目的:1.驗(yàn)證生物信息學(xué)方法可用于膿毒癥發(fā)生、發(fā)展機(jī)制的研究;2.應(yīng)用生物信息學(xué)方法篩選出調(diào)控膿毒癥發(fā)生、發(fā)展的關(guān)鍵基因,為臨床治療膿毒癥提供新思路。方法:1.在GCBI在線分析平臺(tái)的“樣本”選項(xiàng)中,以“sepsis”為關(guān)鍵詞找到與之鏈接的GEO數(shù)據(jù)庫中膿毒癥的基因芯片數(shù)據(jù)集:GSE28750,將該基因芯片數(shù)據(jù)集發(fā)送至GCBI分析實(shí)驗(yàn)室后分為膿毒癥組及健康對(duì)照組,應(yīng)用GCBI在線分析平臺(tái)對(duì)基因芯片數(shù)據(jù)進(jìn)行差異分析以篩選出膿毒癥組與健康對(duì)照組之間的差異表達(dá)基因,將篩選出的差異表達(dá)基因進(jìn)行GO分析以了解富集差異基因的生物學(xué)功能、途徑或者細(xì)胞定位,將差異表達(dá)基因進(jìn)行pathway分析以了解實(shí)驗(yàn)條件下顯著改變的代謝通路,將差異表達(dá)基因進(jìn)行基因信號(hào)網(wǎng)絡(luò)分析以發(fā)現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)中核心的基因（即調(diào)控疾病發(fā)生、發(fā)展的關(guān)鍵基因）,將差異表達(dá)基因進(jìn)行共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析以篩選出共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)中的核心基因（即調(diào)控膿毒癥發(fā)生、發(fā)展的關(guān)鍵基因）;2.在RAW264.7細(xì)胞的培養(yǎng)基中加入100ng/mL的脂多糖以對(duì)其進(jìn)行刺激,選擇不同的時(shí)間節(jié)點(diǎn)并綜合運(yùn)用形態(tài)學(xué)觀察、ELISA法和RT-qPCR法對(duì)相關(guān)指標(biāo)進(jìn)行檢測(cè)并分析,以判斷膿毒癥... 

【文章來源】：西南醫(yī)科大學(xué)四川省

【文章頁數(shù)】：70 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

樣本芯片數(shù)據(jù)對(duì)數(shù)化標(biāo)準(zhǔn)處理前

圖 2 樣本芯片數(shù)據(jù)對(duì)數(shù)化標(biāo)準(zhǔn)處理后異表達(dá)基因篩選結(jié)果通過對(duì)膿毒癥組及健康對(duì)照組的基因芯片數(shù)據(jù)進(jìn)行差異分析，57 個(gè)差異表達(dá)基因，與健康對(duì)照組相比，膿毒癥組共有 1282 、1175 個(gè)下調(diào)基因 (見圖 3)。由圖 3 可知，本研究篩選出的差好的區(qū)分出膿毒癥組及健康對(duì)照組。

圖 2 樣本芯片數(shù)據(jù)對(duì)數(shù)化標(biāo)準(zhǔn)處理后1.2 差異表達(dá)基因篩選結(jié)果通過對(duì)膿毒癥組及健康對(duì)照組的基因芯片數(shù)據(jù)進(jìn)行差異分析，共篩選出 2457 個(gè)差異表達(dá)基因，與健康對(duì)照組相比，膿毒癥組共有 1282 個(gè)上調(diào)基因、1175 個(gè)下調(diào)基因 (見圖 3)。由圖 3 可知，本研究篩選出的差異基因能較好的區(qū)分出膿毒癥組及健康對(duì)照組。


本文編號(hào)：3479228