隨著人類基因組計劃的完成,基因芯片技術(shù)被廣泛應(yīng)用在科學(xué)研究的各個領(lǐng)域,也使生命科學(xué)進入了全基因組和大數(shù)據(jù)的時代。大量基于基因芯片技術(shù)獲得的基因表達數(shù)據(jù)在許多專業(yè)數(shù)據(jù)庫上有公開的存儲,這為基因表達數(shù)據(jù)的相關(guān)研究提供了必要的數(shù)據(jù)支撐。另一方面,癌癥作為對人類最致命的疾病之一,科學(xué)家和醫(yī)學(xué)工作者們始終致力于對癌癥早期診療的研究,基因芯片技術(shù)則為探究癌癥分子水平特征提供可能。當(dāng)今,胃癌已成為全球排名第四最普遍被診斷、死亡率排名第三的癌癥。因此對胃癌患者的基因表達數(shù)據(jù)進行特征選取,使用特征基因進行與患者臨床相關(guān)的數(shù)據(jù)分析是十分有價值的。本文在GDC平臺上的TCGA數(shù)據(jù)庫中下載了胃癌患者的基因表達數(shù)據(jù)和相應(yīng)的臨床數(shù)據(jù)。在對初始數(shù)據(jù)集進行整合與清洗后,采用了過濾與封裝相結(jié)合的特征選取方法來篩選特征基因。通過構(gòu)建分類模型檢驗了篩選的特征基因集能對樣本進行有效地分類。將特征基因集與胃癌患者臨床數(shù)據(jù)結(jié)合進行生存分析的結(jié)果,也顯示了該基因集中特征基因的表達量水平能顯著地影響胃癌患者的生存情況。本文的主要工作可以分為以下三個部分:1.胃癌特征基因的選取�；虮磉_數(shù)據(jù)具有有高維度、小樣本的特點,所以特征間常常會...

【文章頁數(shù)】：63 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
中文摘要
ABSTRACT
第1章 引言
    1.1 研究背景及意義
    1.2 國內(nèi)外研究綜述
    1.3 本文研究內(nèi)容
    1.4 本研究的優(yōu)勢與不足
第2章 TCGA數(shù)據(jù)庫與數(shù)據(jù)下載
    2.1 TCGA數(shù)據(jù)庫介紹
    2.2 TCGA數(shù)據(jù)下載
第3章 特征選擇方法介紹
    3.1 特征選擇概述
    3.2 本文篩選特征基因的主要方法
第4章 分類方法介紹
    4.1 分類方法概述
    4.2 支持向量機
    4.3 分類模型評價
第5章 生存分析介紹
    5.1 生存分析與生存函數(shù)
    5.2 生存分析相關(guān)模型
第6章 實證部分
    6.1 數(shù)據(jù)處理
    6.2 特征基因篩選
    6.3 特征基因結(jié)果對比討論
    6.4 基于特征基因的臨床數(shù)據(jù)分析
第7章 總結(jié)與展望
    7.1 總結(jié)
    7.2 展望
參考文獻
致謝



本文編號：3739912