配制
1.6 分析軟件
2. 實驗方法
2.1 羊水的收集
2.2 蛋白質(zhì)提取
2.3 Bradford方法測定蛋白濃度
2.4 去除高豐度蛋白
2.5 膜輔助溶液內(nèi)蛋白酶解
2.6 固相萃取純化肽段
2.7 BCA法測定多肽濃度
2.8 iTRAQ定量標(biāo)記
2.9 二維高pH反相高效液相色譜分離
2.10 LC-MS/MS分析
2.11 數(shù)據(jù)分析
2.12 數(shù)據(jù)處理
2.13 GO功能分析及IPA通路分析
第三章 實驗結(jié)果
1. 羊水蛋白質(zhì)組分析的實驗流程
2. 羊水蛋白質(zhì)組圖譜建立
2.1 羊水蛋白質(zhì)組的定性結(jié)果
2.2 羊水蛋白質(zhì)組的定量結(jié)果
2.3 羊水蛋白質(zhì)組的功能分析
3. 羊水蛋白質(zhì)組個體間差異分析
3.1 羊水蛋白質(zhì)組技術(shù)重復(fù)分析
3.2 羊水蛋白質(zhì)組個體間差異分析
3.3 個體間差異與蛋白功能的關(guān)系
3.4 羊水與其他體液個體間差異的比較
第四章 討論
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
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本文編號:3656502
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