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基于突變阻滯擴增系統(tǒng)的實時熒光PCR技術(shù)檢測幽門螺桿菌23S rRNA基因突變及其評價

發(fā)布時間:2017-11-20 11:38

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【摘要】:目的探索突變阻滯擴增系統(tǒng)(ARMS)聯(lián)合實時熒光PCR技術(shù)用于檢測幽門螺桿菌23S rRNA基因突變的可行性。方法以幽門螺桿菌23S rRNA基因2143位點的兩種基因型(野生型為AAA,突變型為AGA)質(zhì)粒DNA為研究模型,設(shè)計ARMS引物同時對實時熒光PCR體系進行優(yōu)化,對突變阻滯擴增系統(tǒng)聯(lián)合實時熒光PCR技術(shù)的基因分型特異性進行評價。結(jié)果在與模板匹配的ARMS引物3'端附近故意引入錯配堿基,降低該ARMS引物濃度和鎂離子濃度,并采用兩步PCR循環(huán)的反應(yīng)程序,使ARMS引物的特異性增強,能夠得到清晰的基因分型結(jié)果。結(jié)論這種基于突變阻滯擴增系統(tǒng)的實時熒光PCR技術(shù),實驗設(shè)計簡便,特異性較好,并有望在此基礎(chǔ)上發(fā)展成為適合臨床應(yīng)用的突變檢測方法。
【作者單位】: 生物芯片上海國家工程研究中心;
【基金】:上海市浦東新區(qū)科技發(fā)展基金(PKJ2015-S)
【分類號】:R440
【正文快照】: 基因突變是人類各種遺傳疾病和惡性腫瘤發(fā)生的根本原因,檢測與遺傳病及腫瘤發(fā)生有關(guān)的突變基因一直是醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)和腫瘤學(xué)研究的熱點,它對闡明遺傳病和腫瘤發(fā)生的分子生物學(xué)基礎(chǔ)及早期診斷具有重要意義。目前傳統(tǒng)的基因檢測方法有聚合酶鏈式反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性(polymera

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