寄主miRNAs調(diào)控小麥與條銹菌互作的分子機(jī)理
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【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1-2降解組測序原理
年來出現(xiàn)了一種新的驗(yàn)證miRNAs祀標(biāo)基因的方法,稱之為降解組測序(DegradomeSequencing)。降解組測序的原理(圖1-2)是植物體內(nèi)絕大多數(shù)miRNAs利用剪切作用調(diào)控靴標(biāo)基因。祀標(biāo)基因經(jīng)剪切分為兩部分,5’和3’片段。其中3’剪切片段包含有自由的5’單磷酸和3....
圖2-1smallRNA在PAGE膠板上的位置
圖2-1smallRNA在PAGE膠板上的位置Fig.2-1ThepositionofsmallRNAonPAGE(16)添加三倍樣品體積的預(yù)冷無水乙醇,置于-2(rc中沉淀過夜。(17) 4°C13000rpm離心15min,離心沉淀小分子RNAs。(....
圖2-7PC-442的前體結(jié)構(gòu)
中的miRNA匹配上。我們分別對不同時(shí)期數(shù)據(jù)庫中的序列進(jìn)行了進(jìn)一步的分析。在沒有核苷酸錯(cuò)配的情況下,我們將測序結(jié)果分別與小麥已知基因組數(shù)據(jù)庫(ftp://ftp.plantgdb.org/download/Genomes/TaGDB/TAbacl75.bz2)進(jìn)行了比對。在....
圖2-10利用microarray鑒定參與成株期興資應(yīng)答條繡菌反應(yīng)的miRNAsFig.2-10IdentificationofnovelmiRNAsinadultXingzi9104responsetoPstbymicroarrayA:control;B:test
為了進(jìn)一步驗(yàn)證參與成株期抗性的miRNAs,我們利用microarray技術(shù),分析了420個(gè)小麥特異的miRNA在成株期對照和接種24小時(shí)后的表達(dá)情況。如圖2-10所示,夕卜參基因(MC1-3)表達(dá)穩(wěn)定,說明該系統(tǒng)可以用于分析miRNAs的表達(dá)。另外,大部分探針未雜交產(chǎn)生信號,....
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