本文關(guān)鍵詞：基于分布式信源編碼的微生物基因組序列壓縮算法

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【摘要】：提出一種基于分布式信源編碼的微生物基因組序列壓縮算法,用于改進(jìn)微生物基因組序列壓縮效率不高的現(xiàn)狀.首先將微生物基因組序列映射為兩條二進(jìn)制序列并映射為兩幅二值圖像以便使用更多的信源相關(guān)性.然后構(gòu)建分布式信源編碼來同時(shí)傳輸兩個(gè)二值圖像.同時(shí),為保證邊信息傳輸?shù)母咝?優(yōu)化Context加權(quán)方法被用于邊信息壓縮.實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,與現(xiàn)有微生物基因組序列壓縮算法相比較,該算法能獲得更高的壓縮效率,并且保持較合理的運(yùn)算復(fù)雜度.
【作者單位】： 云南警官學(xué)院信息網(wǎng)絡(luò)安全學(xué)院;昆明學(xué)院學(xué)報(bào)編輯部;
【關(guān)鍵詞】： 分布式信源編碼 微生物基因組序列壓縮 邊信息 Context加權(quán) 希爾伯特空間填充
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(61062005) 云南省自然科學(xué)基金青年基金資助項(xiàng)目(2013FD042)
【分類號(hào)】：Q933;TN911.21
【正文快照】： 第二代基因組測序技術(shù)使得獲得的基因組序列數(shù)據(jù)呈指數(shù)級(jí)增長,也對存儲(chǔ)這些數(shù)據(jù)提出了更高的要求[1].在近20 a的研究中,前人基本上給出了三大類針對基因組序列的壓縮算法.一類是基于字典的壓縮,另一類是使用無損熵編碼進(jìn)行壓縮的方法,第三類是最近幾年研究的熱點(diǎn),基于Referenc

【相似文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 李云松;孔繁鏘;吳成柯;雷杰;;基于分布式信源編碼的干涉多光譜圖像壓縮[J];光學(xué)學(xué)報(bào);2008年08期

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前4條

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2 吳憲云;分布式信源編碼關(guān)鍵技術(shù)研究[D];西安電子科技大學(xué);2012年

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中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

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7 曾偉超;基于隨機(jī)交織的分布式信源編碼系統(tǒng)設(shè)計(jì)[D];浙江大學(xué);2008年

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9 王柏巖;非對稱結(jié)構(gòu)分布式信源編碼的研究[D];哈爾濱工業(yè)大學(xué);2014年

10 關(guān)春生;Turbo碼在分布式信源編碼中的應(yīng)用研究[D];北京郵電大學(xué);2008年

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本文編號(hào)：715662