細(xì)胞核是真核細(xì)胞內(nèi)最重要的細(xì)胞器,它是基因復(fù)制、RNA轉(zhuǎn)錄的中心,是細(xì)胞活動(dòng)的控制中心。蛋白質(zhì)的功能與蛋白質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)的位置密切相關(guān),因此,如何從大量蛋白質(zhì)中精確地識(shí)別出核定位蛋白,并且進(jìn)一步預(yù)測(cè)亞核定位非常重要。本文基于最新更新的UniProtKB/Swiss-Prot數(shù)據(jù)庫,構(gòu)建了相似性小于等于25%的核定位蛋白和非核定位蛋白數(shù)據(jù)集,選取氨基酸序列N端單肽組分信息、蛋白質(zhì)骨架二肽組分信息、氨基酸指數(shù)信息、蛋白質(zhì)相互作用信息及基因本體注釋信息為特征信息,利用支持向量機(jī)算法對(duì)構(gòu)建的數(shù)據(jù)集進(jìn)行預(yù)測(cè)。單特征信息中,基因本體注釋信息與蛋白質(zhì)相互作用信息兩種特征信息的總預(yù)測(cè)成功率較好,且總預(yù)測(cè)成功率都達(dá)到了 80%以上,對(duì)特征信息進(jìn)行篩選融合,在5折交叉檢驗(yàn)下總預(yù)測(cè)成功率達(dá)到89.11%。本文進(jìn)一步構(gòu)建了相似性小于等于25%蛋白質(zhì)亞核定位數(shù)據(jù)集N1127和N1044。并選取4種特征信息:氨基酸組分信息、蛋白質(zhì)骨架二肽組分信息、基因本體注釋信息和蛋白質(zhì)相互作用信息,利用支持向量機(jī)算法對(duì)構(gòu)建的數(shù)據(jù)集進(jìn)行預(yù)測(cè)。單特征信息中,基因本體注釋信息與蛋白質(zhì)相互作用信息兩種特征信息的總預(yù)測(cè)成功率較好,將特征信息...

【文章頁數(shù)】：55 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

本文編號(hào)：3882510