本文選題：串聯(lián)質(zhì)譜　切入點(diǎn)：蛋白質(zhì)鑒定　出處：《生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展》2016年07期

【摘要】：基于串聯(lián)質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組研究會(huì)產(chǎn)生海量的質(zhì)譜數(shù)據(jù),這些數(shù)據(jù)通常使用數(shù)據(jù)庫(kù)搜索引擎進(jìn)行鑒定分析,并根據(jù)肽段譜圖匹配(PSM)反推真實(shí)的樣品蛋白質(zhì).對(duì)于高通量蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)的處理,其鑒定結(jié)果的可信是后續(xù)分析應(yīng)用的前提,因此對(duì)鑒定結(jié)果的質(zhì)量控制尤為重要,而基于目標(biāo)-誘餌庫(kù)(target-decoy)搜索策略的質(zhì)量控制是目前應(yīng)用最為廣泛的方法.本文首先介紹了基于目標(biāo)-誘餌庫(kù)搜索策略搜庫(kù)和質(zhì)量控制的實(shí)施流程,然后綜述了基于目標(biāo)-誘餌庫(kù)搜索策略的質(zhì)量控制工具,并提出了目標(biāo)-誘餌庫(kù)搜索策略的不足及改善方法,最后對(duì)目標(biāo)-誘餌庫(kù)搜索策略進(jìn)行了總結(jié)與展望.
[Abstract]:Proteomics studies based on tandem mass spectrometry produce vast amounts of mass spectrum data, which are usually identified and analyzed using database search engines. According to the peptide spectrum matching (PSM), the true sample proteins are inversely deduced. For the processing of high-throughput proteome data, the credibility of the identification results is the premise of subsequent analysis and application, so the quality control of the identification results is particularly important. However, quality control based on target-decoy) search strategy is the most widely used method at present. Firstly, this paper introduces the implementation flow of searching strategy and quality control based on target-decoy library. Then the quality control tools based on the target-decoy library search strategy are summarized, and the shortcomings and improvement methods of the target-decoy library search strategy are proposed. Finally, the target decoy library search strategy is summarized and prospected.
【作者單位】： 重慶郵電大學(xué)生物信息學(xué)研究所;軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院放射與輻射醫(yī)學(xué)研究所蛋白質(zhì)藥物國(guó)家工程研究中心北京蛋白質(zhì)組研究中心蛋白質(zhì)組學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室國(guó)家蛋白質(zhì)科學(xué)中心(北京);
【基金】：國(guó)際合作計(jì)劃(2014DFB30010) 國(guó)家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃(973)(2013CB910800) 國(guó)家自然科學(xué)基金(21475150,21105121,61501071)資助項(xiàng)目 重慶市研究生科研創(chuàng)新項(xiàng)目(CYS14154)資助~~
【分類號(hào)】：Q503

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 Tao Chen;Jie Zhao;Jie Ma;Yunping Zhu;;Web Resources for Mass Spectrometry-based Proteomics[J];Genomics,Proteomics & Bioinformatics;2015年01期

【共引文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前2條

1 馮曉東;馬潔;常乘;白明澤;朱云平;舒坤賢;;目標(biāo)-誘餌庫(kù)搜索策略在蛋白質(zhì)組質(zhì)譜鑒定和質(zhì)控中的應(yīng)用及研究進(jìn)展[J];生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展;2016年07期

2 吳健;朱海霞;趙志荀;顏新敏;趙銀龍;吳娜;李健;張志東;張強(qiáng);李影;吳國(guó)華;;蛋白質(zhì)互作研究技術(shù)[J];動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展;2016年02期

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前7條

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5 曾長(zhǎng)清;王玉v，

本文編號(hào)：1673987