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寡肽的結(jié)構(gòu)性質(zhì)分析以及高效的結(jié)構(gòu)搜索策略的研究

發(fā)布時間:2024-03-10 07:50
  寡肽不僅是構(gòu)成蛋白質(zhì)的片段,同時在生物體體內(nèi)也能形成獨(dú)立功能的小分子,具有極為重要的研究價值。特別是對這些小分子的結(jié)構(gòu)及性質(zhì)的分析,是認(rèn)識蛋白質(zhì)功能的多樣性的基礎(chǔ),從而引起了當(dāng)代科研工作者的廣泛興趣。在文中,借助于分子軌道理論和密度泛函理論等常見的量化計算方法,我們選取了多類寡肽結(jié)構(gòu)體系,研究了多個代表性方向,最后,對實驗光譜解析、金屬離子絡(luò)合以及高效的結(jié)構(gòu)搜索策略等方面給出了一系列創(chuàng)新性的見解。具體而言,本博士學(xué)位論文主要圍繞氣相二肽在多光子共振譜中的非平衡態(tài)轉(zhuǎn)化對最終光譜解析的影響,二肽與堿/堿土金屬的絡(luò)合特征以及如何高效的搜索寡肽勢能面的特征構(gòu)型三個大方向來分析展開,下面來簡單地介紹各章節(jié)的主要內(nèi)容。第一章首先簡約介紹和回顧了用于分子體系計算研究的主要理論與方法,包括多種從頭計算方法,密度泛函理論方法和半經(jīng)驗方法,同時也羅列了基函數(shù)的相關(guān)概念和振動光譜計算的一些基本知識。最后,對本論文研究所用到的主要計算軟件進(jìn)行了簡要介紹。第二章主要描述了氨基酸和多肽分子的定義以及對其研究的重要性,并簡單地介紹了目前國際上對本文內(nèi)容相關(guān)領(lǐng)域的實驗及理論方面的研究現(xiàn)狀。同時,本章也概括和分析目前研...

【文章頁數(shù)】:130 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

圖1.2自治方法求解HF方程的流程圖

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圖1.3Levy變分原理的示意圖,摘自文獻(xiàn)[8]0

圖1.3Levy變分原理的示意圖,摘自文獻(xiàn)[8]0

定理二很容易得到證明,如圖1.3所示,基態(tài)能對應(yīng)??E〇?=密度與波函數(shù)是對應(yīng)的,所以??[P(r〇]?=?F[p]?+?JV(r)V(r)dr?2?巧0|/?|%〉=?Ey?[p〇]?=?F[p]?=?T[p)+Eee[p]同時也提供了一種計算基態(tài)能量與相應(yīng)的電子密度的變分an....


圖1.4自洽法求解KS方程的流程圖

圖1.4自洽法求解KS方程的流程圖

?(1.44)??方程(1.43)在形式上與Hartree-Fock方程類似,求解的方式也是運(yùn)用迭代的??方法(如圖1.4所示),得到方程的解{也},進(jìn)而便可進(jìn)一步求解體系對應(yīng)的基??態(tài)的電子密度與與之對應(yīng)的能量值。其中,解得的KS軌道與HF軌道的形??狀也很類似,通?蓪⑵淇闯....


圖2.3激光感應(yīng)熒光光譜的原理示意圖,摘自文獻(xiàn)[14]

圖2.3激光感應(yīng)熒光光譜的原理示意圖,摘自文獻(xiàn)[14]

?B??圖2.4共振多光子電離的原理示意圖,摘自文獻(xiàn)[14]。??共振多光子電離譜是研宄光與物質(zhì)相互作用的重要方法,具有較高的探測靈??敏度且能夠提供能級信息,廣泛運(yùn)用于氣相寡肽的單分子光譜測量、同位素分離、??分析化學(xué)以及里德堡態(tài)等領(lǐng)域的研究。與單光子吸收不同,如圖2.4所示,....



本文編號:3924471

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