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蛇毒蛋白質(zhì)組學(xué)研究進展

發(fā)布時間:2018-04-09 06:24

  本文選題:蛇毒 切入點:蛋白質(zhì)組學(xué) 出處:《陜西師范大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版)》2008年06期


【摘要】:就蛇毒蛋白質(zhì)組學(xué)研究的主要方法、所取得的成就及存在的問題進行了綜述.利用高通量質(zhì)譜技術(shù)對蛇毒組分進行全方位研究,是近年來蛋白組學(xué)研究中的一個熱點.蛇毒蛋白質(zhì)組學(xué)研究包括粗毒分離、質(zhì)譜分析及生物信息學(xué)鑒定三個部分.粗毒分離的主要方法包括雙向電泳、凝膠過濾及反相-高效液相色譜;質(zhì)譜分析的方法包括基質(zhì)輔助激光解離-飛行時間質(zhì)譜、液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用、電噴霧離子化串聯(lián)質(zhì)譜和電噴霧離子化傅立葉變換離子回旋共振質(zhì)譜;而利用MS-Fit或Mascot搜索引擎訪問相應(yīng)的蛋白質(zhì)專門網(wǎng)站對質(zhì)譜所獲肽序進行查詢則是生物信息學(xué)鑒定的主要方法.迄今,利用蛋白質(zhì)組技術(shù)已經(jīng)對游蛇科、眼鏡蛇科、蝰科中的58個屬100多種(亞種)蛇毒的毒物進行了研究,鑒定出了十多個蛋白質(zhì)家族.這些結(jié)果不僅有助于增強人們對毒素進化與分化以及中毒機理的了解,并對新藥設(shè)計中的先導(dǎo)化合物尋找具有重要意義.未來,蛇毒蛋白質(zhì)組學(xué)研究在與高通量蛇毒組的絕對定量及所鑒定蛋白的功能表征有關(guān)的方法技術(shù)方面仍有待突破.
[Abstract]:The main methods, achievements and problems in proteomics of snake venom were reviewed.The study of snake venom components by high throughput mass spectrometry (HMS) has been a hotspot in proteomics in recent years.The proteomics study of snake venom includes three parts: isolation of crude venom, mass spectrum analysis and bioinformatics identification.The main methods for the separation of crude toxins include two-dimensional electrophoresis, gel filtration and reversed-phase high performance liquid chromatography; mass spectrometry methods include matrix assisted laser dissociation-time-of-flight mass spectrometry, liquid chromatography-mass spectrometry,Electrospray ionization tandem mass spectrometry and electrospray ionization Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry;The main method of bioinformatics identification is to use MS-Fit or Mascot search engine to visit the corresponding protein website to query the peptide sequence obtained by mass spectrometry.Up to now, more than 10 families of proteins have been identified by proteome technique in 58 genera and 100 species of venom of Viperidae, Cobra and Viperidae.These results not only help to enhance the understanding of the evolution and differentiation of toxins and the mechanism of poisoning, but also play an important role in finding leading compounds in the design of new drugs.In the future, the proteomics of snake venom needs to be improved in terms of absolute quantification of high-throughput snake venom and functional characterization of identified proteins.
【作者單位】: 陜西師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;西安回天血液制品有限責(zé)任公司;
【基金】:國家自然科學(xué)基金資助項目(30870303) 陜西省自然科學(xué)基金資助項目(SJ08C102)
【分類號】:R99

【參考文獻】

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【共引文獻】

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10 曹t,

本文編號:1725252


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