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基于鄰域熵與蟻群優(yōu)化的基因選擇算法

發(fā)布時(shí)間:2018-04-05 11:46

  本文選題:基因選擇 切入點(diǎn):蟻群優(yōu)化 出處:《福州大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版)》2017年06期


【摘要】:針對(duì)基因表達(dá)數(shù)據(jù)集的基因選擇問(wèn)題,采用鄰域熵度量與蟻群優(yōu)化原理,提出一種基因選擇方法.首先,引入鄰域粗糙集模型對(duì)基因數(shù)據(jù)進(jìn)行鄰域;,定義鄰域熵度量用于剔除冗余基因構(gòu)成預(yù)選擇基因子集;然后,采用鄰域熵構(gòu)造基因重要度作為啟發(fā)式信息,發(fā)揮蟻群優(yōu)化算法的分布式、正反饋及全局尋優(yōu)的優(yōu)勢(shì),運(yùn)用蟻群優(yōu)化算法從預(yù)選擇基因子集中搜索出最小基因子集;最后,在選取的最小基因子集上進(jìn)行分類(lèi)測(cè)試.實(shí)驗(yàn)表明:建立在該最小基因子集上的分類(lèi)器具有良好的分類(lèi)性能.
[Abstract]:In order to solve the gene selection problem of gene expression data set, a gene selection method is proposed by using neighborhood entropy metric and ant colony optimization principle.Firstly, the neighborhood rough set model is introduced to granulate the gene data, and the neighborhood entropy metric is defined to remove redundant genes to form a subset of preselected genes. Then, the importance of constructing genes by neighborhood entropy is used as heuristic information.Based on the advantages of distributed, positive feedback and global optimization, the ant colony optimization algorithm is used to search the minimum gene subset from the pre-selected gene subset. Finally, the classification test is carried out on the selected minimum gene subset.The experimental results show that the classifier based on the minimal gene subset has good classification performance.
【作者單位】: 廈門(mén)理工學(xué)院計(jì)算機(jī)與信息工程學(xué)院;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(61573297) 福建省教育廳科研資助項(xiàng)目(JA15363)
【分類(lèi)號(hào)】:TP18

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本文編號(hào):1714629

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