【摘要】：隨著生物信息學(xué)領(lǐng)域資源信息的不斷增加，用戶(hù)使用通用引擎搜索專(zhuān)業(yè)信息時(shí)出現(xiàn)很多弊端，例如：返回信息過(guò)多、存在無(wú)用的信息、準(zhǔn)確率低等。針對(duì)這些情況，為滿(mǎn)足用戶(hù)需求的某一專(zhuān)業(yè)學(xué)科領(lǐng)域信息的專(zhuān)業(yè)語(yǔ)義搜索引擎應(yīng)運(yùn)而生。 語(yǔ)義檢索是信息檢索與人工智能技術(shù)、自然語(yǔ)言技術(shù)相結(jié)合的一種檢索方法，本文將本體與數(shù)據(jù)挖掘、生物信息學(xué)術(shù)語(yǔ)的標(biāo)準(zhǔn)化、生物信息數(shù)據(jù)的整合都聯(lián)系起來(lái)，最后形成一套完善的生物信息學(xué)本體論，用以整合所有與基因或蛋白質(zhì)相關(guān)的數(shù)據(jù)，并且能夠描述各生物體概念的屬性及相互關(guān)系。 本文分析了國(guó)內(nèi)外對(duì)信息檢索的研究情況，指出傳統(tǒng)信息檢索的不足，提出能夠?qū)崿F(xiàn)語(yǔ)義層次檢索的語(yǔ)義檢索。接著對(duì)本體的相關(guān)概念及常用的關(guān)于本體的構(gòu)建工具及構(gòu)建方法做了詳細(xì)的介紹，分析各自的優(yōu)點(diǎn)與不足，綜合考慮各種構(gòu)建方法的優(yōu)勢(shì)，，并結(jié)合生物信息學(xué)的實(shí)際情況，提出基于《生物信息學(xué)分類(lèi)》構(gòu)建生物信息學(xué)領(lǐng)域本體。研究基于生物信息學(xué)本體的語(yǔ)義檢索在生物信息學(xué)領(lǐng)域資源中的一些關(guān)鍵技術(shù)，其中著重描述了生物信息學(xué)本體結(jié)構(gòu)中的概念在語(yǔ)義層次的查詢(xún)擴(kuò)展。隨后，對(duì)語(yǔ)義相似度的計(jì)算方法進(jìn)行了改進(jìn)，分析語(yǔ)義關(guān)系對(duì)語(yǔ)義相似度的影響；并從概念及概念和概念之間的語(yǔ)義關(guān)系等方面對(duì)關(guān)鍵詞進(jìn)行了語(yǔ)義擴(kuò)展。將以上所研究的這些技術(shù)運(yùn)用于生物信息學(xué)數(shù)據(jù)平臺(tái)，建立生物信息學(xué)系統(tǒng)領(lǐng)域的本體知識(shí)庫(kù)，實(shí)現(xiàn)語(yǔ)義檢索功能，通過(guò)測(cè)試驗(yàn)證該方法可以提高數(shù)據(jù)檢索的查全率與查準(zhǔn)率。
[Abstract]:With the increasing of resource information in the field of bioinformatics, there are many drawbacks when users search for professional information using general engine, for example, too much information is returned, there is useless information, and the accuracy is low. In order to meet the needs of users, a professional semantic search engine is developed to meet the needs of users. Semantic retrieval is a retrieval method which combines information retrieval with artificial intelligence and natural language technology. In this paper, ontology and data mining, standardization of bioinformatics terms and integration of biological information data are linked. Finally, a complete set of bioinformatics ontology is formed to integrate all the data related to genes or proteins, and to describe the attributes and relationships of various biological concepts. This paper analyzes the research situation of information retrieval at home and abroad, points out the deficiency of traditional information retrieval, and puts forward the semantic retrieval which can realize semantic level retrieval. Then the related concepts of ontology and the tools and methods of ontology construction are introduced in detail, the advantages and disadvantages of each method are analyzed, the advantages of various construction methods are comprehensively considered, and combined with the actual situation of bioinformatics, A domain ontology of bioinformatics based on taxonomy of bioinformatics is proposed. This paper studies some key technologies of semantic retrieval based on bioinformatics ontology in bioinformatics resources, in which the query extension of concepts in ontology structure of bioinformatics at the semantic level is described emphatically. Then, the calculation method of semantic similarity is improved, the influence of semantic relation on semantic similarity is analyzed, and the semantic extension of keywords is carried out from the aspects of concept and semantic relation between concepts. These techniques are applied to bioinformatics data platform to establish ontology knowledge base of bioinformatics system and realize semantic retrieval function. The method can improve the recall and precision of data retrieval by testing.
【學(xué)位授予單位】：中北大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2012
【分類(lèi)號(hào)】：TP391.3

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本文編號(hào)：2433350