粒子群優(yōu)化算法及其在生物數(shù)據(jù)聚類中的應(yīng)用
本文關(guān)鍵詞:粒子群優(yōu)化算法及其在生物數(shù)據(jù)聚類中的應(yīng)用,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:在信息技術(shù)高速發(fā)展的今天,許多領(lǐng)域都積累了海量的數(shù)據(jù),挖掘這些數(shù)據(jù)的內(nèi)部聯(lián)系、獲得有用的信息已成為社會(huì)進(jìn)步的迫切需求。作為數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)的重要手段,聚類分析方法受到了廣大科研工作者的密切關(guān)注與研究。由Kennedy和Eberhart最先提出的粒子群優(yōu)化(Particle Swarm Optimization, PSO)算法是一種基于種群的自適應(yīng)隨機(jī)算法,并已被實(shí)踐證明是一種有效的全局優(yōu)化算法。PSO因原理簡(jiǎn)單、設(shè)置參數(shù)少、收斂速度快及在復(fù)雜優(yōu)化問(wèn)題上的良好表現(xiàn)被廣泛應(yīng)用于數(shù)據(jù)挖掘、機(jī)器學(xué)習(xí)、電力系統(tǒng)及神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)等領(lǐng)域。通過(guò)分析標(biāo)準(zhǔn)粒子群聚類算法的機(jī)制,本文提出了基于K-method的快速混沌粒子群算法(FCPSO-K)及環(huán)形鄰域混沌粒子群算法(RCPSO),并改進(jìn)了基于類內(nèi)方差函數(shù)的單目標(biāo)聚類模型。在生物數(shù)據(jù)集上的實(shí)驗(yàn)測(cè)試了這兩種算法的性能,并與其它算法的聚類結(jié)果進(jìn)行了比較。文章的主要工作概括如下:(1)為了克服粒子群算法對(duì)初值敏感的缺點(diǎn),并進(jìn)一步加快種群的收斂速度,提出快速聚類算法FCPSO-K。首先,基于k鄰域距離、核心對(duì)象及密度可達(dá)等概念,得到一種新的初始化方法K-method來(lái)改善聚類初始種群;而后,給出快速混沌粒子群聚類算法(FCPSO-K),該算法將動(dòng)態(tài)目標(biāo)約束處理法(DOM)同K-method與聚類匹配機(jī)制一起結(jié)合到混沌粒子群算法的機(jī)制中。實(shí)驗(yàn)表明,相比K-means、PSO及其它4種基于PSO技術(shù)的聚類算法,FCPSO-K算法的全局尋優(yōu)能力強(qiáng)、收斂速度快、穩(wěn)定性好;而且,FCPSO-K聚類結(jié)果的準(zhǔn)確率更高。(2)針對(duì)粒子群算法易陷入局部極值的不足,將環(huán)形鄰域、混沌因子同粒子群優(yōu)化算法的機(jī)制相結(jié)合,提出一種基于環(huán)形鄰域的混沌粒子群優(yōu)化算法(RCPSO)。在4個(gè)測(cè)試集上比較了不同大小的靜態(tài)、隨機(jī)環(huán)形結(jié)構(gòu)的混沌粒子群算法的聚類效果,得出了RCPSO算法整體聚類準(zhǔn)確率最優(yōu)時(shí)的種群鄰域的大小。(3)為了改進(jìn)單目標(biāo)優(yōu)化聚類模型,給出了一種新的類內(nèi)密度函數(shù),并將其作為評(píng)價(jià)聚類效果的輔助指標(biāo),進(jìn)而提出多目標(biāo)導(dǎo)向的(Multi-objective Oriented)粒子群聚類算法MOOPSO,該算法綜合考慮兩種評(píng)價(jià)指標(biāo)來(lái)指導(dǎo)群體的尋優(yōu)過(guò)程。實(shí)驗(yàn)表明,結(jié)合了類內(nèi)密度函數(shù)的MOOPSO對(duì)聚類結(jié)果的評(píng)價(jià)比PSO算法更加準(zhǔn)確;類內(nèi)密度函數(shù)使得MOOPSO在種群收斂過(guò)程中獲得的分類方案的錯(cuò)誤率基本上能夠持續(xù)地得到改進(jìn)。此外,仿真結(jié)果還驗(yàn)證了類內(nèi)密度函數(shù)能有效提高混沌粒子群算法的聚類準(zhǔn)確度。
【關(guān)鍵詞】:粒子群優(yōu)化 生物聚類 混沌因子 拓?fù)溧徲蚪Y(jié)構(gòu) 多目標(biāo)導(dǎo)向
【學(xué)位授予單位】:江南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:TP311.13;TP18
【目錄】:
- 摘要3-4
- Abstract4-8
- 第一章 緒論8-13
- 1.1 研究背景及意義8-9
- 1.2 粒子群優(yōu)化算法的研究現(xiàn)狀9-10
- 1.3 聚類問(wèn)題的研究現(xiàn)狀10-11
- 1.4 本文的主要研究?jī)?nèi)容及創(chuàng)新點(diǎn)11-13
- 1.4.1 組織結(jié)構(gòu)11
- 1.4.2 創(chuàng)新點(diǎn)11-13
- 第二章 粒子群優(yōu)化算法研究13-19
- 2.1 標(biāo)準(zhǔn)粒子群優(yōu)化算法13-14
- 2.2 粒子群優(yōu)化算法的改進(jìn)策略14-18
- 2.2.1 群體的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)14-15
- 2.2.2 混沌理論15-17
- 2.2.3 約束處理機(jī)制17-18
- 2.3 本章小結(jié)18-19
- 第三章 改進(jìn)的混沌粒子群聚類算法19-31
- 3.1 粒子群算法在聚類問(wèn)題中的應(yīng)用19-20
- 3.1.1 類內(nèi)方差19
- 3.1.2 錯(cuò)誤率19-20
- 3.2 基于K-method初值優(yōu)化的快速混沌粒子群聚類算法(FCPSO-K)20-23
- 3.2.1 K-method:種群的初始化方法20-21
- 3.2.2 FCPSO-K算法的聚類流程21-23
- 3.3 算法性能測(cè)試23-30
- 3.3.1 生物數(shù)據(jù)集23-24
- 3.3.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果及分析24-30
- 3.4 本章小結(jié)30-31
- 第四章 基于環(huán)形鄰域的混沌粒子群聚類算法(RCPSO)31-40
- 4.1 種群的環(huán)形鄰域結(jié)構(gòu)31
- 4.2 RCPSO算法的聚類過(guò)程31-32
- 4.3 算法的性能測(cè)試32-39
- 4.3.1 RCPSO算法的聚類實(shí)驗(yàn)結(jié)果及分析32-38
- 4.3.2 RCPSO算法對(duì)函數(shù)優(yōu)化問(wèn)題的實(shí)驗(yàn)結(jié)果及分析38-39
- 4.4 本章小結(jié)39-40
- 第五章 多目標(biāo)導(dǎo)向的粒子群聚類算法(MOOPSO)40-48
- 5.1 基于粒子群算法的聚類問(wèn)題的模型改進(jìn)40-41
- 5.2 MOOPSO算法的聚類流程41
- 5.3 算法的性能測(cè)試41-47
- 5.4 本章小結(jié)47-48
- 第六章 總結(jié)與展望48-50
- 6.1 全文總結(jié)48
- 6.2 工作展望48-50
- 致謝50-51
- 參考文獻(xiàn)51-55
- 附錄:作者在攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文及參加的學(xué)術(shù)活動(dòng)55
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