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回溯搜索丁型肝炎病毒核酶的折疊路徑

發(fā)布時間:2022-12-07 20:35
  RNA生物功能與其折疊的動力學過程密切相關。文章采用枚舉法給出丁型肝炎病毒(Hepatitis Delta Virus,HDV)核酶序列的折疊空間,作為回溯搜索的解空間。結合自由能曲面計算了空間內(nèi)構象之間的轉換速率。采用回溯搜索算法,從天然態(tài)開始確定了HDV核酶序列的折疊路徑,并利用主方程方法分析了路徑上具有直接轉換關系的結構之間占據(jù)幾率隨時間的變化。結果顯示,HDV天然態(tài)的形成過程呈兩相性,并且主要有3條折疊路徑。另外在折疊過程中存在一個滯留時間較長的中間態(tài)假結結構。 

【文章頁數(shù)】:6 頁

【參考文獻】:
期刊論文
[1]在直角坐標系中回溯枚舉RNA結構[J]. 鄒彥娟,石方.  萍鄉(xiāng)學院學報. 2018(06)



本文編號:3712799

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