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基于多重PCR和第二代高通量測序技術(shù)快速檢測下呼吸道感染病原微生物方法的建立和應(yīng)用

發(fā)布時(shí)間:2021-05-06 03:15
  目的針對引起下呼吸道感染的20種常見病原微生物,建立一種基于多重PCR和第二代高通量測序技術(shù)的快速、高通量檢測方法 AC-seq。方法經(jīng)生物信息學(xué)分析,設(shè)計(jì)20種下呼吸道感染常見病原微生物特異性引物并通過PCR評估引物的敏感性和特異性。建立可進(jìn)行第二代高通量測序技術(shù)的多重PCR擴(kuò)增體系。采集34例臨床肺泡灌洗液標(biāo)本,對檢測方法進(jìn)行初步測試,并與臨床培養(yǎng)結(jié)果進(jìn)行對比評估檢測效果。結(jié)果所有引物均具有良好的敏感性和特異性。在臨床標(biāo)本檢測中AC-seq共檢出13種病原微生物,培養(yǎng)法檢出8種;AC-seq檢測陽性率為79.41%,培養(yǎng)法為32.35%,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。AC-seq檢測靈敏度為100%,與培養(yǎng)法的一致率為50%。檢測時(shí)間比培養(yǎng)法縮短至少1d。結(jié)論基于多重PCR和第二代高通量測序技術(shù),成功建立了一種檢測下呼吸道感染20種常見病原微生物的快速、高通量的方法。 

【文章來源】:國際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志. 2020,41(17)

【文章頁數(shù)】:5 頁

【文章目錄】:
1 資料與方法
    1.1 一般資料
    1.2 儀器與試劑
    1.3 方法
        1.3.1 病原微生物培養(yǎng)與核酸提取
        1.3.2 引物設(shè)計(jì)
        1.3.3 引物驗(yàn)證
        1.3.4 AC-Seq法檢測方程
        1.3.5 靈敏度檢測
        1.3.6 臨床標(biāo)本鑒定
    1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
2 結(jié)果
    2.1 引物敏感性和特異性驗(yàn)證
    2.2 靈敏度檢測
    2.3 AC-Seq法檢測臨床標(biāo)本結(jié)果
    2.4 臨床標(biāo)本兩種方法檢測結(jié)果比較
3 討論
4 結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號:3171128

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