本文選題：鼠傷寒沙門氏菌　切入點：多重耐藥　出處：《中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院》2017年碩士論文　論文類型：學位論文

【摘要】：沙門氏菌是引起食源性疾病的常見病原菌之一,每年全球因感染沙門氏菌而引起胃腸炎的患者高達9380萬,其中死亡人數約15.5萬,且大部分的疫情爆發(fā)是通過被沙門氏菌污染的食物或者動物傳播的,嚴重威脅公共衛(wèi)生健康問題,并且造成了巨大的經濟損失。目前沙門氏菌共發(fā)現2500多種血清型,鼠傷寒沙門氏菌是常見血清型之一,由鼠傷寒沙門氏菌在全球范圍內引起的肆虐感染事件也令人印象深刻。因此,本研究開展了對上海市鼠傷寒沙門氏菌的病原監(jiān)測及相關的研究。從2011年1月至2014年12月共收集上海市鼠傷寒沙門氏菌641株,其中食源性菌株82株,臨床來源菌株559株。臨床來源菌株分析顯示,各年齡段人群均有感染者,但是5歲以下兒童,尤其是一歲以內兒童更易感染鼠傷寒沙門氏菌,占感染者的49.4%,男性患者與女性患者的比例為1.3:1,每年鼠傷寒沙門氏菌感染高峰集中在夏秋兩季。為分析上海市鼠傷寒沙門氏菌的耐藥特點,本研究對收集來的所有菌株進行了抗生素敏感性檢測。結果顯示,菌株對傳統(tǒng)抗生素均表現很高的耐藥率,從高到低依次為四環(huán)素(85%)、萘啶酸(81.6%)、氨芐西林(81.1%)、磺胺異VA唑(79.3%)、氯霉素(58.2%)、鏈霉素(54.6%)、甲氧芐氨嘧啶/磺胺甲VA唑(50%)和慶大霉素(39.8%)。此外,在氟喹諾酮類藥物中,對環(huán)丙沙星的耐藥率為12.8%;在頭孢類藥物中,對頭孢噻呋,頭孢曲松和頭孢西丁的耐藥率分別為17.6%、17.6%和4.4%;在大環(huán)內酯類藥物中,阿奇霉素的耐藥率為5%。食源性菌株和臨床來源菌株耐藥性結果比較顯示,食源性菌株對萘啶酸、四環(huán)素、慶大霉素、氯霉素、磺胺異VA唑和甲氧芐氨嘧啶/磺胺甲VA唑的耐藥率高于臨床來源菌株,但臨床來源菌株對頭孢噻呋,頭孢曲松和頭孢西林耐藥性高于食源性菌株,兩者對環(huán)丙沙星和阿奇霉素的耐藥性無明顯差異。值得關注的是,僅有26株菌對所有抗生素均敏感,多重耐藥菌株高達86.1%,對≥3、≥4、≥5、≥6和≥7類抗生素產生耐藥的比例依次為86.1%、79.9%、64.3%、41.3%和0.9%,其中30.4%的菌株耐藥譜為ACSSuT(氨芐西林、氯霉素、鏈霉素、磺胺異VA唑和四環(huán)素)。此外還發(fā)現22株多重耐藥菌株對頭孢類藥物和環(huán)丙沙星同時耐藥,其中6株菌對阿奇霉素同時耐藥。如果這些多重耐藥菌株像DT104型菌株一樣在全球廣泛傳播的話后果不堪設想,應該引起我們高度重視。通過上述藥敏結果分析,為上海市臨床使用抗生素治療鼠傷寒沙門氏菌感染提供依據,并提醒我們應合理規(guī)范使用抗生素,避免耐藥菌株數量繼續(xù)增加。為研究鼠傷寒沙門氏菌對頭孢類藥物、環(huán)丙沙星和阿奇霉素的耐藥機制,本研究對這三類藥物常見的耐藥基因進行了PCR檢測。在82株耐環(huán)丙沙星的鼠傷寒沙門氏菌中,76株菌的gyrA基因存在單位點突變(Asp87Asn/Tyr)或者雙位點突變(Ser83Phe,Asp87Asn/Gly),其中6株菌同時存在parC單點突變(Ser80Arg),1株菌同時存在parC雙位點突變(Thr57Ser,Ser80Arg)。所有菌株gyrB和parC均未發(fā)生位點突變。質粒介導的喹諾酮類藥物耐藥基因(PMQR)結果顯示,54(65.9%)菌株含有aac(6’)-Ib-cr基因,6(7.3%)株菌含有qnrB基因,其中2株為qnrB2,4株為qnrB4,僅1株菌含有qnrS1。值得關注的是有53株菌的gyrA基因有一個或者沒有突變位點,但均帶有一種以上PMQR,說明PMQR基因在介導鼠傷寒沙門氏菌對環(huán)丙沙星耐藥中有流行的趨勢。在116株耐頭孢類藥物的鼠傷寒沙門氏菌中,廣譜β-內酰胺酶(ESBLs)基因普遍存在,其中blaCTX-M、blaTEM-1、blaOXA-1和blaSHV-12陽性率分別為64.7%、44.8%、37.1%和2.6%。blaCTX-M共檢測到8種型別:blaCTX-M-14、blaCTX-M-15、blaCTX-M-27、blaCTX-M-55、blaCTX-M-65和blaCTX-M-104,blaCTX-M-123和blaCTX-M-125,均屬于blaCTX-M-1群和blaCTX-M-9群,未檢出blaCTX-M-2/8/25基因,陽性率最高的為blaCTX-M-14和blaCTX-M-55,分別占29%和41%,此外blaCTX-M-123和blaCTX-M-125基因在鼠傷寒沙門氏菌中首次發(fā)現。在32株耐阿奇霉素鼠傷寒沙門氏菌中,有15株MIC≥128μg/mL,均檢測到mphA基因,而其余17株MIC值為16-64μg/mL,均未檢測到mphA基因,其余大環(huán)內酯類耐藥基因mphB、ermA、ermB、ereA、mefA和msrA在32株菌中均未發(fā)現,推測mphA基因可能介導鼠傷寒沙門氏菌對阿奇霉素的高水平耐藥。在22株共同耐頭孢類藥物和環(huán)丙沙星的鼠傷寒沙門氏菌中,共15株菌同時帶有ESBLs和PMQR基因,其中還有2株菌對阿奇霉素產生共同耐藥,攜帶耐藥基因為aac(6’)-Ib-cr/blaCTX-M/blaTEM/mphA。這些質粒介導的耐藥基因極易在細菌間水平傳播,造成細菌的多重耐藥,因此應積極關注這些基因的播散,并研究其傳播機制和途徑等,阻止它們的擴散。為了進一步了解上海市鼠傷寒沙門氏菌的親緣關系及遺傳多態(tài)性,本研究利用脈沖場凝膠電泳(PFGE)方法對257株鼠傷寒沙門氏菌進行了基因分型,聚類分析結果顯示食源性菌株與臨床來源菌株親緣關系相近,在A簇中兩種來源菌株之間帶型相似度為85%,說明食源性菌株是人類感染鼠傷寒沙門氏菌的重要環(huán)節(jié)。對耐頭孢類藥物、環(huán)丙沙星和阿奇霉素的菌株進行了基因分型,聚類分析結果顯示對這三類藥物耐藥的菌株帶型復雜,遺傳多態(tài)性明顯,帶型為CEP.022的菌株均帶有blaCTX-M和blaTEM基因,且2011-2014年均有分布,表明此帶型菌株親緣關系極近,來自同一克隆群,且這些菌株均對7種以上抗生素耐藥,所以極易引起廣泛傳播,應對此類型菌株加強監(jiān)控,其余耐藥基因與菌株基因分型無明顯相關性。綜上所述,本研究分析了上海市2011-2014年鼠傷寒沙門氏菌的耐藥特點,闡述了菌株對頭孢類藥物、氟喹諾酮類藥物和阿奇霉素的耐藥機制,并利用脈沖場凝膠電泳對耐藥菌株進行基因分型,探索了食源菌株與臨床菌株之間的親緣關系,為提高鼠傷寒沙門氏菌監(jiān)控和防治奠定堅實基礎。
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【學位授予單位】：中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2017
【分類號】：R446.5;R516.3

【參考文獻】

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本文編號：1609052