癌癥是人類面臨的復雜疾病之一。目前治療方法主要是傳統(tǒng)的手術治療,其次是局部放療、化學療法和內分泌治療,但是術后復發(fā)和轉移仍是困擾研究者的主要問題。隨著生物信息學的發(fā)展,基因治療逐漸應用于癌癥�；蛑委煹念A后效果依賴于癌癥基因標志物的準確度,因此篩選癌癥基因標志物成為當前的研究熱點之一。為了篩選具有較高診斷與鑒別能力的癌癥基因標志物,本文主要探討基于基因標志物構建的癌癥患者預后指數優(yōu)化方法。首先,對來源于腫瘤基因組圖譜數據庫的癌癥基因表達數據進行預處理,對癌癥基因表達數據進行差異分析,選出癌癥中差異表達的基因,分別對比當預后指數選取中位數、平均數和眾數時的生存分析結果。然后,運用擬合函數法優(yōu)化患者預后指數的選取,將差異表達的基因數據分組,進行生存分析和受試者特性曲線評估,篩選出差異性較大的基因,作為基因標志物。進而,運用基因綜合表達數據庫中的獨立數據庫,對篩選出的基因標志物進行評估,驗證所篩選出基因標志物的預后結果。此外,本文以發(fā)病率較高的乳腺癌和死亡率較高的肺癌為例,運用優(yōu)化的預后指數選取方法篩選出乳腺癌和肺癌的基因標志物,為乳腺癌和肺癌的治療策略和準確預后提供一定的科學依據。

【文章頁數】：45 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖3-1PI選取為中位數時的生存分析

第三章乳腺癌患者預后指數優(yōu)化13第三章乳腺癌患者預后指數優(yōu)化第二章主要研究了在選取癌癥基因標志物時癌癥患者預后指數優(yōu)化方法。本章將討論在選取乳腺癌的基因標志物時乳腺癌患者的PI優(yōu)化問題。首先，對來源于TCGA數據庫的乳腺癌數據進行預處理，選取差異表達基因的中位數、平均數和眾數進行....

圖3-2PI選取為平均數時的生存分析

西北民族大學碩士學位論文14（2）選取PI為差異表達基因的平均數時，平均數是差異表達基因組中所有數值的平均值，得到PI為0.428。獲得PI選取為平均數時的生存分析如圖3-2所示，p值為0.000032。從以上當PI分別選取中位數和平均數時的生存分析結果可以看出，乳腺癌患者PI選....

圖3-3PI選取為眾數時的生存分析

西北民族大學碩士學位論文14（2）選取PI為差異表達基因的平均數時，平均數是差異表達基因組中所有數值的平均值，得到PI為0.428。獲得PI選取為平均數時的生存分析如圖3-2所示，p值為0.000032。從以上當PI分別選取中位數和平均數時的生存分析結果可以看出，乳腺癌患者PI選....

圖3-4當乳腺癌患者PI選取中位數時的ROC曲線和AUC值

第三章乳腺癌患者預后指數優(yōu)化15ROC曲線及其對應的AUC值分別如圖3-4、圖3-5、圖3-6所示。圖3-4當乳腺癌患者PI選取中位數時的ROC曲線和AUC值圖3-5當乳腺癌患者PI選取平均數時的ROC曲線和AUC值圖3-6當乳腺癌患者PI選取眾數時的ROC曲線和AUC值乳腺癌患....

本文編號：3907570