目的:掌握不同動物源和人源金黃色葡萄球菌（簡稱金葡菌）的耐藥和毒素基因流行情況;并比較不同來源菌株之間的分子型別和分子特征的差異,以揭示不同來源金葡菌的特異性表型和分子標志物。為預測動物相關金葡菌跨種屬傳播風險提供重要理論依據(jù),以有效控制和遏制動物相關金葡菌向人群傳播。方法:采用橫斷面研究設計,對廣東省珠三角地區(qū)4個城市（深圳市、佛山市、東莞市、江門市）的動物和人群進行鼻拭子采樣。所有金葡菌進行抗生素敏感性試驗,運用PCR擴增技術檢測耐藥基因（erm（A）/erm（C）、linA等）、超抗原毒素基因（中毒性休克綜合征毒素基因tsst1和腸毒素基因sea、seb、sec等）、免疫逃逸集群（IEC）基因（scn、chp、sak、sea、sep）、溶血毒素基因（hla、hlb、hld）殺白細胞毒素pvl基因、粘附因子相關基因（bbp、clfA、cna等）;應用多位點序列分型MLST實驗得到金葡菌的分子型別。采用χ²檢驗或者確切概率法、logistic回歸進行各組率的比較,通過對應分析揭示不同來源金葡菌中CC分型和表型-分子特征之間的對應關系。研究金葡菌來源（動物源、人源... 

【文章來源】：廣東藥科大學廣東省

【文章頁數(shù)】：100 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
第一章 前言
第二章 材料與方法
    2.1 倫理學
    2.2 研究對象
        2.2.1 人群樣本來源
        2.2.2 動物樣本來源
        2.2.3 估計樣本量
    2.3 標本收集
        2.3.1 人群標本的采集
        2.3.2 動物標本的采集
    2.4 主要培養(yǎng)基、試劑
        2.4.1 培養(yǎng)基
        2.4.2 試劑
        2.4.3 藥敏實驗材料
        2.4.4 PCR實驗材料
    2.5 金葡菌的分離鑒定
    2.6 金葡菌分子生物學實驗
        2.6.1 菌株DNA的提取
        2.6.2 菌株的分子分型和分子特征
        2.6.3 引物的設計
        2.6.4 反應體系
        2.6.5 擴增條件
        2.6.6 MLST分型和確定克隆復合體（CCs）
    2.7 金葡菌的抗菌藥物敏感性試驗
        2.7.1 藥敏紙片選取
        2.7.2 紙片擴散法實驗
        2.7.3 多藥耐藥性金葡菌
    2.8 相關定義
    2.9 數(shù)據(jù)分析
    2.10 質量控制
        2.10.1 現(xiàn)場采樣的質量控制
        2.10.2 實驗室的質量控制
第三章 結果
    3.1 人群和動物金葡菌（MRSA）菌株的克隆群分布情況
    3.2 動物源和人源金葡菌表型和分子特征的比較
        3.2.1 動物源和人源金葡菌的耐藥情況比較
        3.2.2 動物源和人源金葡菌的毒素基因攜帶情況比較
    3.3 動物源和人源MRSA表型和分子特征的比較
        3.3.1 動物源與人源MRSA的耐藥情況比較
        3.3.2 動物源和人源MRSA的毒素基因攜帶情況比較
    3.4 動物源和人源金葡菌克隆群與表型和分子特征的關聯(lián)性分析
        3.4.1 金葡菌克隆群與腸毒素基因數(shù)量的關聯(lián)性分析
        3.4.2 金葡菌克隆群與粘附基因數(shù)量的關聯(lián)性分析
        3.4.3 金葡菌克隆群與IEC基因數(shù)量的關聯(lián)性分析
        3.4.4 金葡克隆群與溶血毒素基因數(shù)量的關聯(lián)性分析
        3.4.5 克隆群與耐藥模式的關聯(lián)性分析
    3.5 隨機森林和分類與回歸樹探究不同來源菌株的表型和分子特征
        3.5.1 耐藥表型
        3.5.2 耐藥基因
        3.5.3 IEC基因
        3.5.4 腸毒素基因
        3.5.5 溶血毒素基因
        3.5.6 粘附因子基因
第四章 討論
    4.1 動物相關和社區(qū)相關菌株的流行克隆群
    4.2 菌株的分子分型與表型-分子特征間對應關系
    4.3 不同來源菌株的表型和分子特征標志
    4.4 本研究優(yōu)點與不足
第五章 結論
參考文獻
綜述
    參考文獻
致謝
攻讀碩士論文學位期間發(fā)表的論文


【參考文獻】：
期刊論文
[1]耐甲氧西林金黃色葡萄球菌不同來源株耐藥性及流行特征分析[J]. 趙紅慶,徐萍,周聲安,胡守奎.  疾病監(jiān)測. 2017(07)
[2]金黃色葡萄球菌基因組DNA提取方法的比較[J]. 蘇麗婷,梁景龍,郭小建,馮飛.  仲愷農業(yè)工程學院學報. 2011(01)



本文編號：3154430