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楊樹LRR-RLK基因家族的生物信息學(xué)分析及木材發(fā)育相關(guān)基因的克隆

發(fā)布時間:2022-01-04 12:58
  富含亮氨酸重復(fù)序列的類受體蛋白激酶(LRR-RLKs)參與植物生長發(fā)育及對環(huán)境刺激應(yīng)答反應(yīng)的多種信號傳導(dǎo)過程,在植物生命活動中發(fā)揮著重要功能。最新研究表明,LRR-RLKs在植物多種分生組織的形態(tài)建成及細(xì)胞分化過程中也承擔(dān)著關(guān)鍵的調(diào)控作用。本論文使用生物信息學(xué)研究手段,通過與擬南芥的LRR-RLKs遺傳資源相整合,在木本模式植物毛果楊中分離PtLRR-RLK基因家族,挖掘與木本植物楊樹中與次生維管組織形態(tài)建成及形成層分化相關(guān)的PtLRR-RLK基因,掌握其時空變化規(guī)律與表達(dá)調(diào)控機(jī)制。具體的方法是:在實驗過程中,通過242個擬南芥基因在楊樹數(shù)據(jù)庫中blastp查找出384個楊樹LRR-RLK基因,通過分析這個基因家族的遺傳進(jìn)化樹特征,用不同表達(dá)數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)繪制表達(dá)圖譜,整個在形成層、發(fā)育木質(zhì)部、發(fā)育韌皮部等特異部位高表達(dá)的基因共115個,并結(jié)合擬南芥中與發(fā)育功能相關(guān)的基因構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,預(yù)測楊樹基因的功能,并篩選出17個高表達(dá),且都在形成層和木質(zhì)部、韌皮部的基因,并且可能與次生維管組織形態(tài)建成及形成層分化相關(guān)的PtLRR-RLK基因,進(jìn)行cDNA克隆,構(gòu)建表達(dá)載體,為后期轉(zhuǎn)化楊樹,研究... 

【文章來源】:天津大學(xué)天津市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:78 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

楊樹LRR-RLK基因家族的生物信息學(xué)分析及木材發(fā)育相關(guān)基因的克隆


TDR-TDIF和PXY-CLE41復(fù)合過程

楊樹LRR-RLK基因家族的生物信息學(xué)分析及木材發(fā)育相關(guān)基因的克隆


楊樹LRR-RLK基因染色體定位圖

楊樹LRR-RLK基因家族的生物信息學(xué)分析及木材發(fā)育相關(guān)基因的克隆


楊樹LRR-RLK基因在染色體之間的Duplication結(jié)果

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]擬南芥維管組織的形態(tài)建成和分子調(diào)控[J]. 章艷麗,吳鴻.  植物生理學(xué)通訊. 2008(04)

碩士論文
[1]毛白楊次生維管系統(tǒng)再生過程中microRNA的表達(dá)分析[D]. 唐芳.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2009



本文編號:3568384

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