大鼠腮腺組織放射后差異表達(dá)基因譜的構(gòu)建及生物信息學(xué)分析
本文關(guān)鍵詞:大鼠腮腺組織放射后差異表達(dá)基因譜的構(gòu)建及生物信息學(xué)分析,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:目的探討全基因芯片對放射后腮腺組織表達(dá)譜的差異及相關(guān)生物信息學(xué)的重要基因、通路。方法選用SD大鼠12只,隨機(jī)分為空白組和放射組,每組各6只,一次性給予放射組60Co γ射線15Gy的局部照射,空白組大鼠只腹腔注射10%水合氯醛。照射后2 h,無菌條件下迅速取出大鼠腮腺,投入液氮冷卻。將提取的腮腺組織的總RNA進(jìn)行Cye Dye Labeling熒光標(biāo)定及Phalanx One ArrayTM雜交反應(yīng),利用含有20717個基因的ROAv2 Rat Ooe Array全基因表達(dá)譜芯片進(jìn)行差異基因的篩選,將|log2(Ratio)|≥1作為篩選閾值。對篩選出的差異基因進(jìn)行GO功能分類和Pathway通路分析。結(jié)果差異表達(dá)基因913條,上調(diào)基因455個,下調(diào)基因458個。將差異基因的功能概括為13類,包括代謝、細(xì)胞死亡、轉(zhuǎn)錄、應(yīng)激等相關(guān)基因。對913個基因的Pathway通路有顯著改變的通路共有13條,包括75個差異表達(dá)基因,其中7個涉及13條改變通路:Akt1、Pik3r1、Pik3cg、Nfkbia、Kras、Mapk13、Casp8。結(jié)論~(60)Co γ射線可使正常的大鼠腮腺組織中的基因表達(dá)水平發(fā)生改變。Akt1、Nfkbia、TPM1在放射后腮腺組織中的的基因表達(dá)改變有待于進(jìn)一步研究。
【作者單位】: 廣西醫(yī)科大學(xué);
【關(guān)鍵詞】: 腮腺 放射效應(yīng) 基因表達(dá) 腫瘤
【分類號】:R739.91
【正文快照】: 及生物信息學(xué)分析頭頸部惡性腫瘤是常見的腫瘤之一,目前最常用的治療方法:手術(shù)治療、放射療法和化學(xué)藥物治療[1]。放射治療常規(guī)治療方法之一。接受放射治療后,生存率和治愈率大幅度提高,對局部復(fù)發(fā)、腫瘤遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)起到一定的抑制作用。同時放射線又是腫瘤的致病因素之一。放射線
【相似文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前8條
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本文編號:267451
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