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小麥不同器官/發(fā)育時(shí)期miRNA和tasiRNA的鑒定及其時(shí)空表達(dá)特征分析

發(fā)布時(shí)間:2024-02-20 05:02
  小麥?zhǔn)侵匾募Z食作物之一,小麥的生產(chǎn)及小麥的產(chǎn)量和品質(zhì)關(guān)系到世界糧食安全問(wèn)題。小麥種子的形成和發(fā)育直接影響著小麥產(chǎn)量和品質(zhì)。microRNA(miRNA)是近年來(lái)發(fā)現(xiàn)的真核生物體內(nèi)普遍存在的一類具有重要調(diào)控功能的非編碼小分子RNA(sRNA),其大小在20-25nt之間。大量研究發(fā)現(xiàn)miRNA參與基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控;在植物的生長(zhǎng)、發(fā)育和逆境脅迫應(yīng)答等各種生物學(xué)過(guò)程中發(fā)揮重要的調(diào)節(jié)作用。迄今,植物miRNA的研究已經(jīng)取得了很大進(jìn)展; miRBase數(shù)據(jù)庫(kù)(Release21, June2014;http://www.mirbase.org)中登錄注冊(cè)的植物成熟miRNA已有10892條;其中的絕大多數(shù)miRNA都是來(lái)自于全基因組序列已知的水稻(713條)、楊樹(shù)(401條)、擬南芥(427條)、二穗短柄草(525條)、玉米(321條)等物種。關(guān)于miRNA在植物種子發(fā)育中的調(diào)控作用已在水稻、擬南芥、玉米、大麥等物種展開(kāi)研究。相比之下,小麥染色體組復(fù)雜,基因組龐大,全基因組序列組裝尚待完成;小麥中鑒定出的miRNA數(shù)量非常有限,在miRBase中登錄注冊(cè)的小麥miRNA僅有119條。因此,小麥m...

【文章頁(yè)數(shù)】:127 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【部分圖文】:

圖1-1植物中miRNA的合成途徑(OlivierVoinnet,2009)

圖1-1植物中miRNA的合成途徑(OlivierVoinnet,2009)

大部分的植物miRNA在基因組上具有一個(gè)獨(dú)立的轉(zhuǎn)錄單元,在轉(zhuǎn)錄的過(guò)程中由一個(gè)轉(zhuǎn)錄單元可加工成多條miRNA。miRNA在植物體內(nèi)的生成是一個(gè)復(fù)雜的過(guò)程,有多種酶和功能蛋白參與。具體步驟見(jiàn)圖1-1。首先miRNA基因在RNA聚合酶(PolII)的作用下轉(zhuǎn)錄成一個(gè)或者多個(gè)較長(zhǎng)的初級(jí)轉(zhuǎn)....


圖1-2頸環(huán)引物RT-PCR的原理圖(Mucksteinetal.2006)

圖1-2頸環(huán)引物RT-PCR的原理圖(Mucksteinetal.2006)

并且比較了不同處理模關(guān)性。目前這種TaqMan標(biāo)記的頸環(huán)在利用頸環(huán)特異引物對(duì)番茄中的7體系對(duì)其進(jìn)行定量檢測(cè)。結(jié)果顯示用NA表達(dá)差異的檢測(cè),并且這種方法。T-PCR紹了對(duì)miRNA的3′端加多個(gè)A后AP)處理總RNA(圖1-3),使miR含有接頭序列的....


圖1-3polyAqRT-PCR的原理圖(ShiandChiang.2005)

圖1-3polyAqRT-PCR的原理圖(ShiandChiang.2005)

選取了5條小麥miRNA,包括miR159、miR166頸環(huán)引物RT-PCR和miRNA加尾RT-PCR兩種試的5個(gè)發(fā)育時(shí)期(幼苗、旗葉,花后5天籽粒。1兩種實(shí)時(shí)定量結(jié)果分別于高通量測(cè)序的結(jié)果進(jìn)行比合高通量分析植物miRNA的表達(dá)譜。該研究首次對(duì)....


圖1-45

圖1-45'RLM-RACE流程圖(Wangetal.,2004b)

的,所以利用生物信息學(xué)預(yù)測(cè)植物miRNAs的靶標(biāo)是相對(duì)比較直接究者們已設(shè)計(jì)了多種預(yù)測(cè)軟件,主要包括TargetFinder(http://jcclate.edu/node),PatScan,miRU(http://bioinfo3.noble.org/miRU.htm....



本文編號(hào):3903881

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