【摘要】：目的探討?zhàn)ひ盒团c非黏液型銅綠假單胞菌(Pseudomonas aeruginosa,P.a)的差異蛋白譜,以發(fā)現(xiàn)黏液型P.a潛在的生物標(biāo)志物。方法采用來自于臨床囊性纖維化患者分離的3株黏液型P.a菌株,脈沖場凝膠電泳以確定它們的同源性;采用同位素相對和絕對定量標(biāo)記(isobaric tags for relative and absolute quantitation,i TRAQ)結(jié)合二維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜(two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry,2D LC-MS/MS)技術(shù)分析3株黏液型與對照組1株非黏液型P.a的差異蛋白譜,并采用RT-q PCR方法對5個(gè)共同差異蛋白進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果 3株黏液型P.a菌株不具有同源性,i TRAQ結(jié)果沒有明顯差異。3組共有219個(gè)上調(diào)和101個(gè)下調(diào)差異蛋白。pa2815、pa2018、dnak、pa5046和acef基因轉(zhuǎn)錄水平與i TRAQ結(jié)果一致。結(jié)論不同黏液表型P.a的i TRAQ結(jié)果沒有明顯差異,219個(gè)上調(diào)和101個(gè)下調(diào)差異蛋白可以作為研究黏液型與非黏液型P.a致病機(jī)制的候選生物標(biāo)志物。
[Abstract]:Objective to investigate the differential protein profiles of mucinous and non-mucous Pseudomonas aeruginosa (Pseudomonas aeruginosa,P.a) and to identify potential biomarkers of mucinous P.a. Methods three myxotypic P.A strains isolated from patients with clinical cystic fibrosis were used to identify their homology by pulsed field gel electrophoresis. Two dimensional liquid Chromatography tandem Mass Spectrometry (two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry,) with Isotope relative and absolute quantitative labeling (isobaric tags for relative and absolute quantitation,i TRAQ 2D LC-MS/MS) technique was used to analyze the differential protein profiles of three strains of mucus type and one strain of non-mucus type P.A in control group. Five common differentially expressed proteins were verified by RT-q PCR method. Results there was no significant difference in, i TRAQ results among 3 mucinous P.A strains without homology. There were 219 up-regulated and 101 down-regulated differentially expressed proteins in the three groups. The transcription levels of pa2815,pa2018,dnak,pa5046 and acef genes were consistent with those of I TRAQ. Conclusion there is no significant difference in I TRAQ results among different mucotypic phenotypes. 219 up-regulated and 101 down-regulated differentially expressed proteins can be used as candidate biomarkers for studying the pathogenetic mechanism of mucinous and non-mucinous P.A.
【作者單位】： 廣東醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院檢驗(yàn)科;深圳市疾病預(yù)防控制中心毒理實(shí)驗(yàn)室;廣東醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院臨床研究中心;
【基金】：國家自然科學(xué)基金青年科學(xué)基金(81301478) 廣東省湛江市非資助科技計(jì)劃項(xiàng)目(2015B01042) 廣東省醫(yī)學(xué)科學(xué)技術(shù)研究基金項(xiàng)目(B2017055)~~
【分類號】：R446.5

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本文編號：2298592