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非平衡基因數(shù)據(jù)的差異表達(dá)基因選擇算法研究

發(fā)布時(shí)間:2022-11-03 19:03
  針對(duì)準(zhǔn)確率不適于評(píng)價(jià)不平衡數(shù)據(jù)特征子集性能的缺陷,提出了F2-measure(簡(jiǎn)稱F2)準(zhǔn)則.為避免mRMR(minimal Redundancy-Maximal Relevance)的互信息方法傾向于選擇多值特征,提出了歸一化互信息SU(Symmetrical Uncertainty).針對(duì)最大化AUC(Area Under an ROC Curve)框架下,特征選擇算法的特征與類標(biāo)相關(guān)性、特征間相關(guān)性的取值范圍(量綱)不一致問(wèn)題,提出了歸一化的特征權(quán)重.為加快特征選擇過(guò)程,提出了結(jié)合SU和AUC的特征預(yù)選擇,縮小特征搜索空間.提出動(dòng)態(tài)加權(quán)順序前向搜索DWSFS(Dynamic Weighted Sequential Forward Search)和動(dòng)態(tài)加權(quán)順序前向浮動(dòng)搜索DWSFFS(Dynamic Weighted Sequential Forward Floating Search),以期得到分類性能更好的特征子集.基于最大化AUC和mRMR框架,結(jié)合上述創(chuàng)新點(diǎn),設(shè)計(jì)出16種特征選擇算法.7個(gè)經(jīng)典二類不平衡基因數(shù)據(jù)集、3個(gè)多類不平衡(或近似平衡)基因數(shù)據(jù)集的50次重復(fù)實(shí)驗(yàn)表明:... 

【文章頁(yè)數(shù)】:20 頁(yè)

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]最大化ROC曲線下面積的不平衡基因數(shù)據(jù)集差異表達(dá)基因選擇算法[J]. 謝娟英,王明釗,胡秋鋒.  陜西師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2017(01)
[2]腫瘤基因選擇方法LLE Score[J]. 李建更,逄澤楠,蘇磊,陳思遠(yuǎn).  北京工業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(08)
[3]一種基于區(qū)分能力的多類不平衡文本分類特征選擇方法[J]. 張延祥,潘海俠.  中文信息學(xué)報(bào). 2015(04)
[4]基于統(tǒng)計(jì)相關(guān)性與K-means的區(qū)分基因子集選擇算法[J]. 謝娟英,高紅超.  軟件學(xué)報(bào). 2014(09)
[5]基于特征子集區(qū)分度與支持向量機(jī)的特征選擇算法[J]. 謝娟英,謝維信.  計(jì)算機(jī)學(xué)報(bào). 2014(08)
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[8]一種基于遞歸分類樹(shù)的集成特征基因選擇方法[J]. 李霞,張?zhí)镂?郭政.  計(jì)算機(jī)學(xué)報(bào). 2004(05)



本文編號(hào):3700453

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