提出了一種基于PSO_BFA優(yōu)化的詞袋模型。傳統(tǒng)詞袋模型有兩個(gè)重要參數(shù):窗口大小d和字典大小k。結(jié)合粒子群算法和細(xì)菌覓食算法產(chǎn)生新的PSO_BFA混合優(yōu)化算法,在PSO進(jìn)行局部搜索時(shí),加入BFA的復(fù)制和遷移行為,得到PSO_BFA的最優(yōu)解即為窗口大小和字典大小的最佳組合。將優(yōu)化詞袋模型與蛋白質(zhì)序列的氨基酸組成算法和偽氨基酸組成算法結(jié)合,獲得蛋白質(zhì)序列的詞袋特征。實(shí)驗(yàn)結(jié)果證明,基于PSO_BFA優(yōu)化的詞袋模型能有效提高蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)的精度。 

【文章來(lái)源】：計(jì)算機(jī)工程與應(yīng)用. 2020,56(01)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：7 頁(yè)

【部分圖文】：

PSO＿BFA混合優(yōu)化算法流程圖

優(yōu)化前后的BOW＿PseAAC在ZD98上的預(yù)測(cè)結(jié)果

優(yōu)化前后的BOW＿AAC在CH317上的預(yù)測(cè)結(jié)果

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]詞袋模型在蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)中的應(yīng)用[J]. 趙南,張梁,薛衛(wèi),王雄飛,任守綱.  食品與生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2017(03)
[2]三角形約束下的詞袋模型圖像分類(lèi)方法[J]. 汪榮貴,丁凱,楊娟,薛麗霞,張清楊.  軟件學(xué)報(bào). 2017(07)
[3]相似性比對(duì)預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)亞細(xì)胞區(qū)間[J]. 王雄飛,張梁,薛衛(wèi),趙南,徐煥良.  微生物學(xué)通報(bào). 2016(10)
[4]基于多方向空間詞袋模型的物體識(shí)別[J]. 齊梅,胡敏.  計(jì)算機(jī)工程與應(yīng)用. 2017(07)
[5]改進(jìn)BFO算法在函數(shù)優(yōu)化問(wèn)題上的應(yīng)用[J]. 曹天問(wèn),雷秀娟.  計(jì)算機(jī)工程與應(yīng)用. 2013(13)
[6]細(xì)菌覓食優(yōu)化算法的研究與應(yīng)用[J]. 周雅蘭.  計(jì)算機(jī)工程與應(yīng)用. 2010(20)
[7]PSO優(yōu)化算法演變及其融合策略[J]. 雷秀娟,史忠科,周亦鵬.  計(jì)算機(jī)工程與應(yīng)用. 2007(07)



本文編號(hào)：3385173