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小麥不同器官/發(fā)育時期miRNA和tasiRNA的鑒定及其時空表達特征分析

發(fā)布時間:2024-02-20 05:02
  小麥是重要的糧食作物之一,小麥的生產(chǎn)及小麥的產(chǎn)量和品質(zhì)關(guān)系到世界糧食安全問題。小麥種子的形成和發(fā)育直接影響著小麥產(chǎn)量和品質(zhì)。microRNA(miRNA)是近年來發(fā)現(xiàn)的真核生物體內(nèi)普遍存在的一類具有重要調(diào)控功能的非編碼小分子RNA(sRNA),其大小在20-25nt之間。大量研究發(fā)現(xiàn)miRNA參與基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控;在植物的生長、發(fā)育和逆境脅迫應答等各種生物學過程中發(fā)揮重要的調(diào)節(jié)作用。迄今,植物miRNA的研究已經(jīng)取得了很大進展; miRBase數(shù)據(jù)庫(Release21, June2014;http://www.mirbase.org)中登錄注冊的植物成熟miRNA已有10892條;其中的絕大多數(shù)miRNA都是來自于全基因組序列已知的水稻(713條)、楊樹(401條)、擬南芥(427條)、二穗短柄草(525條)、玉米(321條)等物種。關(guān)于miRNA在植物種子發(fā)育中的調(diào)控作用已在水稻、擬南芥、玉米、大麥等物種展開研究。相比之下,小麥染色體組復雜,基因組龐大,全基因組序列組裝尚待完成;小麥中鑒定出的miRNA數(shù)量非常有限,在miRBase中登錄注冊的小麥miRNA僅有119條。因此,小麥m...

【文章頁數(shù)】:127 頁

【學位級別】:博士

【部分圖文】:

圖1-1植物中miRNA的合成途徑(OlivierVoinnet,2009)

圖1-1植物中miRNA的合成途徑(OlivierVoinnet,2009)

大部分的植物miRNA在基因組上具有一個獨立的轉(zhuǎn)錄單元,在轉(zhuǎn)錄的過程中由一個轉(zhuǎn)錄單元可加工成多條miRNA。miRNA在植物體內(nèi)的生成是一個復雜的過程,有多種酶和功能蛋白參與。具體步驟見圖1-1。首先miRNA基因在RNA聚合酶(PolII)的作用下轉(zhuǎn)錄成一個或者多個較長的初級轉(zhuǎn)....


圖1-2頸環(huán)引物RT-PCR的原理圖(Mucksteinetal.2006)

圖1-2頸環(huán)引物RT-PCR的原理圖(Mucksteinetal.2006)

并且比較了不同處理模關(guān)性。目前這種TaqMan標記的頸環(huán)在利用頸環(huán)特異引物對番茄中的7體系對其進行定量檢測。結(jié)果顯示用NA表達差異的檢測,并且這種方法。T-PCR紹了對miRNA的3′端加多個A后AP)處理總RNA(圖1-3),使miR含有接頭序列的....


圖1-3polyAqRT-PCR的原理圖(ShiandChiang.2005)

圖1-3polyAqRT-PCR的原理圖(ShiandChiang.2005)

選取了5條小麥miRNA,包括miR159、miR166頸環(huán)引物RT-PCR和miRNA加尾RT-PCR兩種試的5個發(fā)育時期(幼苗、旗葉,花后5天籽粒。1兩種實時定量結(jié)果分別于高通量測序的結(jié)果進行比合高通量分析植物miRNA的表達譜。該研究首次對....


圖1-45

圖1-45'RLM-RACE流程圖(Wangetal.,2004b)

的,所以利用生物信息學預測植物miRNAs的靶標是相對比較直接究者們已設計了多種預測軟件,主要包括TargetFinder(http://jcclate.edu/node),PatScan,miRU(http://bioinfo3.noble.org/miRU.htm....



本文編號:3903881

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