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吸毒人群MRS分布特征及其影響因素

發(fā)布時間:2020-04-25 10:51
【摘要】:目的評估廣州市吸毒人群的耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(methicillinresistant Staphylococcus aureus,MRSA)及耐甲氧西林凝固酶陰性葡萄球菌(methicillin-resistant coagulase-negative staphylococci,MRCoNS)(合稱耐甲氧西林葡萄球菌,methicillin-resistant Staphylococcus,MRS)的攜帶狀況,探究影響吸毒人群MRS攜帶的危險因素,掌握菌株的耐藥譜和分子特征,為采取有效的預(yù)防控制措施以遏制吸毒人群MRSA與MRCoNS的流行和傳播提供科學(xué)依據(jù)。方法本研究采用橫斷面研究設(shè)計,通過方便抽樣的方法選取廣州市海珠區(qū)、越秀區(qū)3個美沙酮門診的吸毒人員為調(diào)查對象,采用自制調(diào)查問卷對其進行問卷調(diào)查與鼻拭子采樣。通過實驗室標準方法和PCR擴增特征基因分離鑒定金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,S.aureus,簡稱SA)和凝固酶陰性葡萄球菌(coagulase-negative staphylococci,CoNS)菌株;采用Kirby-Bauer紙片擴散法對分離的SA和CoNS菌株進行12種抗生素的藥敏試驗;利用PCR技術(shù)檢測SA和CoNS的DNA中mecA基因、毒素基因和耐藥基因;通過葡萄球菌染色體盒(Staphylococcal Cassette Chromosome mec,SCCmec)分型技術(shù)確定MRSA型別特征,采用多位點序列分型(multilocus sequencing typing,MLST)技術(shù)分析SA的分子分型。MRSA與MRCoNS危險因素單因素分析采用χ2檢驗確切概率法,P0.10的因素納入非條件Logistic回歸模型進行多因素分析。耐藥表型、基因型以及毒素基因的分析采用非條件Logistic回歸或確切Logistic回歸法。統(tǒng)計學(xué)檢驗均為雙側(cè)檢驗,P0.05表示具有統(tǒng)計學(xué)意義。采用eBURST V3軟件與樹狀圖分析軟件對本研究分離出的菌株之間,以及與國際流行菌株的親緣關(guān)系進行分析。結(jié)果人口學(xué)特征:本研究共調(diào)查353名吸毒人員,平均年齡50.75±6.09歲,調(diào)查對象均是漢族人,其中男性占87.54%,廣州戶籍占95.47%。MRSA及MRCoNS鼻腔攜帶率及危險因素:353名吸毒人員中,53名(15.01%)攜帶SA,其中24名攜帶MRSA,總體攜帶率為6.80%;151名(42.78%)攜帶CoNS,其中103名攜帶MRCoNS,總體攜帶率為(29.18%)。鼻腔攜帶SA的多因素分析提示,肥胖(aOR=3.018,95%CI,1.550-16.305)是吸毒人員鼻腔攜帶SA的危險因素。MRSA攜帶的多因素分析結(jié)果表明,近一年住院(aOR=2.959,95%CI,1.056-8.290)是吸毒人員鼻腔攜帶MRSA的危險因素。鼻腔攜帶CoNS的多因素分析提示,有監(jiān)禁史(aOR=1.851,95%CI,1.031-3.323)是吸毒人員鼻腔攜帶CoNS的危險因素。MRCoNS攜帶的多因素分析結(jié)果表明,已婚(aOR=0.547,95%CI,0.309-0.967)是吸毒人員鼻腔攜帶MRCoNS的保護因素,而監(jiān)禁史(aOR=2.533,95%CI,1.161-4.726)是吸毒人員鼻腔攜帶MRCoNS的危險因素。毒素基因和耐藥基因檢測:MRSA中毒素基因攜帶以seg基因(54.17%)為主,其次為sed基因(45.83%)、sei基因(37.50%)、selk基因(33.33%)和selu基因(29.17%)。沒有檢出sea基因、seb基因和see基因。耐藥基因攜帶以blaZ基因(50.00%)為主,其次為ermC基因(20.83%)和linA基因(12.50%),沒有檢出tetM基因、VanA基因和VanB基因。selk基因、ermC基因、tetK和mrsA基因在MRSA與MSSA之間的檢出率不同,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05)。MRCoNS菌株無檢出pvl基因,耐藥基因攜帶以blaZ基因(51.79%)為主,其次為msrA基因(24.11%)、linA基因(23.21%)、ermC基因(21.43%)和tetK基因(19.64%),沒有檢出VanA基因和VanB基因。MSCoNS菌株的tetM基因檢出率高于MRCoNS菌株,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.01)。MRSA的SCCmec分型:24株MRSA菌株中,僅1株屬于HA-MRSA(4.17%),18株屬于CA-MRSA(75.00%),5株不可分型。19株可分型。以SCCmec IVa型(20.83%,5/24)和IVd型(50.00%,12/24)占優(yōu)。MLST:MRSA菌株主要型別為ST188(25.00%,6/24)和ST59(25.00%,6/24)。而MSSA菌株主要ST型別為ST188(17.24%,5/29),ST5(13.79%,4/29)和ST7(13.79%,4/29)。通過eBURST分析,17個ST型別屬于8個國際CC克隆群(CC5、CC7、CC30、CC45、CC59、CC182、CC398和CC2483)和1個單體(ST1222)。其中主要以CC5(64.15%)為主,其次為CC59(11.32%)和CC7(7.55%)。通過聚類分析發(fā)現(xiàn),三個采樣門診檢出的MRSA菌株ST型別存在聚合現(xiàn)象。藥敏試驗:吸毒人員鼻腔攜帶的MRSA對青霉素(95.83%)、紅霉素(62.50%)、克林霉素(62.50%)的耐藥率較高。MRSA與MSSA對替考拉寧和克林霉素的耐藥率均有統(tǒng)計學(xué)差異(P0.05)。MRSA菌株的多重耐藥率為70.83%,其多重耐藥風(fēng)險是MSSA的3.44倍。MDR-SA的共耐藥模式是青霉素-紅霉素-克林霉素。吸毒人員鼻腔攜帶的MRCoNS對青霉素(89.29%)、紅霉素(47.32%)、復(fù)方新諾明(44.64%)的耐藥率較高。MRCoNS與MSCoNS對莫西沙星、克林霉素、青霉素、四環(huán)素、慶大霉素和紅霉素耐藥率均有統(tǒng)計學(xué)差異(P0.05)。MRCoNS菌株的多重耐藥率高于MSCoNS,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P0.001),其多重耐藥風(fēng)險是MSCoNS的4.55倍。MDR-CoNS的共耐藥模式是青霉素-頭孢西丁-復(fù)方新諾明。結(jié)論廣州市吸毒人員SA和CoNS攜帶率處于國內(nèi)外中等水平,而MRS攜帶率較高。近一年住院是吸毒人員鼻腔攜帶MRSA的危險因素,而監(jiān)禁史是吸毒人員鼻腔攜帶MRCoNS的危險因素。MRSA菌株以社區(qū)來源為主,攜帶的毒素基因主要為sed、seg和sei,ST型別以ST188和ST59為主,與國內(nèi)流行菌株相同,也與國際流行菌株密切相關(guān)。廣州市吸毒人群MRS菌株的多重耐藥情況較為嚴重,需對MRS菌株耐藥水平進行長期動態(tài)檢測。
【圖文】:

親緣關(guān)系,圓點


注:圖中小圓點代表一種 ST 型別,圓點大小與該 ST 型別的菌株數(shù)量正相關(guān),圓點之間連線表明菌株之間有遺傳進化關(guān)系。圖 3-1 SA 的親緣關(guān)系圖將本研究 53 株 SA 的 ST 型別提交至 MLST 官網(wǎng)與國際上分布的 ST 型別對比發(fā)現(xiàn),17 個 ST 型別可分為 8 個 CC 克隆群,分別為 CC5、CC7、CC30、CC45、CC59、CC182、CC398 和 CC2483,另外 ST1222 為單體。其中主要以 CC5(64.15%,,34/53)為主,其次為 CC59(11.32%,6/53)和 CC7(7.55%, 4/53)。具體的ST 型別及克隆群分布見表 3-11。各 ST 型別與國際菌株 ST 型別關(guān)系見圖 3-2 至3-9。

菌株,檢出,國際


本研究檢出ST5、ST6、ST15等菌株與國際克隆群CC5的聯(lián)系
【學(xué)位授予單位】:廣東藥科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:R749.64;R181.3

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本文編號:2640163

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