泛耐藥肺炎克雷伯菌噬菌體SH-Kp152234的生物學(xué)特性和基因組學(xué)研究
本文關(guān)鍵詞: 肺炎克雷伯菌 噬菌體 生物學(xué)特性 基因組學(xué) 出處:《上海交通大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版)》2017年03期 論文類型:期刊論文
【摘要】:目的·針對泛耐藥肺炎克雷伯菌尋找寬宿主譜噬菌體,并對其生物學(xué)特性、基因組成進(jìn)行分析。方法·以泛耐藥肺炎克雷伯菌為宿主菌,從醫(yī)院污水中分離純化得到針對宿主菌的泛耐藥肺炎克雷伯菌噬菌體。電子顯微鏡觀察噬菌體的大小和形態(tài),分析其效價、宿主譜、酸堿穩(wěn)定性和熱穩(wěn)定性。抽取噬菌體DNA進(jìn)行測序及分析。結(jié)果·分離到l株肺炎克雷伯菌噬菌體,命名為SH-Kp152234。電子顯微鏡觀察顯示其屬短尾噬菌體,基因組為線狀雙鏈DNA,全長為40 578 bp,GC含量為52.85%。預(yù)測共有49個開放閱讀框,保守序列具有已知的相關(guān)功能。結(jié)論·篩選得到肺炎克雷伯菌噬菌體SH-Kp152234的宿主譜較寬,潛伏期較短,可適應(yīng)不同的溫度和p H值,為治療泛耐藥肺炎克雷伯菌感染提供潛在依據(jù)。
[Abstract]:Objective: to search for a wide host spectrum phage against pan-resistant Klebsiella pneumoniae, and analyze its biological characteristics and gene composition. Methods: using Pan-resistant Klebsiella pneumoniae as host strain, Pan-drug-resistant Klebsiella pneumoniae phage was isolated and purified from hospital sewage. The size and morphology of phage were observed by electron microscope and its titer and host spectrum were analyzed. Acid and base stability and thermal stability. DNA was extracted for sequencing and analysis. Results: 1 strain of Klebsiella pneumoniae was isolated and named as SH-Kp152234. The genome is a linear double-stranded DNA with a GC content of 40 578 BP ~ (-1) and a GC content of 52.85. It is predicted that there are 49 open reading frames, and the conserved sequences have known related functions. Conclusion: the host spectrum of Klebsiella pneumoniae phage SH-Kp152234 is wider and the incubation period is shorter. It can adapt to different temperature and pH value and provide potential evidence for the treatment of pan-resistant Klebsiella pneumoniae infection.
【作者單位】: 上海交通大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院免疫學(xué)與微生物學(xué)系;優(yōu)仕美地醫(yī)療;復(fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院抗生素研究所;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(81471908)~~
【分類號】:R440
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,本文編號:1515260
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