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沙門菌tcpS基因的血清型分布及其在特定血清型鑒定中的應(yīng)用

發(fā)布時間:2018-01-13 00:03

  本文關(guān)鍵詞:沙門菌tcpS基因的血清型分布及其在特定血清型鑒定中的應(yīng)用 出處:《中國人獸共患病學(xué)報》2017年09期  論文類型:期刊論文


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【摘要】:目的建立基于tcpS基因的PCR鑒定方法,同時篩選腸炎沙門菌、雞白痢/傷寒沙門菌和都柏林沙門菌,為流行病學(xué)調(diào)查提供方便快速的實驗室技術(shù)支持,并為PCR鑒定沙門菌方法的發(fā)展提供新的基因候選。方法利用生物信息學(xué)的方法分析沙門菌tcpS基因的血清型分布特點,選擇27種不同血清型沙門菌以及10株非沙門菌菌株,對所建立PCR體系的特異性和靈敏性進行檢測,并將該方法應(yīng)用于江蘇省分離的48株豬場分離株、22株雞場分離株和11株牛場分離株的檢測。結(jié)果生物信息學(xué)分析表明tcpS基因僅存在于腸炎沙門菌、雞白痢/傷寒沙門菌和都柏林沙門菌中,該PCR方法具有高度特異性和靈敏性,可準確快速地從臨床樣本中篩選這3種血清型沙門菌,且對實際樣本檢測符合率達100%。結(jié)論基于tcpS的PCR檢測方法可準確篩選腸炎沙門菌、雞白痢/傷寒沙門菌和都柏林沙門菌,能作為傳統(tǒng)血清學(xué)分型的輔助方法,為沙門菌PCR鑒定方法的發(fā)展提供了優(yōu)良的基因候選。
[Abstract]:Objective to establish PCR identification method based on tcpS gene and screen Salmonella enteritidis, Salmonella pullorum / Salmonella typhimurium and Salmonella Dublin at the same time, so as to provide convenient and rapid laboratory technical support for epidemiological investigation. New gene candidates were provided for the development of PCR method for the identification of Salmonella. Methods the distribution characteristics of serum type of Salmonella tcpS gene were analyzed by bioinformatics. The specificity and sensitivity of the established PCR system were determined by selecting 27 different serotypes of Salmonella and 10 non-Salmonella strains. The method was applied to 48 pig farm isolates isolated from Jiangsu Province. Results Bioinformatics analysis showed that tcpS gene only existed in Salmonella enteritidis, Salmonella pullorum / Salmonella typhimurium and Salmonella Dublin. The PCR method has high specificity and sensitivity and can be used to screen the three serotype Salmonella serotype from clinical samples accurately and quickly. Conclusion the PCR method based on tcpS can be used to screen Salmonella enteritidis, Salmonella pullorum / Salmonella typhimurium and Salmonella Dublin accurately. It can be used as the assistant method of traditional serological typing, and it provides excellent gene candidates for the development of PCR identification method of Salmonella.
【作者單位】: 江蘇省人獸共患病學(xué)重點實驗室/江蘇省動物重要疫病與人獸共患病防控協(xié)同創(chuàng)新中心/農(nóng)業(yè)與農(nóng)產(chǎn)品安全國際合作聯(lián)合實驗室/農(nóng)業(yè)部農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全生物性危害因子(動物源)控制重點實驗室;
【基金】:國家重點研發(fā)計劃課題(2016YFD0501607) 公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專項(201403054) 國家自然科學(xué)基金(31320103907,31230070) 江蘇省重點研發(fā)項目(BE2015343) 江蘇省第9批“六大人才高峰”高層次人才項目(NY-028) 揚州大學(xué)科技創(chuàng)新團隊 江蘇省高校優(yōu)勢學(xué)科建設(shè)工程項目聯(lián)合資助~~
【分類號】:R440;R516.3
【正文快照】: Funded by the National Key Research and Development Program Special Project(No.2016YFD0501607),the Special Fund forAgroscientific Research in the Public Interest(No.201403054),the National Natural Science Foundation of China(Nos.31320103907and 31230070),

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