癌癥發(fā)生率的不斷升高威脅著人們健康,并且癌癥的復雜性和異質(zhì)性使得癌癥治療面臨巨大的困難,癌癥死亡率居高不下。近年來,隨著測序技術(shù)的飛速發(fā)展,癌癥精準醫(yī)療迎來前所未有的機遇,積累了大量精準醫(yī)療知識。但是目前病人和醫(yī)生根據(jù)組學測序數(shù)據(jù),直接利用精準醫(yī)療知識進行疾病干預還需要花費大量時間,方便快捷地根據(jù)病人組學特征推薦精準用藥策略的搜索系統(tǒng)還有待發(fā)展。本論文構(gòu)建了一套癌癥精準用藥知識搜索系統(tǒng),使用主流的分析流程從病人組學測序數(shù)據(jù)中提取組學特征,包括單核苷酸變異、可變剪切、基因融合、基因表達量等,然后根據(jù)病人組學特征快速搜索精準用藥策略。搜索系統(tǒng)包含三個數(shù)據(jù)庫和一個搜索算法:病例組學特征數(shù)據(jù)庫用于存儲病人組學特征;精準用藥知識庫整合了四大精準醫(yī)療數(shù)據(jù)源,包括我的基因組、基于癌癥基因組藥物敏感性數(shù)據(jù)庫的精準用藥預測資源、美國食品藥品監(jiān)督局的伴隨診斷、美國國立綜合癌癥網(wǎng)絡的臨床實踐指南;生物醫(yī)學基礎參考數(shù)據(jù)庫用于輔助搜索過程和提供擴展信息;搜索算法用于聯(lián)結(jié)這三個數(shù)據(jù)庫并實現(xiàn)精準用藥和相關(guān)知識的搜索規(guī)則。在基于胃癌病人轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)的應用實例中,搜索系統(tǒng)報告了包括藥物伊馬替尼在內(nèi)的十種可能的用藥策略... 

【文章來源】：浙江大學浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：98 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１－１精準用藥知識搜索系統(tǒng)總體框架??本論文內(nèi)容主要包括三大部分：??首先，綜述癌癥治療與精準醫(yī)療現(xiàn)狀

組學特征數(shù)據(jù)庫。??２．２數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu)??病例組學特征數(shù)據(jù)庫的設計結(jié)構(gòu)（圖２－３），包括設計各個數(shù)據(jù)表的結(jié)構(gòu)以及數(shù)??據(jù)表與表之間的關(guān)系，使得數(shù)據(jù)庫能夠完整、準確以及統(tǒng)一地保存獲得的組學特??征，便于后續(xù)搜索精準用藥知識庫。??］ｃａｓｅｏｕｔｃｏｍｅ??＇＿Ｋ??表達量?！?基因融合??」ｐａｔｉｅｎｔｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｓｔｒｉｎｇｔｉｅ?Ｉ?￣｜?ｐａｔｉｅｎｔｒｅａｒｒａｎｇｅｍｅｎｔｓｔａｒｆｕｓｉｏｎ??Ｌ??！丨?」??丄丨１??Ｔ?＝Ｆ?＝Ｆ??□?ＳｉｎｇｌｅＣａｓｅ?？病例??Ｉ?Ｉ???Ｉ?Ｉ???ＳＮＶ??Ｈ?ｐａｔｉｅｎｔｓｎｐａｎｎｏｖａｒ?？?」ｐａｔｉｅｎｔａｓｅｖｅｎｔ??千?、一?＿’Ｔ５．??ｉ?ｉ??□?ｐａｔｉｅｎｔｓｎｐａｎｎｏｖａｒａａｃｈａｎｇｅｒｅｆｇｅｎｅ?□?ｐａｔｉｅｎｔａｓｅｖｅｎｔａｎｎｏｔａｔｉｏｎ??ＳＮＶ擴展信息?可變剪切擴展信息??

基于}A的病例庫管理程序

【參考文獻】：
期刊論文
[1]腫瘤的精準醫(yī)療腫瘤的精準醫(yī)療:概念、技術(shù)和展望[J]. 杭渤,束永前,劉平,魏光偉,金健,郝文山,王培俊,李斌,毛建華.  科技導報. 2015(15)
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本文編號：2902210