高毒力肺炎克雷伯菌基因組序列分析及其與中性粒細(xì)胞的作用機(jī)制研究
發(fā)布時間:2020-12-24 02:49
背景:高毒力肺炎克雷伯菌(HypervirulentKlebsiella pneumoniae,HvKP)常導(dǎo)致健康人群的嚴(yán)重社區(qū)獲得性感染,而且感染易于發(fā)生多部位的播散。HvKP菌株具有較厚的莢膜,攜帶rmpA和aerobactin等毒力基因,毒力明顯高于普通肺炎克雷伯菌(classic Klebsiellapneumoniae,cKP)。中性粒細(xì)胞可以通過胞內(nèi)吞噬和胞外釋放中性粒細(xì)胞胞外誘捕網(wǎng)(Neutrophil extracellular traps,NETs)2種途徑抵抗病原微生物的感染。為了揭示HvKP高毒力和高致病性的機(jī)制,選取了 6株HvKP進(jìn)行第三代測序和分析,并進(jìn)一步研究人體中性粒細(xì)胞在抗HvKP感染中的作用。方法:選取不同莢膜血清分型的6株HvKP菌株(K1、K2、K57型HvKP各2株),利用PacBio第三代單分子實(shí)時測序技術(shù)(SMRT)進(jìn)行測序,主要從毒力基因、耐藥基因兩方面展開分析,探索HvKP高致病性及高毒力的遺傳基礎(chǔ)。根據(jù)黏液絲試驗、莢膜血清分型、rmpA和aerobactin基因檢測結(jié)果,本研究共篩選了 45株肺炎克雷伯菌,包括16株HvKP-K1、...
【文章來源】:中國人民解放軍醫(yī)學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:94 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1?6株HvKP基因組圈圖??大圈為染色體基因組,小圈為質(zhì)粒基因組??
大圈為染色體基因組,小圈為質(zhì);蚪M??3.5測序菌株染色體與質(zhì)粒基因功能聚類??本研究中6株HvKP的染色體基因功能聚類無明顯差別(圖2A),但是對質(zhì);??因的功能聚類發(fā)現(xiàn),除編號為11305菌株外,其他5株測序菌株質(zhì)粒上多數(shù)基因與菌??株毒力、致病性、抗性以及鐵載體相關(guān)(圖2B),可見質(zhì)粒在肺炎克雷伯菌中發(fā)揮重??要的作用。值得注意的是,編號為11305菌株的質(zhì);蚪M序列與其他5個菌株差別??較大,此菌株缺失了與毒力緊密相關(guān)的rm/M基因,攜帶一個耐藥性質(zhì)粒,該質(zhì)粒上??含有編碼耐碳青霉烯類、氨基糖苷類和喹諾酮類藥物的耐藥基因??和gw?沿
基因(編號為11420和11492)以及編碼聚酮肽基因毒素(colibactin)的??c歷基因(編號為11420、11492和KP52.145),但cKP均不含有編碼微菌素的mce??基因和編碼colibactin的基因(見圖4)。??進(jìn)一步對KJ、K2、K57型HvKP菌株和cKP菌株的毒力基因數(shù)量進(jìn)行統(tǒng)計,結(jié)??果顯示,編號為11420菌株含有75個毒力基因,編號為11492菌株含有69個毒力基??因,編號為11454菌株含有22個毒力基因,編號為11305菌株含有9個毒力基因,??編號為11311和23菌株均含有18個毒力。分析結(jié)果顯示K1型HvKP菌株(編號為??11420和11492)含有的毒力基因數(shù)量最多,其次為K2型、K57型(圖5)。??/??\?f?^?廣?x??p——?^?^?1|?爾2??;1?15??r?i^s^BaM^giaBaaaBgMBosg^^^BS^MiB?sfeg??Vi?'i""i?"iiJ[f"
本文編號:2934832
【文章來源】:中國人民解放軍醫(yī)學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:94 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1?6株HvKP基因組圈圖??大圈為染色體基因組,小圈為質(zhì)粒基因組??
大圈為染色體基因組,小圈為質(zhì);蚪M??3.5測序菌株染色體與質(zhì)粒基因功能聚類??本研究中6株HvKP的染色體基因功能聚類無明顯差別(圖2A),但是對質(zhì);??因的功能聚類發(fā)現(xiàn),除編號為11305菌株外,其他5株測序菌株質(zhì)粒上多數(shù)基因與菌??株毒力、致病性、抗性以及鐵載體相關(guān)(圖2B),可見質(zhì)粒在肺炎克雷伯菌中發(fā)揮重??要的作用。值得注意的是,編號為11305菌株的質(zhì);蚪M序列與其他5個菌株差別??較大,此菌株缺失了與毒力緊密相關(guān)的rm/M基因,攜帶一個耐藥性質(zhì)粒,該質(zhì)粒上??含有編碼耐碳青霉烯類、氨基糖苷類和喹諾酮類藥物的耐藥基因??和gw?沿
基因(編號為11420和11492)以及編碼聚酮肽基因毒素(colibactin)的??c歷基因(編號為11420、11492和KP52.145),但cKP均不含有編碼微菌素的mce??基因和編碼colibactin的基因(見圖4)。??進(jìn)一步對KJ、K2、K57型HvKP菌株和cKP菌株的毒力基因數(shù)量進(jìn)行統(tǒng)計,結(jié)??果顯示,編號為11420菌株含有75個毒力基因,編號為11492菌株含有69個毒力基??因,編號為11454菌株含有22個毒力基因,編號為11305菌株含有9個毒力基因,??編號為11311和23菌株均含有18個毒力。分析結(jié)果顯示K1型HvKP菌株(編號為??11420和11492)含有的毒力基因數(shù)量最多,其次為K2型、K57型(圖5)。??/??\?f?^?廣?x??p——?^?^?1|?爾2??;1?15??r?i^s^BaM^giaBaaaBgMBosg^^^BS^MiB?sfeg??Vi?'i""i?"iiJ[f"
本文編號:2934832
本文鏈接:http://sikaile.net/linchuangyixuelunwen/2934832.html
最近更新
教材專著