癌癥已經(jīng)成為全球范圍內(nèi)疾病和死亡的主要原因,對人們身體健康和生活都造成嚴(yán)重的影響。癌癥產(chǎn)生的病因多種多樣,找出癌癥產(chǎn)生的原因和相關(guān)治療方法成為科研工作人員的重要工作。經(jīng)過科研工作者多年的研究,大多數(shù)包括癌癥在內(nèi)的疾病跟人類的基因相關(guān),而人類研究自身基因的一個(gè)重要數(shù)據(jù)來源就是基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)。基因表達(dá)數(shù)據(jù)是由生物學(xué)者選擇一部分人體組織樣本,加入指定試劑激活刺激組織內(nèi)的基因表達(dá),然后使用基因芯片去檢測RNA蛋白質(zhì)表達(dá)水平。一方面通過對某些患者及健康人士選取相同組織做基因表達(dá)譜數(shù)據(jù),可以得到基因表達(dá)水平的不同;另一方面通過實(shí)驗(yàn)觀測藥物或者治療方案對關(guān)鍵基因表達(dá)的作用,及觀察前后表達(dá)水平差異,就可以評估治療的作用和藥物的療效。因此使用基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)對各類癌癥進(jìn)行細(xì)致分類,對于癌癥診斷治療有著極其重要的作用。然而在一個(gè)基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)集中,通常只有幾十個(gè)樣本,而一個(gè)樣本檢測的基因數(shù)目高達(dá)數(shù)萬,特征維度和樣本數(shù)量不均衡導(dǎo)致基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)直接使用機(jī)器學(xué)習(xí)模型分類時(shí)存在嚴(yán)重的過擬合問題。在生物信息領(lǐng)域使用深度學(xué)習(xí)來分析基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)已經(jīng)是一個(gè)非常重要的應(yīng)用了�，F(xiàn)有的深度學(xué)習(xí)方法已經(jīng)在基于大型基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)...

【文章頁數(shù)】：60 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖2-1孿生網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)示意圖

哈爾濱工業(yè)大學(xué)工學(xué)碩士學(xué)位論文圖2-1孿生網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)示意圖。為：L(W)=Pi=1L(W,(Y,X1,X2)i)L(W,(Y,X1,X2)i)=(1Y)LG(EW(X1,X2)i)+YLI(EW(X1,X2)i)(2-12)式中X1和X2———兩個(gè)輸入的樣本；Y———X1和X2同類....

圖2-2三胞胎網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)示意圖

哈爾濱工業(yè)大學(xué)工學(xué)碩士學(xué)位論文圖2-1孿生網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)示意圖。為：L(W)=Pi=1L(W,(Y,X1,X2)i)L(W,(Y,X1,X2)i)=(1Y)LG(EW(X1,X2)i)+YLI(EW(X1,X2)i)(2-12)式中X1和X2———兩個(gè)輸入的樣本；Y———X1和X2同類....

圖2-3KNN示意圖

哈爾濱工業(yè)大學(xué)工學(xué)碩士學(xué)位論文知道帶問號的球是哪一類，于是找到離問號球最近的五個(gè)球，發(fā)現(xiàn)五個(gè)球中有2個(gè)黑的，3個(gè)白的，因此判斷問號球?yàn)榘浊颉D2-3KNN示意圖假設(shè)樣本點(diǎn)X屬于n維特征空間X={X1,X2,X3...Xn}，第i個(gè)樣本為Xi=X1i,X2i,X3i...Xdi，X....

圖2-4SVM示意圖

蛄炕?⊿upportVectorMachine,SVM）[48,49]是一種效果優(yōu)秀、性能良好的二分類器，經(jīng)過改進(jìn)后可以用于多分類任務(wù)。SVM主要學(xué)習(xí)計(jì)算一個(gè)最大邊距平面能夠?qū)?shù)據(jù)集中兩類數(shù)據(jù)集進(jìn)行區(qū)分，且在訓(xùn)練中使用了鉸鏈順勢函數(shù)和給雷正則化項(xiàng)來減少過擬合的情況，從而得到一個(gè)優(yōu)....

本文編號：3903136