本文關(guān)鍵詞：鯔形目魚類的分子系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系和歷史生物地理學(xué)研究

  更多相關(guān)文章： 鯔形目 鯔科 線粒體基因組全序列 核基因 系統(tǒng)發(fā)育 地理分布格局

【摘要】：鯔形目(Mugiliformes)魚類隸屬于輻鰭魚綱(Actinopterygii)、真骨魚部(Teleostei)、真真骨魚亞部(Euteleostei)、棘鰭總目(Acanthopterygii)。鯔形目魚類含1單科,即鯔科(Mugilidae),該類群是重要的海岸帶經(jīng)濟魚類,分布于熱帶和溫帶。鯔形目魚類的系統(tǒng)發(fā)育位置以及屬間系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,一直是魚類系統(tǒng)學(xué)研究的難題。本研究基于線粒體基因組全序列與核基因多位點的分子證據(jù),重建包括鯔形目魚類在內(nèi)的Ovalentaria總目的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,以及鯔形目鯔科魚類屬間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,并結(jié)合形態(tài)特征對鯔科魚類的分類系統(tǒng)進行校訂。另外,全球分布的鯔形目魚類具有兩方面特點：1)屬的地理分布具有局限性；2)地區(qū)間或?qū)匍g物種多樣性差異較大。因此,該類群是開展海洋生物的物種形成過程與地理分布格局歷史成因研究的理想模式群。本研究運用分子鐘技術(shù)重建鯔形目鯔科魚類的進化時間樹,并進一步追溯祖先分布地和祖先棲息溫度帶,結(jié)合古地質(zhì)與古氣候信息,探討鯔形目鯔科魚類地理分布格局的歷史成因。主要研究結(jié)果如下：1、鯔形目魚類的系統(tǒng)發(fā)育位置基于線粒體基因組全序列以及核基因與線粒體基因結(jié)合的多位點證據(jù),重建了包括鯔形目魚類在內(nèi)的Ovalentaria總目的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。結(jié)果表明：1)線粒體基因組證據(jù)與核基因與線粒體基因結(jié)合的多位點證據(jù)均明確支持鯔形目魚類是單源群；2)基于線粒體基因組的證據(jù)支持鯔形目的姊妹群是準(zhǔn)雀鯛科Pseudochromidae3)基于核基因與線粒體基因結(jié)合的多位點證據(jù)支持鰻溭科Congrogadidae與七夕魚科Plesiopidae一起構(gòu)成了鯔形目的姊妹群。2、鯔科魚類屬間系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系基于12個核基因和3個線粒體基因的多位點證據(jù),本研究很好地重建了鯔科魚類屬間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。結(jié)果表明：1)鯔科魚類可分成4個譜系：譜系A(chǔ)位于系統(tǒng)發(fā)育樹的基部,譜系B位于次基部,譜系C與譜系D構(gòu)成姊妹群關(guān)系；2)譜系A(chǔ)包括黏鯔屬Myxus和斜唇鯔屬Neomyxus3)譜系B內(nèi),斧鯔屬Cestraeus位于譜系B的基部,鯔屬Mugil和裂鯔屬Chaenomugil構(gòu)成姊妹群,并一起構(gòu)成長體圓口鯔屬Dajaus+圓口鯔屬Agonostomus+鋸齒鯔屬Joturus的姊妹群；4)譜系C可分為四個亞譜系,亞譜系SC1包括粗口鯔屬Trachystoma+厚唇鯔屬Aldrichetta+銀黢屬Gracilimugil;亞譜系SC2包括劍鯔屬Sicamugil+孟加拉劍鯔屬Minimugil+吻鯔屬Rhinomugil；亞譜系SC3包括大鼻吻鯔屬Squalomugil+截尾鲅屬Ellochelon+角瘤唇鯔屬Plicomugil;亞譜系SC4包括骨鯔屬Osteomugil+粒唇鯔屬Crenimugil;5)譜系D內(nèi),犁鰭鲅屬Neochelon位于譜系D的基部,淡水黏鯔屬Pseudomyxus位于次基部,平?jīng)粚貾laniliza屬+少鱗浕屬Parachelon屬+龜鯔屬Chelon和瘤唇鯔屬Oedalechilus構(gòu)成了姊妹群關(guān)系,并一起構(gòu)成了淡水黏鯔屬的姊妹群；6)該研究結(jié)果為鯔科魚類分類系統(tǒng)的訂正奠定了基礎(chǔ)。3、鯔科魚類的分類系統(tǒng)訂證基于本論文第六章鯔科魚類屬間系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系的結(jié)果,結(jié)合重新確認(rèn)的共源形態(tài)特征,本研究對鯔科魚類的分類系統(tǒng)進行了校訂。主要結(jié)果如下：1)鯔科魚類能分為四個亞科,包括三個新建的黏鯔亞科(Myxinae, new subfamily)、吻鯔亞科(Rhinomugilinae, new subfamily)和龜鯔亞科(Cheloninae, new subfamily),以及一個重新組合的鯔亞科(Mugilinae, new combination); 2)黏鯔亞科包括黏鯔屬和斜唇鯔屬,3)鯔亞科包括斧鯔屬、裂鯔屬、圓口鯔屬、鯔屬；4)吻鯔亞科可進一步分成4個新族,即粗口鯔族(Trachystomaini, new tribe)、吻鯔族(Rhinomugilini, new tribe)、大鼻吻鯔族(Squalomugilini, new tribe)與粒唇鯔族(Crenimugilini, new tribe)。其中,粗口鯔族包括粗口鯔屬、銀浕屬和厚唇鯔屬,吻鯔族包括劍鯔屬、孟加拉劍鯔屬和吻鯔屬,大鼻吻鯔族包括大鼻吻鯔屬、角瘤唇鯔屬和截尾簸屬,粒唇鯔族包括粒唇鯔屬和骨鯔屬；5)龜鯔亞科包括犁鰭浕屬、淡水黏鯔屬、瘤唇鯔屬和龜鯔屬；6)基于重新確認(rèn)的共源形態(tài)特征,建立了鯔科魚類亞科和屬的新檢索表。4、鯔形目鯔科魚類地理分布格局的歷史成因本研究運用分子鐘技術(shù)重建鯔形目鯔科魚類的進化時間樹,并進一步追溯祖先分布地和祖先棲息溫度帶,結(jié)合古地質(zhì)與古氣候信息,探討了鯔形目鯔科魚類地理分布格局的歷史成因。主要結(jié)果如下：1)鯔科魚類在早漸新世起源于西太平洋；2)從漸新世到中新世在西太平洋發(fā)生了黏鯔亞科、鯔亞科、龜鯔亞科和粒唇鯔亞科的最近共同祖先分化的事件；3)鯔科魚類祖先分布于熱帶區(qū)域,大部分從熱帶到亞熱帶或溫帶的遷移都發(fā)生在晚中新世到第四紀(jì)；4)擴散在鯔科魚類地理分布格局形成中扮演了重要角色,而舊世界陸地屏障、新世界陸地屏障、中大西洋屏障和東太平洋屏障四個生物地理隔離事件在中新世至上新世的形成是鯔科魚類屬的區(qū)域性分布的主要原因。綜上所述,本論文基于線粒體基因組和核基因多位點分子證據(jù),1)確認(rèn)了鯔形目魚類是單源群；2)很好地解析了鯔科屬間系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系；3)結(jié)合系統(tǒng)發(fā)育結(jié)果與形態(tài)學(xué)證據(jù),重新校訂了鯔科魚類的分類系統(tǒng),新建了3個亞科與4個新族,并提供了鯔科魚類屬分類單元的檢索表。同時,本研究首先探討了鯔形目鯔科魚類地理分布格局的歷史成因,提出鯔科魚類在早漸新世起源于西太平洋,之后經(jīng)歷了多次擴散事件形成現(xiàn)今鯔科魚類的全球分布格局,而四個生物地理隔離事件,即舊世界陸地屏障、新世界陸地屏障、中大西洋屏障和東太平洋屏障在中新世至上新世的形成是鯔科魚類屬的區(qū)域性分布的主要原因。本研究將不僅為鯔形目魚類多樣性保護提供科學(xué)依據(jù),并將推進魚類系統(tǒng)學(xué)與海洋魚類地理分布格局的成因研究。
【關(guān)鍵詞】：鯔形目 鯔科 線粒體基因組全序列 核基因 系統(tǒng)發(fā)育 地理分布格局
【學(xué)位授予單位】：復(fù)旦大學(xué)
【學(xué)位級別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2014
【分類號】：S917.4
【目錄】：

• 摘要6-9
• Abstract9-12
• 第一章 鯔形目魚類的生物學(xué)概述12-20
• 1.1 物種組成12-14
• 1.2 地理分布及生境14-17
• 1.3 食性17-18
• 1.4 生活史18-19
• 1.5 漁業(yè)和經(jīng)濟價值19-20
• 第二章 鯔形目魚類系統(tǒng)發(fā)育位置的研究進展20-24
• 2.1 鯔形目魚類系統(tǒng)發(fā)育位置的研究歷史20-21
• 2.2 鯔形目魚類姊妹群的分子假說21-23
• 2.3 小結(jié)23-24
• 第三章 鯔科魚類屬間系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系的研究進展24-30
• 3.1 基于形態(tài)證據(jù)的屬間系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系24-26
• 3.2 基于分子證據(jù)的屬問系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系26-29
• 3.3 小結(jié)29-30
• 第四章 本研究的立題依據(jù)、研究目的和研究思路30-34
• 4.1 立題依據(jù)30-31
• 4.2 研究目的31
• 4.3 研究思路31-34
• 第五章 鯔形目魚類的系統(tǒng)發(fā)育位置34-86
• 5.1 線粒體基因組的證據(jù)34-50
• 5.2 核基因與線粒體基因結(jié)合的多位點證據(jù)50-66
• 5.3 討論66-68
• 5.4 小結(jié)68
• 5.5 附錄68-86
• 第六章 鯔科魚類屬間分子系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系86-122
• 6.1 研究方法86-93
• 6.2 研究結(jié)果93-103
• 6.3 討論103-105
• 6.4 小結(jié)105-106
• 附錄106-122
• 第七章 鯔科魚類的分類系統(tǒng)訂證122-154
• 7.1 研究方法122
• 7.2 研究結(jié)果122-136
• 7.3 鯔科魚類亞科和屬的檢索表136-137
• 7.4 小結(jié)137-139
• 附錄139-154
• 第八章 鯔形目鯔科魚類地理分布格局的歷史成因154-172
• 8.1 研究方法154-160
• 8.2 研究結(jié)果160-168
• 8.3 討論168-170
• 8.4 小結(jié)170-172
• 結(jié)論與展望172-176
• 參考文獻176-192
• 附錄 博士在讀期間已發(fā)表、擬投稿論文及獲獎情況192-194
• 致謝194-196

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 褚新洛,陳宜瑜;動物的系統(tǒng)發(fā)育系統(tǒng)——簡介分支系統(tǒng)學(xué)的系統(tǒng)原理和特征分析方法[J];動物學(xué)雜志;1981年01期

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本文編號：661970