靶向OXA23基因的CRISPR-Cas9載體系統(tǒng)構(gòu)建
發(fā)布時(shí)間:2021-02-28 10:08
目的:本研究以質(zhì)粒pet41a為載體骨架,通過雙酶切法從質(zhì)粒pwt-Cas9、pgRNA中獲得目的基因片段,構(gòu)建CRISPR-Cas9載體系統(tǒng),建立一種行之有效的基因編輯的載體,為研究細(xì)菌耐藥基因提供方法;使用熱轉(zhuǎn)化和電轉(zhuǎn)化兩種常用分子技術(shù)手段,制備感受態(tài)細(xì)胞并優(yōu)化轉(zhuǎn)化條件,獲得最大的轉(zhuǎn)化效率。方法:1.收集寧夏醫(yī)科大學(xué)總醫(yī)院2016-2017年臨床分離鑒定的鮑曼不動桿菌菌株105株。2.進(jìn)行藥敏及PCR技術(shù)篩選對卡那霉素敏感且含有OXA23基因的菌株。3.選擇質(zhì)粒pet41a、pgRNA和pwt-Cas9,分析質(zhì)粒核酸序列及酶切位點(diǎn)。使用限制性核酸內(nèi)切酶XhoI和BgiII分別酶切質(zhì)粒pet41a和pwt-Cas9,獲得具有相同粘性末端的線性質(zhì)粒片段,回收并用T4DNA連接酶連接,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細(xì)胞,轉(zhuǎn)化菌涂布含卡那霉素的固體LB培養(yǎng)基平板進(jìn)行陽性單克隆篩選并測序,構(gòu)建的質(zhì)粒命名為pet41-Cas9。使用BgiII和XbaI兩種限制性內(nèi)切酶分別酶切pet41-Cas9和pgRNA,經(jīng)回收純化、連接和轉(zhuǎn)化后篩選陽性單克隆菌落并測序,重組質(zhì)粒命名為pet41a-Cas9-s...
【文章來源】:寧夏醫(yī)科大學(xué)寧夏回族自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
OXA23基因PCR篩選鑒定
圖 2 質(zhì)粒 pET41a-Cas9-pgRNA 構(gòu)建流程圖ematic of construct recombinant plasmid: pET4表 3 質(zhì)粒酶切信息Tab 3 Information of enzyme cut內(nèi)切酶 目的片段大。╔hoI 和 BgiII 4131XhoI 和 BgiII 5805表 4 反應(yīng)體系Tab 4 Reaction system體積(μl)
雙酶切圖 4 重組質(zhì)粒 pet41a-Cas9 酶切驗(yàn)證Fig.4 Recombinant plasmid pet41a-Cas9 digestionM 為 DNA 標(biāo)志物 Cas9 為質(zhì)粒 pwt-Cas9 PCR 產(chǎn)物 1~15 隨機(jī)篩選菌落 16 空白對照圖 5 重組質(zhì)粒 pET41a-Cas9 的 PCR 篩選鑒定Fig.5 PCR identification of recombinant plasmid: pET41a-Cas9
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]碳青霉烯類耐藥鮑曼不動桿菌外排泵耐藥機(jī)制研究[J]. 吳偉清,張彥鵬,李卓成. 廣東醫(yī)學(xué). 2017(04)
[2]2005-2014年CHINET中國細(xì)菌耐藥性監(jiān)測網(wǎng)5種重要臨床分離菌的耐藥性變遷[J]. 胡付品,F.-P.Hu,Y.Guo,D.-M.Zhu,F.Wang,X.-F.Jiang,Y.-C.Xu,X.-J.Zhang,C.-X.Zhang,P.Ji,Y.Xie,M.Kang,C.-Q.Wang,A.-M.Wang,Y.-H.Xu,J.-L.Shen,Z.-Y.Sun,Z.-J.Chen,Y.-X.Ni,J.-Y.Sun,Y.-Z.Chu,S.-F.Tian,Z.-D.Hu,J.-Li,Y.-S.Yu,J.Lin,B.Shan,Y.Du,Y.Han,S.Guo,L.-H.Wei,L.Wu,H.Zhang,J.Kong,Y.-J.Hu,X.-M.Ai,C.Zhuo,D.-H.Su,Q.Yang,B.Jia,W.Huang. 中國感染與化療雜志. 2017(01)
[3]一步法制備大腸桿菌BL21(DE3)菌株感受態(tài)細(xì)胞及轉(zhuǎn)化條件優(yōu)化[J]. 張跡,李智,張宇,袁巧云. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(12)
[4]CRISPR/Cas9基因組編輯技術(shù)及其在動物基因組定點(diǎn)修飾中的應(yīng)用[J]. 周金偉,徐綺嬪,姚婧,余樹民,曹隨忠. 遺傳. 2015(10)
[5]大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞制備及轉(zhuǎn)化條件優(yōu)化[J]. 代軍. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(04)
[6]CRISPR/Cas9介導(dǎo)的基因組定點(diǎn)編輯技術(shù)[J]. 方銳,暢飛,孫照霖,李寧,孟慶勇. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2013(08)
[7]制備高效大腸桿菌電轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞和電轉(zhuǎn)化條件的研究[J]. 朱森康,黃磊,李燕飛,鐘衛(wèi)鴻,徐志南. 生物技術(shù)通報(bào). 2011(10)
[8]產(chǎn)OXA-23型碳青霉烯酶鮑氏不動桿菌引起醫(yī)院感染的研究[J]. 王歡,沈定霞,閆中強(qiáng),曹敬榮,劉朝軍,陳榮,蔣偉. 中華醫(yī)院感染學(xué)雜志. 2011(08)
本文編號:3055698
【文章來源】:寧夏醫(yī)科大學(xué)寧夏回族自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
OXA23基因PCR篩選鑒定
圖 2 質(zhì)粒 pET41a-Cas9-pgRNA 構(gòu)建流程圖ematic of construct recombinant plasmid: pET4表 3 質(zhì)粒酶切信息Tab 3 Information of enzyme cut內(nèi)切酶 目的片段大。╔hoI 和 BgiII 4131XhoI 和 BgiII 5805表 4 反應(yīng)體系Tab 4 Reaction system體積(μl)
雙酶切圖 4 重組質(zhì)粒 pet41a-Cas9 酶切驗(yàn)證Fig.4 Recombinant plasmid pet41a-Cas9 digestionM 為 DNA 標(biāo)志物 Cas9 為質(zhì)粒 pwt-Cas9 PCR 產(chǎn)物 1~15 隨機(jī)篩選菌落 16 空白對照圖 5 重組質(zhì)粒 pET41a-Cas9 的 PCR 篩選鑒定Fig.5 PCR identification of recombinant plasmid: pET41a-Cas9
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]碳青霉烯類耐藥鮑曼不動桿菌外排泵耐藥機(jī)制研究[J]. 吳偉清,張彥鵬,李卓成. 廣東醫(yī)學(xué). 2017(04)
[2]2005-2014年CHINET中國細(xì)菌耐藥性監(jiān)測網(wǎng)5種重要臨床分離菌的耐藥性變遷[J]. 胡付品,F.-P.Hu,Y.Guo,D.-M.Zhu,F.Wang,X.-F.Jiang,Y.-C.Xu,X.-J.Zhang,C.-X.Zhang,P.Ji,Y.Xie,M.Kang,C.-Q.Wang,A.-M.Wang,Y.-H.Xu,J.-L.Shen,Z.-Y.Sun,Z.-J.Chen,Y.-X.Ni,J.-Y.Sun,Y.-Z.Chu,S.-F.Tian,Z.-D.Hu,J.-Li,Y.-S.Yu,J.Lin,B.Shan,Y.Du,Y.Han,S.Guo,L.-H.Wei,L.Wu,H.Zhang,J.Kong,Y.-J.Hu,X.-M.Ai,C.Zhuo,D.-H.Su,Q.Yang,B.Jia,W.Huang. 中國感染與化療雜志. 2017(01)
[3]一步法制備大腸桿菌BL21(DE3)菌株感受態(tài)細(xì)胞及轉(zhuǎn)化條件優(yōu)化[J]. 張跡,李智,張宇,袁巧云. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(12)
[4]CRISPR/Cas9基因組編輯技術(shù)及其在動物基因組定點(diǎn)修飾中的應(yīng)用[J]. 周金偉,徐綺嬪,姚婧,余樹民,曹隨忠. 遺傳. 2015(10)
[5]大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞制備及轉(zhuǎn)化條件優(yōu)化[J]. 代軍. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(04)
[6]CRISPR/Cas9介導(dǎo)的基因組定點(diǎn)編輯技術(shù)[J]. 方銳,暢飛,孫照霖,李寧,孟慶勇. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2013(08)
[7]制備高效大腸桿菌電轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞和電轉(zhuǎn)化條件的研究[J]. 朱森康,黃磊,李燕飛,鐘衛(wèi)鴻,徐志南. 生物技術(shù)通報(bào). 2011(10)
[8]產(chǎn)OXA-23型碳青霉烯酶鮑氏不動桿菌引起醫(yī)院感染的研究[J]. 王歡,沈定霞,閆中強(qiáng),曹敬榮,劉朝軍,陳榮,蔣偉. 中華醫(yī)院感染學(xué)雜志. 2011(08)
本文編號:3055698
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