DNA計(jì)算是以DNA分子作為信息載體,各種生物酶作為算子的一種新型計(jì)算模型。DNA計(jì)算具有高度的并行性,超高的存儲密度和極低的能源消耗等優(yōu)勢,為求解NP完全問題提供了一條富有創(chuàng)造性和啟發(fā)性的思路。目前國內(nèi)外學(xué)者密切關(guān)注DNA計(jì)算的發(fā)展動態(tài)并且積極參與DNA計(jì)算的研究工作,DNA計(jì)算技術(shù)已經(jīng)從理論發(fā)展階段到生物實(shí)驗(yàn)的應(yīng)用階段。高質(zhì)量的DNA編碼有助于提高DNA計(jì)算的容錯性與穩(wěn)定性,充足的DNA編碼數(shù)量可以滿足大規(guī)模的應(yīng)用需求。上述兩點(diǎn)對應(yīng)DNA編碼的兩個研究內(nèi)容:DNA編碼的質(zhì)量優(yōu)化和DNA編碼的集合設(shè)計(jì)。DNA編碼的質(zhì)量優(yōu)化是指從滿足約束條件的編碼中篩選一定數(shù)量的高質(zhì)量編碼;DNA編碼的集合設(shè)計(jì)是指已知約束條件和長度,盡可能多的構(gòu)造滿足約束條件的編碼。常用的約束包括組合約束、熱力學(xué)約束和面向應(yīng)用程序約束。這些約束條件能夠有效的避免在DNA計(jì)算過程中發(fā)生不必要的雜交反應(yīng),從而有助于提高DNA計(jì)算結(jié)果的穩(wěn)定性與準(zhǔn)確性。本文側(cè)重于研究DNA編碼的集合設(shè)計(jì),所做工作如下:(1)將蟻群算法和隨機(jī)搜索(ACO_RS)算法相結(jié)合用于設(shè)計(jì)DNA編碼集合。用實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)說明了在DNA編碼設(shè)計(jì)問題上,使用簡化... 

【文章來源】：大連大學(xué)遼寧省

【文章頁數(shù)】：61 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

DNA結(jié)構(gòu)的雙螺旋結(jié)構(gòu)

結(jié)構(gòu)變成無規(guī)則的線性結(jié)構(gòu)。高溫、有機(jī)試劑和強(qiáng)酸強(qiáng)堿等因素均能夠破壞穩(wěn)旋結(jié)構(gòu)并引起 DNA 分子變性。發(fā)生變性之后的 DNA 分子序列通常由二級結(jié)一級結(jié)構(gòu)，但是一級結(jié)構(gòu)不會遭到破壞。變性之后的 DNA 分子理化及生物性以下幾點(diǎn)發(fā)生變化：) 在一定程度上 DNA 分子溶液粘稠度降低。DNA 粘稠度下降的原因是排序十雙螺旋結(jié)構(gòu)發(fā)生變性之后變成毫無規(guī)則且十分松散的線性結(jié)構(gòu)。) 增色效應(yīng)。產(chǎn)生增色效應(yīng)是由于位于 DNA 分子雙螺旋結(jié)構(gòu)內(nèi)側(cè)的堿基在變在外側(cè)從而會產(chǎn)生增色效應(yīng)，DNA 分子變性之后 DNA 溶液吸收紫外線的能力。性的 DNA 分子變成兩條單鏈分子在適當(dāng)?shù)臈l件下根據(jù)堿基互補(bǔ)配對的原則有成雙螺旋結(jié)構(gòu)的 DNA 分子的這個過程稱為 DNA 分子的復(fù)性。DNA 分子的復(fù)的逆轉(zhuǎn)換過程。通過加熱使 DNA 分子序列發(fā)生變性，然后經(jīng)過緩慢冷卻之后加熱之前的狀態(tài)，這個過程稱為退火，如圖 2.5 所示。對 DNA 分子的復(fù)性有素如下:

7 大腸桿菌外切酶III ( Exo III)的作用iagram about the role of Escherichia col位置不同可以將內(nèi)切酶大致分為的特定性，并且作用點(diǎn)也可以稱為。III與I型的酶具有一些相同的為苛刻。II型的酶是比較特殊的求切入點(diǎn)一定在識別順序之中。I 和 HaeI II等這些都是常用的限制個字母的大寫，后面的兩個小寫字標(biāo)志性字母，如 Eco RI中的 R 和性內(nèi)切酶，那么就按照羅馬數(shù)字aeI II。數(shù)有一個特點(diǎn)，那就是具有一百序的內(nèi)部。平頭末端指的是雙鏈點(diǎn)位置相同，如 AluI 和 HaeI II。粘


本文編號：2903575