本文選題：風(fēng)疹病毒　切入點：基因型　出處：《現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué)》2017年16期

【摘要】：目的對2014-2015年銀川市流行的風(fēng)疹病毒進(jìn)行分離鑒定,確定其基因型,并進(jìn)行基因與氨基酸的特征分析。方法采用Real-time PCR法對采集的疑似風(fēng)疹病例的咽拭子標(biāo)本進(jìn)行初篩,陽性標(biāo)本使用Vero/SLAM細(xì)胞進(jìn)行病毒分離,采用RT-PCR法對病毒培養(yǎng)物進(jìn)行風(fēng)疹病毒株E1基因的標(biāo)準(zhǔn)靶核苷酸序列擴(kuò)增,并對擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行序列測定與分析。結(jié)果 2014-2015年銀川市共分離到24株風(fēng)疹病毒株,進(jìn)化樹結(jié)果顯示均為2B基因型;24株分離株之間的核苷酸與氨基酸同源性分別為98.1%~100.0%和97.5%~100.0%。對核苷酸編碼的氨基酸序列進(jìn)行比對,盡管出現(xiàn)了多個氨基酸的突變位點,但關(guān)鍵位點如N-型糖基化位點、血凝抑制位點、中和位點以及重要的抗原表位均未發(fā)生變化。結(jié)論 2014-2015年銀川市流行的風(fēng)疹病毒主要是2B基因型,與國內(nèi)其他地區(qū)普遍流行的基因型(1E基因型)不一致。雖然出現(xiàn)了氨基酸的變異,但關(guān)鍵位點的氨基酸序列高度保守,病毒抗原性較穩(wěn)定。
[Abstract]:Objective to isolate and identify the rubella virus prevalent in Yinchuan from 2014 to 2015, to determine its genotype and to analyze the characteristics of gene and amino acid. Methods the throat swab samples of suspected rubella cases were screened by Real-time PCR method. The positive specimens were isolated by Vero/SLAM cells, and the standard target nucleotides of rubella virus E1 gene were amplified by RT-PCR method. The amplified products were sequenced and analyzed. Results 24 strains of rubella virus were isolated from Yinchuan City in 2014-2015. The results of phylogenetic tree showed that the nucleotide and amino acid homology were 98.1% and 97.5%, respectively. The amino acid sequences encoded by nucleotides were compared, although there were several amino acid mutation sites. But the key sites, such as N- type glycosylation sites, hemagglutination inhibition sites, neutralizing sites and important antigen epitopes, have not changed. Conclusion the rubella virus prevalent in Yinchuan City in 2014-2015 is mainly a 2B genotype. Although there were amino acid variations, the amino acid sequences of the key sites were highly conserved and the antigenicity of the virus was relatively stable.
【作者單位】： 銀川市疾病預(yù)防控制中心;銀川市衛(wèi)生與計劃生育委員會;寧夏疾病預(yù)防控制中心;
【分類號】：R440;R511.2

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本文編號：1657803