本文關(guān)鍵詞：基于ProteinGoggle 2.0的組蛋白H4蛋白質(zhì)變體的自上而下表征（英文）　出處：《色譜》2016年12期 　論文類(lèi)型：期刊論文

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【摘要】：由于大量可能蛋白質(zhì)變體以及每一個(gè)翻譯后修飾大量可能位點(diǎn)的存在,核心組蛋白上密集的組合式翻譯后修飾的自上而下表征一直是一個(gè)巨大的分析挑戰(zhàn)。結(jié)合高分辨串級(jí)質(zhì)譜,基于同位素質(zhì)荷比和輪廓指紋比對(duì)的整體蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)搜索引擎ProteinGoggle 2.0在組蛋白翻譯后修飾的自上而下鑒定方面擁有諸多獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。該文報(bào)道ProteinGoggle 2.0對(duì)HeLa核心組蛋白H4的數(shù)據(jù)庫(kù)搜索及蛋白質(zhì)變體的鑒定結(jié)果�；趶腢niProt網(wǎng)站下載的人類(lèi)核心組蛋白H4的純文本文件和"鳥(niǎo)槍法"注釋,ProteinGoggle 2.0首先創(chuàng)建包含所有可能蛋白質(zhì)變體的理論數(shù)據(jù)庫(kù);從純文本文件中提取的信息主要是氨基酸序列、可能的翻譯后修飾(單甲基化、二甲基化、三甲基化、乙�；土姿峄�)及氨基酸變異(A77→P)。在控制質(zhì)譜水平假陽(yáng)性率低于1%的前提下,共鑒定到426個(gè)蛋白質(zhì)變體,這是目前為止H4蛋白質(zhì)變體的最全報(bào)道。這些ProteinGoggle 2.0鑒定到的H4蛋白質(zhì)變體也與之前報(bào)道的ProSightPC 2.0的鑒定結(jié)果進(jìn)行了肩并肩比較�？偠灾�,ProteinGoggle 2.0可以對(duì)具有復(fù)雜組合修飾及氨基酸變異的蛋白質(zhì)組進(jìn)行數(shù)據(jù)庫(kù)搜索和蛋白質(zhì)變體鑒定。
【作者單位】： 同濟(jì)大學(xué)化學(xué)科學(xué)與工程學(xué)院上海市化學(xué)品分析風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估與控制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：National Natural Science Foundation of China(No.21575104) China State Key Basic Research Program(No.2013CB911203) Shanghai Science and Technology Commission(No.14DZ2261100)
【分類(lèi)號(hào)】：Q51
【正文快照】： Histones,as chromatin proteins,play impor-thus pre-processing of de-isotoping as uniformlytant roles not only in structural organization ofpracticed in all the other search engines is avoi-DNA,but also in regulation of almost all DNA ac-ded.The iMEF algo

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前4條

1 劉瑩;金文杰;叢冰冰;;H4菌株對(duì)環(huán)己烷的降解性能[J];遼寧科技大學(xué)學(xué)報(bào);2014年03期

2 劉春玲;王春武;王廣德;喬忠良;姜文龍;么艷平;陳萬(wàn)金;;電子束蒸鍍H4膜工藝及其在808nm激光器腔面膜上的應(yīng)用[J];中國(guó)激光;2010年12期

3 宮明,倪菊華,賈弘，

本文編號(hào)：1311842