發(fā)布時(shí)間：2022-01-12 00:55

　　目的:放療在NSCLC治療中的地位日益重要,但目前仍未能基于NSCLC患者遺傳學(xué)信息進(jìn)行個(gè)體化精準(zhǔn)放療,本研究旨在通過(guò)分析TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)NSCLC患者樣本的多組學(xué)信息和來(lái)自ATCC細(xì)胞庫(kù)NSCLC細(xì)胞株放射后的克隆形成能力,共同探索NSCLC放療敏感性的具體機(jī)制。方法:（1）下載TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中肺鱗癌和肺腺癌的臨床資料,篩選出TNM分期III期接受放療的肺腺癌患者20例和肺鱗癌患者17例,下載并分析37例患者的SNV、CNV、mRNA表達(dá)、miRNA表達(dá)和DNA甲基化數(shù)據(jù),根據(jù)中位無(wú)疾病進(jìn)展生存期391天將其分為放療敏感組（S組,n=18）和放療抵抗組（R組,n=19）,通過(guò)獨(dú)立樣本Student’s t檢驗(yàn)比較S組和R組突變負(fù)荷、SNP位點(diǎn)、signatures構(gòu)成、CNV、miRNA表達(dá)和甲基化基因是否有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。（2）從ATCC細(xì)胞庫(kù)篩選未接受治療的人NSCLC貼壁細(xì)胞株,將處于對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的NSCLC細(xì)胞株置于6MV瓦里安電子直線加速器進(jìn)行1Gy、2 Gy、4 Gy、6 Gy和8 Gy的照射,再將對(duì)照組和五個(gè)照射組細(xì)胞進(jìn)行克隆形成實(shí)驗(yàn),待肉眼可見(jiàn)克隆形成后終止培養(yǎng),計(jì)數(shù)不同實(shí)驗(yàn)... 

【文章來(lái)源】：上海交通大學(xué)上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：110 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

HD-SCA工作流鑒定的稀有細(xì)胞蛋白譜原理圖

圖 1.2 肺腺癌的體細(xì)胞突變Figure 1.2 Somatic mutations in lung adenocarcinomaa 為 230 例肺腺癌樣本全外顯子測(cè)序的共突變圖；b 和 c 為樣本根據(jù)不同特征被分為不同的突變模式，b按堿基顛換發(fā)生率高低分為兩組樣本，c 按性別分為兩組樣本，所有樣本（n =412）用Fisher’s 確切概率法進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析（黑星表示 q <0.05，灰星表示 P <0.05），星標(biāo)靠近的那側(cè)樣本發(fā)生更高比例的突變。(a) Co-mutation plot from whole exome sequencing of 230 lung adenocarcinomas. (b, c) The differentiapatterns of mutation between samples classified as transversion high and transversion low samples (b

圖 2.1 放療敏感組和放療抵抗組的總突變數(shù)和非同義突變數(shù)igure 2.1 The numbers of total mutations and non-synonymous mutatioin the radiosensitive group and the radioresistant group組呈現(xiàn)出相對(duì)較多的總突變數(shù)（中位突變數(shù) 282 vs 223，p=0.323變數(shù) 210 vs 173，p=0.3208），但 Student’s t檢驗(yàn)未見(jiàn)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異 t-test showed no statistical significance, although a greater burden oion number, 282 vs 223, p=0.3237) and non-synonymous mutations (


本文編號(hào)：3583779