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四種基因定量方法對實(shí)時(shí)熒光PCR與微滴式數(shù)字PCR檢測霍亂弧菌基因表達(dá)量的分析

發(fā)布時(shí)間:2017-10-30 16:15

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【摘要】:基因表達(dá)量測定對基因功能解析和探索生命機(jī)理具有重大意義,目前實(shí)時(shí)熒光PCR和微滴式數(shù)字PCR技術(shù)是進(jìn)行基因表達(dá)量測定的有效方法。本文以低溫處理的霍亂弧菌sfs、vcc、Rec A、hly及16S r RNA基因?yàn)檠芯繉ο?分別用實(shí)時(shí)熒光PCR和微滴式數(shù)字PCR技術(shù)對低溫處理前后霍亂弧菌的上述基因表達(dá)量進(jìn)行測定,實(shí)時(shí)熒光PCR實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)分別采用??CT和ge Norm法進(jìn)行分析,微滴式數(shù)字PCR實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)分別采用相對定量和絕對定量法進(jìn)行分析,獲得處理組基因表達(dá)量相對于對照組的變化倍數(shù);使用多維尺度法來分析四種基因定量方法的數(shù)據(jù)。結(jié)果表明,在本實(shí)驗(yàn)條件下,四種基因定量方法的分析結(jié)果存在差異;16S r RNA基因表達(dá)量發(fā)生了變化,不適合作為內(nèi)參基因;微滴式數(shù)字PCR能更直觀的給出基因表達(dá)量變化的結(jié)果,并且基因表達(dá)差異相對定量分析的準(zhǔn)確度更高。
【作者單位】: 山東出入境檢驗(yàn)檢疫局檢驗(yàn)檢疫技術(shù)中心食品農(nóng)產(chǎn)品檢測中心;威海出入境檢驗(yàn)檢疫局;
【關(guān)鍵詞】基因表達(dá) 實(shí)時(shí)熒光定量PCR 微滴式數(shù)字PCR
【基金】:國家質(zhì)檢總局科研計(jì)劃(2012IK305,2013IK175,2014IK114)
【分類號】:R440
【正文快照】: 霍亂弧菌(Vibrio cholerae)是弧菌科的主要致病菌,是引起霍亂的病原菌,每年影響數(shù)以萬計(jì)人;魜y弧菌細(xì)菌分類學(xué)和分子流行病學(xué)的研究,越來越重視霍亂弧菌特定基因表達(dá)量的檢測。因?yàn)榛虮磉_(dá)差異會影響細(xì)菌的某些重要遺傳性狀,如細(xì)菌的生理結(jié)構(gòu)、致病性和耐藥性等。DNA分子擴(kuò)

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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9 李毅U,

本文編號:1118368


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