基因檢測報(bào)告系統(tǒng)的開發(fā)
發(fā)布時(shí)間:2021-01-04 18:06
背景:近年來隨著國家經(jīng)濟(jì)的大力發(fā)展,所帶來生活方式上的轉(zhuǎn)變越來越大,人們不再一味地追求物質(zhì)上的滿足,轉(zhuǎn)而更看重精神和身體上的健康。此時(shí),基因檢測技術(shù),這個(gè)能夠從人類最根本的遺傳信息中,獲得有用的信息,并加工處理,產(chǎn)生可閱讀的,可理解數(shù)據(jù)的技術(shù)孕育而生。通過測序獲得的大量遺傳信息,運(yùn)用實(shí)驗(yàn)和對比獲得與特定性狀相關(guān)的等位基因位點(diǎn),這些等位基因位點(diǎn)因?yàn)楦鞣N原因,導(dǎo)致等位基因多態(tài)性的產(chǎn)生,進(jìn)而影響相關(guān)性狀的表達(dá)結(jié)果;谶@些表達(dá)結(jié)果不同,建立與之相關(guān)的基因數(shù)據(jù)庫,將待檢測者遺傳信息與數(shù)據(jù)庫比較獲得基因控制性狀的影響程度結(jié)果,進(jìn)而在診斷疾病和能力基因的檢測等方面,提供較為客觀的建議。在這其中SNP起到了非同一般的作用。通過基因檢測的結(jié)果,與SNP數(shù)據(jù)庫比較,得出其相關(guān)的性狀對于檢測者所造成的影響結(jié)果,給出一份檢測報(bào)告,能夠直觀的反映待檢測者對于其感興趣性狀及其相關(guān)基因所帶來的影響結(jié)果,并給與一定專業(yè)知識的解讀和建議,這是該技術(shù)產(chǎn)業(yè)如此受到大力追捧的原因。但是基因檢測報(bào)告在生產(chǎn)過程中還有很多問題,包括:(1)報(bào)告流程的不成熟,效率低速度慢。(2)給與的建議解釋大相徑庭,很難有信服力(3)報(bào)告排版模...
【文章來源】:東華大學(xué)上海市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:79 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
LinLinux系統(tǒng)誕生于1991
關(guān)的名言是 用一種方法,最好是只有一種方法來做一件事·,這就讓一般不是聰明的人擁有了像別人一樣能夠有機(jī)會(huì)做到編程這一可望而不可即的事情。當(dāng)這也會(huì)造成一些缺點(diǎn)[33]。Python 會(huì)避開一些優(yōu)化。非重要補(bǔ)丁不合并在 Python。因此多數(shù)人覺得 Python 很慢。但是對于一般要求也是足夠用的,而且還有ypy 作為補(bǔ)充,完全能夠滿足程序員的需求[34]。Python 是完全面向?qū)ο蟮恼Z言。函數(shù)、模塊等都是對象。為了方便大家的編,Python 會(huì)提供方法支持增強(qiáng)源代碼的重復(fù)使用包括繼承等方法[35]。并且ython 本身可擴(kuò)充的。Python 有很多方法能夠?qū)⑵渌Z言通過編寫模塊實(shí)現(xiàn)通。還有 Python 具有集成和封裝功能,也可以解決上述問題。Python 最開始的適用版本是 Python2.70 版本這也是大多數(shù)系統(tǒng)所承認(rèn)的最使用的,當(dāng)然現(xiàn)在隨著 Python3.0 版本的出現(xiàn),數(shù)據(jù)庫和系統(tǒng)包括幫助 Python用的 Python 社區(qū)也逐漸開始向 3.0 版本轉(zhuǎn)變,版本之間的區(qū)別對于使用者來說語法有些差異,要注意使用,現(xiàn)在使用的是 Python3.0 版本的,因希望能長時(shí)使用。下載網(wǎng)址:https://www.baidu.com/s?wd=Python3.0 版本[36]。圖 2 為下載址界面。
圖 3 Atom 下載截圖3.3LaTeX 語言(編譯報(bào)告模版語言)編譯的語言使用的是 latex 語言,與以往經(jīng)常使用的 word 工具是有區(qū)別的,為 LaTeX 不僅能夠排版出來所需要的報(bào)告,且版型多變,整潔美觀,配合相軟件能直接生成 pdf 格式文件,排版,不出現(xiàn)亂碼情況[39]。從許多論文和報(bào)告采用這種語言作為編譯語言就能發(fā)現(xiàn)其實(shí)用性被很多人接受,所以使用這種語作為主要編譯語言。LaTeX,是以 TEX 為基礎(chǔ)所構(gòu)建的全新的排版系統(tǒng),由美國人 Leslie Lamport 1978 年開發(fā),使用這種格式,可以使得使用者在不需要多少相關(guān)基礎(chǔ)知識的況下,仍然可以使用 TEX,能在很短的時(shí)間內(nèi)快速生成大量具有書籍質(zhì)量的刷品[40]。[19]LaTeX 是將 TEX 作為其構(gòu)建基礎(chǔ)的,現(xiàn)有版本為 LaTeX2ε。使 LaTeX 能夠直接對相關(guān)版面進(jìn)行操作,產(chǎn)生相關(guān)文檔,且造型美觀大方。TEX夠提供作為版面設(shè)計(jì)的命令,缺點(diǎn)是使用時(shí)較為不方便,效率不高。而 LaTeX作為開發(fā)了的 TEX 擴(kuò)展命令的集合。能夠?qū)⒃居械娜秉c(diǎn)去掉,LaTeX 通過合設(shè)置操作,已達(dá)到減少工作量的目的。因?yàn)?LaTeX 足夠強(qiáng)的排版功能,尤
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]SNP技術(shù)的研究進(jìn)展及相關(guān)應(yīng)用[J]. 朱海艷,徐燕紅,杜杰,姚向位,李政東,翁一鳴. 科技創(chuàng)新與生產(chǎn)力. 2019(02)
[2]使用Python語言的GUI可視化編程設(shè)計(jì)[J]. 耿穎. 單片機(jī)與嵌入式系統(tǒng)應(yīng)用. 2019(02)
[3]嵌入式Linux操作系統(tǒng)的開發(fā)及應(yīng)用[J]. 袁帥,代連奇,譚洪旭,任利峰. 產(chǎn)業(yè)與科技論壇. 2018(24)
[4]Python腳本在shape文件中的運(yùn)用[J]. 楊勤信,楊德宏. 軟件. 2018(12)
[5]Linux系統(tǒng)安全與加固[J]. 劉仁維,李杜,翟琛. 網(wǎng)絡(luò)安全技術(shù)與應(yīng)用. 2018(11)
[6]第二代測序技術(shù)在實(shí)體瘤診治方面的研究進(jìn)展[J]. 李妍,徐興祥. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2018(24)
[7]基于專利情報(bào)的基因檢測產(chǎn)業(yè)全球競爭態(tài)勢分析[J]. 何雋,張虹穎. 情報(bào)雜志. 2018(11)
[8]可視化LaTeX編輯軟件LyX在科技期刊論文排版中的應(yīng)用[J]. 黃嵐. 中國科技期刊研究. 2018(01)
[9]基于Linux名字空間的Web服務(wù)器動(dòng)態(tài)防御方法[J]. 陳剛,郭玉東,魏小鋒. 計(jì)算機(jī)應(yīng)用. 2017(12)
[10]基因檢測產(chǎn)業(yè)成為我國經(jīng)濟(jì)發(fā)展新動(dòng)能的重要力量[J]. 中國戰(zhàn)略新興產(chǎn)業(yè). 2017(41)
本文編號:2957187
【文章來源】:東華大學(xué)上海市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:79 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
LinLinux系統(tǒng)誕生于1991
關(guān)的名言是 用一種方法,最好是只有一種方法來做一件事·,這就讓一般不是聰明的人擁有了像別人一樣能夠有機(jī)會(huì)做到編程這一可望而不可即的事情。當(dāng)這也會(huì)造成一些缺點(diǎn)[33]。Python 會(huì)避開一些優(yōu)化。非重要補(bǔ)丁不合并在 Python。因此多數(shù)人覺得 Python 很慢。但是對于一般要求也是足夠用的,而且還有ypy 作為補(bǔ)充,完全能夠滿足程序員的需求[34]。Python 是完全面向?qū)ο蟮恼Z言。函數(shù)、模塊等都是對象。為了方便大家的編,Python 會(huì)提供方法支持增強(qiáng)源代碼的重復(fù)使用包括繼承等方法[35]。并且ython 本身可擴(kuò)充的。Python 有很多方法能夠?qū)⑵渌Z言通過編寫模塊實(shí)現(xiàn)通。還有 Python 具有集成和封裝功能,也可以解決上述問題。Python 最開始的適用版本是 Python2.70 版本這也是大多數(shù)系統(tǒng)所承認(rèn)的最使用的,當(dāng)然現(xiàn)在隨著 Python3.0 版本的出現(xiàn),數(shù)據(jù)庫和系統(tǒng)包括幫助 Python用的 Python 社區(qū)也逐漸開始向 3.0 版本轉(zhuǎn)變,版本之間的區(qū)別對于使用者來說語法有些差異,要注意使用,現(xiàn)在使用的是 Python3.0 版本的,因希望能長時(shí)使用。下載網(wǎng)址:https://www.baidu.com/s?wd=Python3.0 版本[36]。圖 2 為下載址界面。
圖 3 Atom 下載截圖3.3LaTeX 語言(編譯報(bào)告模版語言)編譯的語言使用的是 latex 語言,與以往經(jīng)常使用的 word 工具是有區(qū)別的,為 LaTeX 不僅能夠排版出來所需要的報(bào)告,且版型多變,整潔美觀,配合相軟件能直接生成 pdf 格式文件,排版,不出現(xiàn)亂碼情況[39]。從許多論文和報(bào)告采用這種語言作為編譯語言就能發(fā)現(xiàn)其實(shí)用性被很多人接受,所以使用這種語作為主要編譯語言。LaTeX,是以 TEX 為基礎(chǔ)所構(gòu)建的全新的排版系統(tǒng),由美國人 Leslie Lamport 1978 年開發(fā),使用這種格式,可以使得使用者在不需要多少相關(guān)基礎(chǔ)知識的況下,仍然可以使用 TEX,能在很短的時(shí)間內(nèi)快速生成大量具有書籍質(zhì)量的刷品[40]。[19]LaTeX 是將 TEX 作為其構(gòu)建基礎(chǔ)的,現(xiàn)有版本為 LaTeX2ε。使 LaTeX 能夠直接對相關(guān)版面進(jìn)行操作,產(chǎn)生相關(guān)文檔,且造型美觀大方。TEX夠提供作為版面設(shè)計(jì)的命令,缺點(diǎn)是使用時(shí)較為不方便,效率不高。而 LaTeX作為開發(fā)了的 TEX 擴(kuò)展命令的集合。能夠?qū)⒃居械娜秉c(diǎn)去掉,LaTeX 通過合設(shè)置操作,已達(dá)到減少工作量的目的。因?yàn)?LaTeX 足夠強(qiáng)的排版功能,尤
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]SNP技術(shù)的研究進(jìn)展及相關(guān)應(yīng)用[J]. 朱海艷,徐燕紅,杜杰,姚向位,李政東,翁一鳴. 科技創(chuàng)新與生產(chǎn)力. 2019(02)
[2]使用Python語言的GUI可視化編程設(shè)計(jì)[J]. 耿穎. 單片機(jī)與嵌入式系統(tǒng)應(yīng)用. 2019(02)
[3]嵌入式Linux操作系統(tǒng)的開發(fā)及應(yīng)用[J]. 袁帥,代連奇,譚洪旭,任利峰. 產(chǎn)業(yè)與科技論壇. 2018(24)
[4]Python腳本在shape文件中的運(yùn)用[J]. 楊勤信,楊德宏. 軟件. 2018(12)
[5]Linux系統(tǒng)安全與加固[J]. 劉仁維,李杜,翟琛. 網(wǎng)絡(luò)安全技術(shù)與應(yīng)用. 2018(11)
[6]第二代測序技術(shù)在實(shí)體瘤診治方面的研究進(jìn)展[J]. 李妍,徐興祥. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2018(24)
[7]基于專利情報(bào)的基因檢測產(chǎn)業(yè)全球競爭態(tài)勢分析[J]. 何雋,張虹穎. 情報(bào)雜志. 2018(11)
[8]可視化LaTeX編輯軟件LyX在科技期刊論文排版中的應(yīng)用[J]. 黃嵐. 中國科技期刊研究. 2018(01)
[9]基于Linux名字空間的Web服務(wù)器動(dòng)態(tài)防御方法[J]. 陳剛,郭玉東,魏小鋒. 計(jì)算機(jī)應(yīng)用. 2017(12)
[10]基因檢測產(chǎn)業(yè)成為我國經(jīng)濟(jì)發(fā)展新動(dòng)能的重要力量[J]. 中國戰(zhàn)略新興產(chǎn)業(yè). 2017(41)
本文編號:2957187
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