電子病歷信息提取及其在腫瘤分期預(yù)測(cè)上的應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2023-03-18 14:56
在當(dāng)下這個(gè)高度信息化的時(shí)代,醫(yī)療信息化建設(shè)得到了快速發(fā)展,隨之產(chǎn)生的各類(lèi)臨床數(shù)據(jù)也與日俱增,尤其是電子病歷。遺憾的是,電子病歷中非結(jié)構(gòu)化的文本這種寶貴的醫(yī)療數(shù)據(jù)并沒(méi)有得到充分的分析與利用,這無(wú)疑造成了嚴(yán)重的數(shù)據(jù)浪費(fèi)。食管癌是中國(guó)常見(jiàn)的高發(fā)惡性腫瘤之一,其發(fā)病率和死亡分別列全部惡性腫瘤的第六位和第四位,給我國(guó)的居民生命健康和生活質(zhì)量帶來(lái)了嚴(yán)重的影響。以上這些現(xiàn)狀給醫(yī)學(xué)信息化發(fā)展提出了一個(gè)新的挑戰(zhàn):針對(duì)食管癌患者,面對(duì)龐大的電子病歷數(shù)據(jù),如何對(duì)其進(jìn)行充分的處理、利用?解決這一問(wèn)題,不僅可以提升電子病歷的存儲(chǔ)質(zhì)量和管理效率,而且可以用于支持醫(yī)療人員的相關(guān)研究,以及服務(wù)于患者的健康狀況建模和個(gè)性化輔助醫(yī)療等。因此,這一問(wèn)題引出了本文面向食管癌電子病歷文本數(shù)據(jù)知識(shí)挖掘這一研究課題。本文力圖實(shí)現(xiàn)一套從文本信息提取到癌癥分期預(yù)測(cè)建模的食管癌電子病歷數(shù)據(jù)挖掘系統(tǒng)。在這一基本目標(biāo)下,本文主要開(kāi)展了以下研究工作:(1)設(shè)計(jì)了一種文本序列標(biāo)注工具。根據(jù)本文的應(yīng)用場(chǎng)景和需求,通過(guò)預(yù)定義食管癌醫(yī)學(xué)實(shí)體類(lèi)型與標(biāo)注規(guī)范,開(kāi)發(fā)了電子病歷文本序列標(biāo)注工具,為醫(yī)療實(shí)體識(shí)別等任務(wù)提供了基礎(chǔ)數(shù)據(jù)支持。(2)提出了一種流水線(xiàn)式...
【文章頁(yè)數(shù)】:72 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 緒論
1.1 研究背景及意義
1.1.1 課題研究背景
1.1.2 課題研究意義
1.2 國(guó)內(nèi)外研究現(xiàn)狀
1.2.1 面向電子病歷的信息抽取
1.2.2 基于電子病歷的癌癥分期預(yù)測(cè)
1.3 論文主要工作及結(jié)構(gòu)
1.3.1 主要研究?jī)?nèi)容
1.3.2 全文組織結(jié)構(gòu)
第二章 數(shù)據(jù)來(lái)源及數(shù)據(jù)預(yù)處理
2.1 數(shù)據(jù)來(lái)源及數(shù)據(jù)特點(diǎn)
2.1.1 數(shù)據(jù)來(lái)源
2.1.2 電子病歷文本特點(diǎn)
2.2 數(shù)據(jù)預(yù)處理
2.2.1 基于規(guī)則的長(zhǎng)文本分割
2.2.2 定義實(shí)體類(lèi)型與序列標(biāo)注規(guī)范
2.2.3 序列標(biāo)注工具
2.3 本章小結(jié)
第三章 信息抽取與圖譜可視化
3.1 基于CRF的食管癌醫(yī)療實(shí)體識(shí)別
3.1.1 條件隨機(jī)場(chǎng)模型
3.1.2 條件隨機(jī)場(chǎng)建模
3.1.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
3.2 基于規(guī)則的實(shí)體關(guān)系抽取
3.2.1 實(shí)體關(guān)系定義
3.2.2 基于規(guī)則的關(guān)系抽取
3.3 構(gòu)建圖譜可視化系統(tǒng)
3.3.1 系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)
第四章 基于FNT的食管癌分期預(yù)測(cè)建模
4.1 柔性神經(jīng)樹(shù)
4.2 FNT模型優(yōu)化
4.2.1 樹(shù)結(jié)構(gòu)優(yōu)化
4.2.2 參數(shù)優(yōu)化
4.3 基于浮動(dòng)質(zhì)心法的FNT分類(lèi)模型
4.3.1 浮動(dòng)質(zhì)心法
4.3.2 優(yōu)化目標(biāo)函數(shù)
4.3.3 用戶(hù)定義參數(shù)總結(jié)
4.3.4 模型評(píng)估
4.4 食管癌臨床特征
4.5 實(shí)驗(yàn)設(shè)置與結(jié)果分析
4.5.1 數(shù)據(jù)集
4.5.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
4.5.3 分期預(yù)測(cè)可視化系統(tǒng)
4.6 本章小結(jié)
第五章 總結(jié)與展望
5.1 本文工作總結(jié)
5.2 未來(lái)工作展望
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄
本文編號(hào):3763344
【文章頁(yè)數(shù)】:72 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 緒論
1.1 研究背景及意義
1.1.1 課題研究背景
1.1.2 課題研究意義
1.2 國(guó)內(nèi)外研究現(xiàn)狀
1.2.1 面向電子病歷的信息抽取
1.2.2 基于電子病歷的癌癥分期預(yù)測(cè)
1.3 論文主要工作及結(jié)構(gòu)
1.3.1 主要研究?jī)?nèi)容
1.3.2 全文組織結(jié)構(gòu)
第二章 數(shù)據(jù)來(lái)源及數(shù)據(jù)預(yù)處理
2.1 數(shù)據(jù)來(lái)源及數(shù)據(jù)特點(diǎn)
2.1.1 數(shù)據(jù)來(lái)源
2.1.2 電子病歷文本特點(diǎn)
2.2 數(shù)據(jù)預(yù)處理
2.2.1 基于規(guī)則的長(zhǎng)文本分割
2.2.2 定義實(shí)體類(lèi)型與序列標(biāo)注規(guī)范
2.2.3 序列標(biāo)注工具
2.3 本章小結(jié)
第三章 信息抽取與圖譜可視化
3.1 基于CRF的食管癌醫(yī)療實(shí)體識(shí)別
3.1.1 條件隨機(jī)場(chǎng)模型
3.1.2 條件隨機(jī)場(chǎng)建模
3.1.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
3.2 基于規(guī)則的實(shí)體關(guān)系抽取
3.2.1 實(shí)體關(guān)系定義
3.2.2 基于規(guī)則的關(guān)系抽取
3.3 構(gòu)建圖譜可視化系統(tǒng)
3.3.1 系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)
第四章 基于FNT的食管癌分期預(yù)測(cè)建模
4.1 柔性神經(jīng)樹(shù)
4.2 FNT模型優(yōu)化
4.2.1 樹(shù)結(jié)構(gòu)優(yōu)化
4.2.2 參數(shù)優(yōu)化
4.3 基于浮動(dòng)質(zhì)心法的FNT分類(lèi)模型
4.3.1 浮動(dòng)質(zhì)心法
4.3.2 優(yōu)化目標(biāo)函數(shù)
4.3.3 用戶(hù)定義參數(shù)總結(jié)
4.3.4 模型評(píng)估
4.4 食管癌臨床特征
4.5 實(shí)驗(yàn)設(shè)置與結(jié)果分析
4.5.1 數(shù)據(jù)集
4.5.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
4.5.3 分期預(yù)測(cè)可視化系統(tǒng)
4.6 本章小結(jié)
第五章 總結(jié)與展望
5.1 本文工作總結(jié)
5.2 未來(lái)工作展望
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄
本文編號(hào):3763344
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