我國(guó)部分地區(qū)萬(wàn)古霉素耐藥腸球菌分子流行病學(xué)研究及血流感染危險(xiǎn)因素分析
發(fā)布時(shí)間:2021-06-24 10:29
背景:腸球菌是院內(nèi)感染的條件致病菌,常引起血流及尿路感染,可天然和后天獲得耐藥性,包括對(duì)萬(wàn)古霉素及達(dá)托霉素等最后防線用藥的耐藥。在中國(guó),萬(wàn)古霉素耐藥腸球菌(Vancomycin-resistant Eerococci,VRE)多為攜帶vanA的屎腸球菌,但上海地區(qū)多家醫(yī)院已發(fā)現(xiàn)vanM型傳播。大多數(shù)醫(yī)院VRE菌株為克隆復(fù)合體17(CC 17)。本研究對(duì)2006-2017年中國(guó)多家醫(yī)院VRE菌株分子流行病學(xué)及VRE引起血流感染危險(xiǎn)因素進(jìn)行了回顧性研究,旨在了解多年來(lái)中國(guó)VRE的流行病學(xué)特點(diǎn),進(jìn)而為臨床感染治療及醫(yī)院感控提供依據(jù)。方法:本研究收集了 2006年1月至2017年12月全國(guó)16家醫(yī)院245株VRE菌株,包括 240 株萬(wàn)古霉素耐藥屎腸球菌(Vancomycin-resistant Enterococci faecium,VREfm)和 5 株萬(wàn)古霉素耐藥糞腸球菌(Vancomycin-resistant Enterococci faecalis,VREfs),用微量肉湯稀釋法測(cè)定抗菌藥物的MIC值;以特異引物PCR進(jìn)行萬(wàn)古霉素耐藥基因和毒力基因的檢測(cè);以Southern blo...
【文章來(lái)源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:136 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
前言
第一部分 中國(guó)萬(wàn)古霉素耐藥腸球菌耐藥性、毒力因子及同源性研究
材料與方法
1. 材料
2. 方法
2.1 菌種鑒定
2.2 藥敏實(shí)驗(yàn)
2.3 萬(wàn)古霉素耐藥基因和毒力因子基因檢測(cè)
2.4 基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(MALDI-TOF MS)篩查VREfm
2.5 Southern blot雜交
2.6 質(zhì)粒接合試驗(yàn)
2.7 分子流行病學(xué)分析
結(jié)果
1. 標(biāo)本類型及科室分布
2. 耐藥性
3. 毒力基因
4. 萬(wàn)古霉素耐藥基因及毒力基因水平傳遞研究
5. 分子同源性分析
討論
結(jié)論
第二部分 導(dǎo)致血流感染的萬(wàn)古霉素耐藥屎腸球菌全基因組測(cè)序分析
材料與方法
1. 菌株背景
2. 全基因組測(cè)序
結(jié)果
1. 基因預(yù)測(cè)和功能注釋
2. MLST分型
3. 核心基因組多位點(diǎn)序列分型(cgMLST)
4. 基于全基因組測(cè)序的單核苷酸多態(tài)性(wgSNP)研究
5. 表型預(yù)測(cè)
討論
結(jié)論
第三部分 萬(wàn)古霉素耐藥腸球菌血流感染臨床危險(xiǎn)因素分析
材料與方法
1. 研究對(duì)象
2. 病例資料的收集
3. 研究?jī)?nèi)容
4. 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
結(jié)果
1. 研究對(duì)象基本情況
2. 單因素條件logistic回歸分析
3. 多因素條件logistic回歸分析
討論
結(jié)論
全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
論文相關(guān)綜述
附錄1: 英漢縮略語(yǔ)名詞對(duì)照
附錄2: 博士研究生期間發(fā)表文章及獲得獎(jiǎng)項(xiàng)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]世界衛(wèi)生組織關(guān)注的臨床重要細(xì)菌耐藥變遷:北京協(xié)和醫(yī)院10年數(shù)據(jù)分析[J]. 張小江,張輝,楊啟文,王瑤,王賀,孫宏莉,劉文靜,張麗,趙穎,劉亞麗,郭莉娜,竇紅濤,肖盟,徐英春. 協(xié)和醫(yī)學(xué)雜志. 2018(01)
[2]利奈唑胺耐藥腸球菌流行病學(xué)及耐藥機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 劉暢,孫宏莉. 臨床檢驗(yàn)雜志. 2018(01)
[3]萬(wàn)古霉素耐藥腸球菌流行現(xiàn)狀及防控措施[J]. 何淵慧,阮亙杰,鄭波. 中國(guó)感染控制雜志. 2017(09)
[4]2016年中國(guó)CHINET細(xì)菌耐藥性監(jiān)測(cè)[J]. 胡付品,郭燕,朱德妹,汪復(fù),蔣曉飛,徐英春,張小江,張朝霞,季萍,謝軼,康梅,王傳清,王愛(ài)敏,徐元宏,沈繼錄,孫自鏞,陳中舉,倪語(yǔ)星,孫景勇,褚云卓,田素飛,胡志東,李金,俞云松,林潔,單斌,杜艷,郭素芳,魏蓮花,鄒鳳梅,張泓,王春,胡云建,艾效曼,卓超,蘇丹虹,汪瑞忠,房華,俞碧霞,趙勇,龔萍,郭大文,趙金英,劉文恩,李艷明,金炎,邵春紅,溫開(kāi)鎮(zhèn),張貽榮,徐雪松,鄢超,喻華,黃湘寧,王山梅,楚亞菲,張利俠,馬娟,周樹(shù)平,周艷,朱鐳,孟晉華. 中國(guó)感染與化療雜志. 2017(05)
[5]腸球菌萬(wàn)古霉素高水平耐藥基因vanA、vanB、vanD和vanM快速分型檢測(cè)[J]. 林東昉,陳春輝,周迎,徐曉剛. 中華傳染病雜志. 2017 (02)
[6]43株利奈唑胺耐藥葡萄球菌耐藥機(jī)制研究[J]. 陳宏斌,黃加銘,楊青,馬曉波,張嶸,夏菲,趙峰,曹俊明,王曉娟,張雅薇,李曙光,王啟,張菲菲,王輝. 中華檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志. 2016 (11)
[7]腸球菌萬(wàn)古霉素耐藥基因簇遺傳特性[J]. 陳春輝,徐曉剛. 遺傳. 2015(05)
[8]腫瘤?漆t(yī)院惡性腫瘤院內(nèi)感染123例臨床分析[J]. 左麗,黃抗美,陶莉. 實(shí)用腫瘤雜志. 2012(01)
[9]耐萬(wàn)古霉素腸球菌感染防治專家共識(shí)[J]. 中華實(shí)驗(yàn)和臨床感染病雜志(電子版). 2010(02)
[10]耐萬(wàn)古霉素腸球菌醫(yī)院感染危險(xiǎn)因素分析[J]. 劉坤,李有信,杜曉玲. 中華醫(yī)院感染學(xué)雜志. 2007(08)
本文編號(hào):3246921
【文章來(lái)源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:136 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
前言
第一部分 中國(guó)萬(wàn)古霉素耐藥腸球菌耐藥性、毒力因子及同源性研究
材料與方法
1. 材料
2. 方法
2.1 菌種鑒定
2.2 藥敏實(shí)驗(yàn)
2.3 萬(wàn)古霉素耐藥基因和毒力因子基因檢測(cè)
2.4 基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(MALDI-TOF MS)篩查VREfm
2.5 Southern blot雜交
2.6 質(zhì)粒接合試驗(yàn)
2.7 分子流行病學(xué)分析
結(jié)果
1. 標(biāo)本類型及科室分布
2. 耐藥性
3. 毒力基因
4. 萬(wàn)古霉素耐藥基因及毒力基因水平傳遞研究
5. 分子同源性分析
討論
結(jié)論
第二部分 導(dǎo)致血流感染的萬(wàn)古霉素耐藥屎腸球菌全基因組測(cè)序分析
材料與方法
1. 菌株背景
2. 全基因組測(cè)序
結(jié)果
1. 基因預(yù)測(cè)和功能注釋
2. MLST分型
3. 核心基因組多位點(diǎn)序列分型(cgMLST)
4. 基于全基因組測(cè)序的單核苷酸多態(tài)性(wgSNP)研究
5. 表型預(yù)測(cè)
討論
結(jié)論
第三部分 萬(wàn)古霉素耐藥腸球菌血流感染臨床危險(xiǎn)因素分析
材料與方法
1. 研究對(duì)象
2. 病例資料的收集
3. 研究?jī)?nèi)容
4. 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
結(jié)果
1. 研究對(duì)象基本情況
2. 單因素條件logistic回歸分析
3. 多因素條件logistic回歸分析
討論
結(jié)論
全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
論文相關(guān)綜述
附錄1: 英漢縮略語(yǔ)名詞對(duì)照
附錄2: 博士研究生期間發(fā)表文章及獲得獎(jiǎng)項(xiàng)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]世界衛(wèi)生組織關(guān)注的臨床重要細(xì)菌耐藥變遷:北京協(xié)和醫(yī)院10年數(shù)據(jù)分析[J]. 張小江,張輝,楊啟文,王瑤,王賀,孫宏莉,劉文靜,張麗,趙穎,劉亞麗,郭莉娜,竇紅濤,肖盟,徐英春. 協(xié)和醫(yī)學(xué)雜志. 2018(01)
[2]利奈唑胺耐藥腸球菌流行病學(xué)及耐藥機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 劉暢,孫宏莉. 臨床檢驗(yàn)雜志. 2018(01)
[3]萬(wàn)古霉素耐藥腸球菌流行現(xiàn)狀及防控措施[J]. 何淵慧,阮亙杰,鄭波. 中國(guó)感染控制雜志. 2017(09)
[4]2016年中國(guó)CHINET細(xì)菌耐藥性監(jiān)測(cè)[J]. 胡付品,郭燕,朱德妹,汪復(fù),蔣曉飛,徐英春,張小江,張朝霞,季萍,謝軼,康梅,王傳清,王愛(ài)敏,徐元宏,沈繼錄,孫自鏞,陳中舉,倪語(yǔ)星,孫景勇,褚云卓,田素飛,胡志東,李金,俞云松,林潔,單斌,杜艷,郭素芳,魏蓮花,鄒鳳梅,張泓,王春,胡云建,艾效曼,卓超,蘇丹虹,汪瑞忠,房華,俞碧霞,趙勇,龔萍,郭大文,趙金英,劉文恩,李艷明,金炎,邵春紅,溫開(kāi)鎮(zhèn),張貽榮,徐雪松,鄢超,喻華,黃湘寧,王山梅,楚亞菲,張利俠,馬娟,周樹(shù)平,周艷,朱鐳,孟晉華. 中國(guó)感染與化療雜志. 2017(05)
[5]腸球菌萬(wàn)古霉素高水平耐藥基因vanA、vanB、vanD和vanM快速分型檢測(cè)[J]. 林東昉,陳春輝,周迎,徐曉剛. 中華傳染病雜志. 2017 (02)
[6]43株利奈唑胺耐藥葡萄球菌耐藥機(jī)制研究[J]. 陳宏斌,黃加銘,楊青,馬曉波,張嶸,夏菲,趙峰,曹俊明,王曉娟,張雅薇,李曙光,王啟,張菲菲,王輝. 中華檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志. 2016 (11)
[7]腸球菌萬(wàn)古霉素耐藥基因簇遺傳特性[J]. 陳春輝,徐曉剛. 遺傳. 2015(05)
[8]腫瘤?漆t(yī)院惡性腫瘤院內(nèi)感染123例臨床分析[J]. 左麗,黃抗美,陶莉. 實(shí)用腫瘤雜志. 2012(01)
[9]耐萬(wàn)古霉素腸球菌感染防治專家共識(shí)[J]. 中華實(shí)驗(yàn)和臨床感染病雜志(電子版). 2010(02)
[10]耐萬(wàn)古霉素腸球菌醫(yī)院感染危險(xiǎn)因素分析[J]. 劉坤,李有信,杜曉玲. 中華醫(yī)院感染學(xué)雜志. 2007(08)
本文編號(hào):3246921
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