癌癥精準(zhǔn)用藥知識(shí)搜索系統(tǒng)
發(fā)布時(shí)間:2020-12-06 23:44
癌癥發(fā)生率的不斷升高威脅著人們健康,并且癌癥的復(fù)雜性和異質(zhì)性使得癌癥治療面臨巨大的困難,癌癥死亡率居高不下。近年來(lái),隨著測(cè)序技術(shù)的飛速發(fā)展,癌癥精準(zhǔn)醫(yī)療迎來(lái)前所未有的機(jī)遇,積累了大量精準(zhǔn)醫(yī)療知識(shí)。但是目前病人和醫(yī)生根據(jù)組學(xué)測(cè)序數(shù)據(jù),直接利用精準(zhǔn)醫(yī)療知識(shí)進(jìn)行疾病干預(yù)還需要花費(fèi)大量時(shí)間,方便快捷地根據(jù)病人組學(xué)特征推薦精準(zhǔn)用藥策略的搜索系統(tǒng)還有待發(fā)展。本論文構(gòu)建了一套癌癥精準(zhǔn)用藥知識(shí)搜索系統(tǒng),使用主流的分析流程從病人組學(xué)測(cè)序數(shù)據(jù)中提取組學(xué)特征,包括單核苷酸變異、可變剪切、基因融合、基因表達(dá)量等,然后根據(jù)病人組學(xué)特征快速搜索精準(zhǔn)用藥策略。搜索系統(tǒng)包含三個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)和一個(gè)搜索算法:病例組學(xué)特征數(shù)據(jù)庫(kù)用于存儲(chǔ)病人組學(xué)特征;精準(zhǔn)用藥知識(shí)庫(kù)整合了四大精準(zhǔn)醫(yī)療數(shù)據(jù)源,包括我的基因組、基于癌癥基因組藥物敏感性數(shù)據(jù)庫(kù)的精準(zhǔn)用藥預(yù)測(cè)資源、美國(guó)食品藥品監(jiān)督局的伴隨診斷、美國(guó)國(guó)立綜合癌癥網(wǎng)絡(luò)的臨床實(shí)踐指南;生物醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)參考數(shù)據(jù)庫(kù)用于輔助搜索過(guò)程和提供擴(kuò)展信息;搜索算法用于聯(lián)結(jié)這三個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)并實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)用藥和相關(guān)知識(shí)的搜索規(guī)則。在基于胃癌病人轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)的應(yīng)用實(shí)例中,搜索系統(tǒng)報(bào)告了包括藥物伊馬替尼在內(nèi)的十種可能的用藥策略...
【文章來(lái)源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:98 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-1精準(zhǔn)用藥知識(shí)搜索系統(tǒng)總體框架??本論文內(nèi)容主要包括三大部分:??首先,綜述癌癥治療與精準(zhǔn)醫(yī)療現(xiàn)狀
組學(xué)特征數(shù)據(jù)庫(kù)。??2.2數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)構(gòu)??病例組學(xué)特征數(shù)據(jù)庫(kù)的設(shè)計(jì)結(jié)構(gòu)(圖2-3),包括設(shè)計(jì)各個(gè)數(shù)據(jù)表的結(jié)構(gòu)以及數(shù)??據(jù)表與表之間的關(guān)系,使得數(shù)據(jù)庫(kù)能夠完整、準(zhǔn)確以及統(tǒng)一地保存獲得的組學(xué)特??征,便于后續(xù)搜索精準(zhǔn)用藥知識(shí)庫(kù)。??]caseoutcome??'_K??表達(dá)量?!?基因融合??」patientexpressionstringtie?I? ̄|?patientrearrangementstarfusion??L??!丨?」??丄丨1??T?=F?=F??□?SingleCase??病例??I?I???I?I???SNV??H?patientsnpannovar???」patientasevent??千?、一?_’T5.??i?i??□?patientsnpannovaraachangerefgene?□?patientaseventannotation??SNV?jǐn)U展信息?可變剪切擴(kuò)展信息??
基于}A的病例庫(kù)管理程序
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]腫瘤的精準(zhǔn)醫(yī)療腫瘤的精準(zhǔn)醫(yī)療:概念、技術(shù)和展望[J]. 杭渤,束永前,劉平,魏光偉,金健,郝文山,王培俊,李斌,毛建華. 科技導(dǎo)報(bào). 2015(15)
[2]非小細(xì)胞肺癌靶向藥物的開(kāi)發(fā)研究進(jìn)展[J]. 杜海洲,楊春華,劉桂玲,劉娜,王天津. 中國(guó)新藥雜志. 2011(16)
本文編號(hào):2902210
【文章來(lái)源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:98 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-1精準(zhǔn)用藥知識(shí)搜索系統(tǒng)總體框架??本論文內(nèi)容主要包括三大部分:??首先,綜述癌癥治療與精準(zhǔn)醫(yī)療現(xiàn)狀
組學(xué)特征數(shù)據(jù)庫(kù)。??2.2數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)構(gòu)??病例組學(xué)特征數(shù)據(jù)庫(kù)的設(shè)計(jì)結(jié)構(gòu)(圖2-3),包括設(shè)計(jì)各個(gè)數(shù)據(jù)表的結(jié)構(gòu)以及數(shù)??據(jù)表與表之間的關(guān)系,使得數(shù)據(jù)庫(kù)能夠完整、準(zhǔn)確以及統(tǒng)一地保存獲得的組學(xué)特??征,便于后續(xù)搜索精準(zhǔn)用藥知識(shí)庫(kù)。??]caseoutcome??'_K??表達(dá)量?!?基因融合??」patientexpressionstringtie?I? ̄|?patientrearrangementstarfusion??L??!丨?」??丄丨1??T?=F?=F??□?SingleCase??病例??I?I???I?I???SNV??H?patientsnpannovar???」patientasevent??千?、一?_’T5.??i?i??□?patientsnpannovaraachangerefgene?□?patientaseventannotation??SNV?jǐn)U展信息?可變剪切擴(kuò)展信息??
基于}A的病例庫(kù)管理程序
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]腫瘤的精準(zhǔn)醫(yī)療腫瘤的精準(zhǔn)醫(yī)療:概念、技術(shù)和展望[J]. 杭渤,束永前,劉平,魏光偉,金健,郝文山,王培俊,李斌,毛建華. 科技導(dǎo)報(bào). 2015(15)
[2]非小細(xì)胞肺癌靶向藥物的開(kāi)發(fā)研究進(jìn)展[J]. 杜海洲,楊春華,劉桂玲,劉娜,王天津. 中國(guó)新藥雜志. 2011(16)
本文編號(hào):2902210
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