長非編碼RNA（long noncoding RNAs）是一類長度超過200個核苷酸的非編碼RNAs,大量研究表明,lnc RNAs在許多重要的生物過程中起著關(guān)鍵作用,并且其突變和失調(diào)與許多疾病有關(guān)。然而通過生物實(shí)驗(yàn)方法來識別lnc RNA和疾病的關(guān)聯(lián)是費(fèi)時費(fèi)力的。有效的計算方法將有助于人類對疾病分子機(jī)制的理解,并有助于尋找疾病診斷,治療和預(yù)防的生物標(biāo)志物。本文主要研究使用計算方法來預(yù)測lnc RNA-疾病關(guān)聯(lián)關(guān)系。生物網(wǎng)絡(luò)方法已經(jīng)應(yīng)用于多個生物信息領(lǐng)域,本文利用已知lnc RNA-疾病關(guān)聯(lián)關(guān)系數(shù)據(jù),lnc RNA表達(dá)相似度,疾病語義相似度等得到了lnc RNA-lnc RNA相似度矩陣和疾病相似度矩陣。并通過相似度矩陣構(gòu)建了lnc RNA-疾病異構(gòu)網(wǎng)絡(luò),通過在異構(gòu)網(wǎng)絡(luò)上進(jìn)行雙隨機(jī)游走算法,對未知的關(guān)聯(lián)進(jìn)行預(yù)測,在對已知數(shù)據(jù)上的LOOCV下AUC值達(dá)到了0.9374,五折交叉驗(yàn)證下達(dá)到了0.8504,高于其它幾種對比的方法�；诋悩�(gòu)網(wǎng)絡(luò)的模型對于高關(guān)聯(lián)疾病的預(yù)測和對新疾病的預(yù)測都表現(xiàn)出良好效果。另外,通過將方法應(yīng)用于復(fù)雜疾病進(jìn)行案例研究,說明了方法的有效性。而且,方法可以同時對所有疾病... 

【文章來源】：哈爾濱工業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 985工程院校

【文章頁數(shù)】：71 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

螞蟻的隨機(jī)游走隨機(jī)游走在數(shù)學(xué)和物理學(xué)的許多模型中出現(xiàn)

基于lncRNA功能相似網(wǎng)絡(luò)的預(yù)測方法

BiRWHLDA算法流程


本文編號：3079607