本文關鍵詞：基于分布式信源編碼的微生物基因組序列壓縮算法

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【摘要】：提出一種基于分布式信源編碼的微生物基因組序列壓縮算法,用于改進微生物基因組序列壓縮效率不高的現(xiàn)狀.首先將微生物基因組序列映射為兩條二進制序列并映射為兩幅二值圖像以便使用更多的信源相關性.然后構建分布式信源編碼來同時傳輸兩個二值圖像.同時,為保證邊信息傳輸?shù)母咝?優(yōu)化Context加權方法被用于邊信息壓縮.實驗結果表明,與現(xiàn)有微生物基因組序列壓縮算法相比較,該算法能獲得更高的壓縮效率,并且保持較合理的運算復雜度.
【作者單位】： 云南警官學院信息網絡安全學院;昆明學院學報編輯部;
【關鍵詞】： 分布式信源編碼 微生物基因組序列壓縮 邊信息 Context加權 希爾伯特空間填充
【基金】：國家自然科學基金資助項目(61062005) 云南省自然科學基金青年基金資助項目(2013FD042)
【分類號】：Q933;TN911.21
【正文快照】： 第二代基因組測序技術使得獲得的基因組序列數(shù)據呈指數(shù)級增長,也對存儲這些數(shù)據提出了更高的要求[1].在近20 a的研究中,前人基本上給出了三大類針對基因組序列的壓縮算法.一類是基于字典的壓縮,另一類是使用無損熵編碼進行壓縮的方法,第三類是最近幾年研究的熱點,基于Referenc

【相似文獻】

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1 李云松;孔繁鏘;吳成柯;雷杰;;基于分布式信源編碼的干涉多光譜圖像壓縮[J];光學學報;2008年08期

中國博士學位論文全文數(shù)據庫 前4條

1 薛國棟;分布式信源編碼理論與應用研究[D];北京郵電大學;2009年

2 吳憲云;分布式信源編碼關鍵技術研究[D];西安電子科技大學;2012年

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10 關春生;Turbo碼在分布式信源編碼中的應用研究[D];北京郵電大學;2008年

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本文編號：715662