肝細(xì)胞癌（hepatocellular carcinoma,HCC）是全球范圍內(nèi)最常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,其具有顯著的異質(zhì)性和術(shù)后高復(fù)發(fā)率的特點(diǎn)。因此,有效的術(shù)前危險(xiǎn)分層和精準(zhǔn)的預(yù)后評(píng)估對(duì)于治療手段及隨訪方案的制定有重要意義。影像組學(xué),作為從醫(yī)學(xué)圖像中提取高通量影像信息的方法,具有無(wú)創(chuàng)地捕獲腫瘤的內(nèi)在信息和反映腫瘤異質(zhì)性的特點(diǎn),受到廣泛的關(guān)注。并且,影像組學(xué)聯(lián)合基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)等多組學(xué)的信息,能夠從多個(gè)維度全面有效評(píng)估腫瘤患者的生物學(xué)特征和異質(zhì)性。本研究基于影像組學(xué)技術(shù)在HCC中展開(kāi)應(yīng)用,在課題的第一部分工作中探討基于超聲醫(yī)學(xué)圖像的影像組學(xué)技術(shù)在HCC進(jìn)行術(shù)前有效分型中的作用,并分析HCC不同亞型之間的特異性,進(jìn)一步提出影像組學(xué)對(duì)HCC癌栓形成、微血管侵犯及早期復(fù)發(fā)等臨床病理特征術(shù)前有效評(píng)估的效能。在第二部分的工作中,我們通過(guò)基于增強(qiáng)電子計(jì)算機(jī)斷層掃描（contrast enhanced computed tomography,CECT）影像組學(xué)的技術(shù)聯(lián)合轉(zhuǎn)錄組學(xué)及臨床病理參數(shù),構(gòu)建HCC患者的預(yù)后有效評(píng)估的模型。本研究有望為HCC的精準(zhǔn)診療提供有效的臨床輔助決策。第一部分基于... 

【文章來(lái)源】：廣西醫(yī)科大學(xué)廣西壯族自治區(qū)

【文章頁(yè)數(shù)】：88 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

本研究流程圖

ITK-SNAP（version 3.8.0，University of Pennsylvania, Philadelphia,USA）軟件沿著病灶邊緣勾畫(huà) ROI[20, 21]。ROI 的勾畫(huà)由一位具有 10 年臨床經(jīng)驗(yàn)的超聲醫(yī)師進(jìn)行勾畫(huà)，并由另一位具有 20 年臨床經(jīng)驗(yàn)的超聲醫(yī)師進(jìn)行確認(rèn)。ITK-SNAP 是一款開(kāi)源軟件，支持 Windows、Linux 以及 MacOS 等操作平臺(tái)。操作步驟：①將 HCC 病灶最大切面的 DICOM 圖片導(dǎo)入 ITK-SNAP 軟件；②選擇“polygon mode”，點(diǎn)擊鼠標(biāo)左鍵，繪制工具根據(jù)手工沿著病灶邊緣進(jìn)行勾畫(huà)，當(dāng)勾畫(huà)邊界線首尾相連后顏色發(fā)生變化，鼠標(biāo)右鍵可以進(jìn)行圖像的放大縮小，便于觀察；③選擇“paintbrush mode”對(duì)勾畫(huà)的 ROI 邊界線進(jìn)行精確調(diào)整，保證感興趣區(qū)覆蓋腫瘤病灶圖像，左鍵為對(duì)鼠標(biāo)點(diǎn)擊區(qū)域進(jìn)行標(biāo)記，右鍵為對(duì)鼠標(biāo)點(diǎn)擊區(qū)域進(jìn)行擦除；④點(diǎn)擊右下角“accept” 完成 ROI 勾畫(huà)并保存 ROI 文件為“NiFTI”格式進(jìn)行后續(xù)分析（圖 2-1）。

基于影像組學(xué)的肝細(xì)胞癌術(shù)前分型和預(yù)后評(píng)估研究 碩士學(xué)位論文2.2.2 影像組學(xué)特征通過(guò) ITK-SNAP 軟件，完成了 HCC 病灶感興趣區(qū)的勾畫(huà)（圖 2-2）。本研究所提取的 1076 個(gè)特征，其中包括 19 個(gè)直方圖特征，16 形狀特征，60個(gè)紋理特征以及 432 小波特征。除去方差為 0 的影像組學(xué)特征，即在所有樣本中均沒(méi)有變化的特征后，我們納入了 968 個(gè)影像組學(xué)進(jìn)行下一步的分析，并對(duì)這些特征進(jìn)行了 Z-score 的標(biāo)準(zhǔn)化處理。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Systematic review of the outcomes of surgical resection for intermediate and advanced Barcelona Clinic Liver Cancer stage hepatocellular carcinoma: A critical appraisal of the evidence[J]. Ye Xin Koh,Hwee Leong Tan,Weng Kit Lye,Juinn Huar Kam,Adrian Kah Heng Chiow,Siong San Tan,Su Pin Choo,Alexander Yaw Fui Chung,Brian Kim Poh Goh.  World Journal of Hepatology. 2018(06)
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本文編號(hào)：3257391