人FcγRI特異性核酸適配體的體外篩選及鑒定
本文選題:指數(shù)富集配基的系統(tǒng)進(jìn)化技術(shù) 切入點:核酸適配體 出處:《中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報》2017年08期
【摘要】:人中性粒細(xì)胞FcγRI(即CD64),Ig G Fc高親和力受體之一,是早期診斷膿毒血癥和系統(tǒng)性細(xì)菌感染的一個靈敏和特異的新標(biāo)志物;目前,采用流式細(xì)胞計量術(shù)測定,難以在一般實驗室開展。本研究旨在應(yīng)用新型的體外篩選技術(shù)——指數(shù)富集配基的系統(tǒng)進(jìn)化(systematic evolution of ligands by exponential enrichment,SELEX)技術(shù)——從體外合成的隨機寡核苷酸文庫中篩選人FcγRI的高親和力和高特異性的核酸適配體(aptamer)。本文以人FcγRI為靶標(biāo),將其固定在羧基活化磁珠上,進(jìn)行SELEX篩選。經(jīng)過8輪篩選,共獲得3個重點研究的單克隆適配體。生物信息學(xué)分析結(jié)果顯示,人FcγRI適配體的模擬二級結(jié)構(gòu)以莖-環(huán)和G-四聚體為主,可能是FcγRI與適配體的作用位點,G-T錯配常見。流式細(xì)胞計量術(shù)和熒光顯微鏡分析顯示,篩選出的典型單克隆適配體解離常數(shù)(the dissociation constant,Kd)均達(dá)到納摩爾水平,而且適配體只與膿毒血癥中性粒細(xì)胞結(jié)合,具有良好的親和力和特異性。本研究表明,通過SELEX技術(shù),成功獲取了人FcγRI特異性核酸適配體,為以此適配體為分子探針,進(jìn)一步建立用于膿毒血癥早期診斷的新方法奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:Human neutrophil FC 緯 RI, one of the high affinity receptors of Ig G FC, is a sensitive and specific new marker for early diagnosis of sepsis and systemic bacterial infection. The aim of this study was to apply a new in vitro screening technique, the systematic evolution of ligands by exponential oligonucleotide Selex, to screen the high level of human FC 緯 RI from a random oligonucleotide library synthesized in vitro. Affinity and high specificity of aptamer.Human FC 緯 RI was used as the target. It was immobilized on carboxyl activated magnetic beads for SELEX screening. After 8 rounds of screening, three major monoclonal aptamers were obtained. Bioinformatics analysis showed that, The simulated secondary structures of human FC 緯 RI aptamers are mainly stem-ring and G-tetramer, which may be the common G-T mismatch between FC 緯 RI and aptamer. The typical monoclonal aptamer dissociation constant of the dissociation constantKd) has reached the nanomolor level, and the aptamer only binds to septic neutrophils with good affinity and specificity. The specific aptamer of human FC 緯 RI nucleic acid was successfully obtained, which laid a foundation for the further establishment of a new method for the early diagnosis of sepsis by using the aptamer as a molecular probe.
【作者單位】: 福州總醫(yī)院檢驗科;
【基金】:福建省科技計劃項目(No.2012D026) 福建省社會發(fā)展重點項目(No.2010Y0044)資助~~
【分類號】:R446.6;R459.7
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,本文編號:1688914
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