人星狀病毒、腸道腺病毒雙重實(shí)時(shí)熒光RT-PCR方法的建立及應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2021-02-14 07:53
人星狀病毒(Human astrovirus,HAstV)、腸道腺病毒(Enteric adenovirus,EAdV)是引起急性胃腸炎的兩種常見病原體,目前尚未實(shí)現(xiàn)這兩種病原體熒光定量RT-PCR的單管雙重檢測(cè)。為建立一種靈敏特異的雙重?zé)晒舛縍T-PCR檢測(cè)方法并應(yīng)用于實(shí)驗(yàn)室樣本檢測(cè),本研究選擇HAstV、EAdV特異性引物和探針,優(yōu)化反應(yīng)體系和反應(yīng)條件,并對(duì)該方法的靈敏性、特異性和穩(wěn)定性進(jìn)行評(píng)價(jià)。結(jié)果顯示,該方法針對(duì)HAstV和EAdV的檢出限分別可以達(dá)到522拷貝/μL和53.5拷貝/μL;與多種常見和罕見的人腹瀉病毒沒有交叉反應(yīng);批內(nèi)和批間等重復(fù)性實(shí)驗(yàn)變異系數(shù)均小于5%;靈敏度高于常規(guī)PCR。本研究提示,建立的HAstV、EAdV雙重?zé)晒舛縍T-PCR檢測(cè)方法具有較好的靈敏度、特異性和穩(wěn)定性,可用于實(shí)驗(yàn)室HAstV和EAdV的快速篩查。
【文章來源】:病毒學(xué)報(bào). 2020,36(05)北大核心
【文章頁數(shù)】:10 頁
【文章目錄】:
材料與方法
1標(biāo)本來源
2主要試劑和儀器
3 Taq Man探針和雙向引物
4常規(guī)PCR雙向引物
5病毒核酸提取
6質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品制備
7 HAst VRNA標(biāo)準(zhǔn)品的制備
8 EAd VDNA標(biāo)準(zhǔn)品的制備
9雙重?zé)晒舛縍T-PCR反應(yīng)體系的建立和優(yōu)化
10敏感性實(shí)驗(yàn)
11特異性實(shí)驗(yàn)
12穩(wěn)定性實(shí)驗(yàn)
13方法學(xué)一致性評(píng)價(jià)
14隨機(jī)盲樣評(píng)價(jià)
15臨床應(yīng)用
結(jié)果
1熒光定量RT-PCR反應(yīng)體系的建立和優(yōu)化
2敏感性實(shí)驗(yàn)
3特異性實(shí)驗(yàn)
4穩(wěn)定性實(shí)驗(yàn)
5臨床樣本檢測(cè)方法學(xué)一致性評(píng)價(jià)
6臨床樣本檢測(cè)隨機(jī)盲樣檢測(cè)
7臨床應(yīng)用
討論
本文編號(hào):3033374
【文章來源】:病毒學(xué)報(bào). 2020,36(05)北大核心
【文章頁數(shù)】:10 頁
【文章目錄】:
材料與方法
1標(biāo)本來源
2主要試劑和儀器
3 Taq Man探針和雙向引物
4常規(guī)PCR雙向引物
5病毒核酸提取
6質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品制備
7 HAst VRNA標(biāo)準(zhǔn)品的制備
8 EAd VDNA標(biāo)準(zhǔn)品的制備
9雙重?zé)晒舛縍T-PCR反應(yīng)體系的建立和優(yōu)化
10敏感性實(shí)驗(yàn)
11特異性實(shí)驗(yàn)
12穩(wěn)定性實(shí)驗(yàn)
13方法學(xué)一致性評(píng)價(jià)
14隨機(jī)盲樣評(píng)價(jià)
15臨床應(yīng)用
結(jié)果
1熒光定量RT-PCR反應(yīng)體系的建立和優(yōu)化
2敏感性實(shí)驗(yàn)
3特異性實(shí)驗(yàn)
4穩(wěn)定性實(shí)驗(yàn)
5臨床樣本檢測(cè)方法學(xué)一致性評(píng)價(jià)
6臨床樣本檢測(cè)隨機(jī)盲樣檢測(cè)
7臨床應(yīng)用
討論
本文編號(hào):3033374
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